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문제 정의
- , 1998), 자치어기에 주둥이 앞으로 돌출된 부리 극을 가지고, 후측두골에 길게 발달된 극을 가진다(Leis and Carson-Ewart, 2000). 본 연구는 2019년 12월 한국 남해에서 Hoplolatilus속 치어 1개체가 처음 채집되어, 표본에 근거한 형태 및 분자적 특징을 상세히 기술하고 새로운 국명을 제안하고자 한다.
제안 방법
- Hoplolatilus속의 종들은 대부분 화려한 체색을 가져 새로운 국명으로 “무지개옥돔속”을, H. chlupatyi의 새로운 국명으로 “무지개옥돔”을 제안한다.
- 1 μL를 섞은 혼합물에 genomic DNA 1 μL를 첨가하고, 3차 증류수를 넣어 총 volume을 20 μL로 맞추었다. Thermal Cycler (Bio-Rad MJ mini PCT-1148, USA)으로 다음과 같은 조건으로 PCR을 수행하였다[Initial denaturation 95℃에서 5분; PCR reaction 35 cycles (denaturation 95℃에서 1분, annealing 52℃에서 1분, extension 72℃에서 1분); final extension 72℃에서 5분]. ABI PRISM 3730XL analyzer (96 capillary type)에서 BigDye (R) Terminator v3.
- 3%의 유전적 차이를 보였다. 본종의 새로운 국명으로 “무지개옥돔”을 제안한다.
- 채집된 치어 1개체의 우측 눈알을 떼어내어 Chelex 100 Resin (Bio-Rad, USA)을 이용하여 genomic DNA를 추출하였다. 중합효소 연쇄반응(Polymerase chain reaction, PCR)으로 미토콘드리아 DNA (mtDNA) Cytochrome c oxidase subunit I (COI) 영역을 증폭하였으며, Ward et al.
- 형태적으로 Hoplolatilus chlupatyi로 동정된 치어 1개체(PKUI 812)의 분자 검증을 위해 mtDNA COI 염기서열 420 base-pair를 얻어 NCBI에 등록된 Hoplolatilus속 어류 3종 및 옥돔(B. japonicus)과 비교하였다. PKUI 812는 필리핀산 H.
대상 데이터
- 2019년 12월 10일 한국 남해 111해구(33°45’05”N 126°43’55”E) 수심 128 m 정점에서 국립수산과학원 수산과학조사선(탐구22호, 1,458 톤) 봉고네트(망구 80 cm, 망목 550 μm)을 이용한 경사 채집에서 옥돔과 치어 1개체가 채집되었다(Fig. 1).
- PKUI 812, 1개체, 체장 5.23 mm, 2019년 12월 10일, 남해 111해구(33°45’05”N 126°43’55”E), 표층(20.5℃, 34.4 psu), 저층(15.0℃, 34.5 psu), 국립수산과학원 탐구 22호, 봉고네트, 경사 채집.
- japonicus) and one outgroup (Leucopsarion petersii) were included in this analysis. The tree was constructed using the K2P model and 1,000 bootstrap replications. The bar presents a genetic distance.
- 3). 본 연구에서 사용된 한국산 H. chlupatyi 치어 1개체의 COI 염기서열은 NCBI에 등록하였다(등록번호, MT667358).
데이터처리
- 1 cycle sequencing kits (Applied Biosystems, USA)로 mtDNA COI 염기서열을 얻었다. BioEdit version 7 (Hall, 1999)에서 ClustalW multiple alignment (Thompson et al., 1994)로 염기서열을 정렬하였다. 유전거리는 MEGA X 프로그램(Kumar et al.
이론/모형
- , 1994)로 염기서열을 정렬하였다. 유전거리는 MEGA X 프로그램(Kumar et al., 2018)을 이용하여 kimura-2- parameter 모델(Kimura, 1980)로 계산하고 근린결합수(Neighbor joining tree)는 bootstrap을 1,000번 수행하여 작성했다.
