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수입 냉동새우에서 검출된 WSSV의 유전학적 근연관계 조사
Genetic relatedness of white spot syndrome virus (WSSV) from imported frozen shrimp
원문보기
韓國魚病學會誌= Journal of fish pathology, v.34 no.2, 2021년, pp.141 - 147
최소원 (부경대학교 수산생명의학과) , 백은진 (부경대학교 수산생명의학과) , 최지영 (부경대학교 수산생명의학과) , 태원준 (부경대학교 수산생명의학과) , 김형순 (부경대학교 수산생명의학과) , 박우성 (부경대학교 수산생명의학과) , 김민재 (부경대학교 수산생명의학과) , 김광일 (부경대학교 수산생명의학과)
초록
본 연구에서는 주요 새우 생산 국가에서 2017년 7월부터 2020년 11월 사이 생산되어 국내로 수입된 냉동 새우(29개 그룹)를 대상으로 흰반점바이러스(WSSV), covert mortality nodavirus (CMNV) 및 decapod iridescent virus 1 (DIV-1)의 검출여부를 조사하였다. 각 바이러스에 대한 nested PCR 결과, WSSV는 9개 그룹(9/29)에서 검출되었으며 CMNV와 DIV-1은 검출되지 않았다. Nested PCR에서 WSSV 양성으로 확인된 시료를 대상으로 WSSV genome variable loci로 알려진 VR 14/15 region에 대해 참조 서열들과 삽입/결손(insertion and deletion) 서열 비교 및 근연관계를 분석하였다. WSSV 양성 시료 중 1개 시료(20-CH-1 isolate, 2020년 10월 중국 생산)에서만 VR 14/15에 대한 PCR amplicon이 생성되었으며 염기서열 분석 결과, 20-CH