- 채집된 치어 1개체의 우측 눈알을 떼어내어 Chelex 100 Resin (Bio-Rad, USA)을 이용하여 genomic DNA를 추출하였다. 중합효소 연쇄반응(Polymerase chain reaction, PCR)으로 미토콘드리아 DNA (mtDNA) Cytochrome c oxidase subunit I (COI) 영역을 증폭하였으며, Ward et al. (2005)가 설계한 universal primer를 사용하였다. 10X PCR buffer 2 μL, 2.
- 치어의 부위별 용어와 계수 및 계측은 Leis and Carson-Ewart (2000) 및 Okiyama (2014)를 참고하였고, 입체해부현미경(SZH-16, Olympus, Japan) 하에서 현미경용 사진촬영장치(Mosaic 2.0, Fuzhou Tucsen photonics, China)를 이용하여 0.01 mm 단위까지 측정하였다. 치어의 각 부위별 측정값은 체장(Standard length, SL)에 대한 비율(%)로 변환하여 나타내었다.
성능/효과
- 2019년 12월 한국 남해에서 봉고네트로 채집된 옥돔과 치어 1개체를 형태 분석한 결과, Hoplolatilus chlupatyi으로 확인되었다. 추가적으로 미토콘드리아 DNA COI 420 bp 염기서열을 분석한 결과, H.
- 2019년 12월 한국 남해에서 채집된 옥돔과 치어 1개체를 대상으로 형태 및 분자 분석을 수행한 결과, 국내에서 처음 보고되는 Hoplolatilus chlupatyi으로 확인되었다. 해당 종의 상위 분류군인 옥돔과 어류는 국내에서 옥돔속(Branchiostegus) 4종만 알려져 있었고, 이번에 보고되는 Hoplolatilus속은 국내에 처음 보고되는 속이다(MABIK, 2019).
- 8 mm 무렵에 지느러미가 정수에 도달한다고 하여 본 연구 결과와 유사한 결과를 보였다. H. chlupatyi는 같은 속에 속하는 H. cuniculus와 등지느러미 줄기 수와 뒷지느러미 줄기 수에서 차이를 보이며(H. chlupatyi 등지느러미 X, 13 뒷지느러미 II, 12 vs. H. cuniculus 등지느러미 III-V, 29-34 뒷지느러미 I, 19-20), 부리 극의 길이(H. chlupatyi 길다 vs. H. cuniculus 짧다), 후측두골과 전새개골에 발달된 극의 길이(H. chlupatyi 매우 길다 vs. H. cuniculus 짧다)로 잘 구분된다. 또한, 미토콘드리아 DNA COI 염기서열 분석에서도 필리핀 마닐라 지역 H.
- 199으로 구분되었다. 따라서, 본 연구에서 형태적으로 동정된 H. chlupatyi는 분자 분석에서도 같은 종임을 확인할 수 있었다(Fig. 3). 본 연구에서 사용된 한국산 H.
- cuniculus 짧다)로 잘 구분된다. 또한, 미토콘드리아 DNA COI 염기서열 분석에서도 필리핀 마닐라 지역 H. chlupatyi 성어와 잘 일치하여 형태 동정 결과를 지지해주었으며, 같은 속의 H. cuniculus와는 22.3%의 유전적 차이를 나타내어 잘 구분되었다. Hoplolatilus속의 종들은 대부분 화려한 체색을 가져 새로운 국명으로 “무지개옥돔속”을, H.
- 본 연구에서 관찰한 H. chlupatyi 치어는 Okiyama(2014)의 동일 종의 후기 자어(체장 4.5 mm)와 형태 및 흑색소포 분포에서 잘 일치하였다. 나아가 Okiyama (2014)는 이 종이 체장 5.
- 2019년 12월 한국 남해에서 봉고네트로 채집된 옥돔과 치어 1개체를 형태 분석한 결과, Hoplolatilus chlupatyi으로 확인되었다. 추가적으로 미토콘드리아 DNA COI 420 bp 염기서열을 분석한 결과, H. chlupatyi 성어와 99.5% 일치하였고, 같은 속의 H. cuniculus와는 22.3%의 유전적 차이를 보였다. 본종의 새로운 국명으로 “무지개옥돔”을 제안한다.
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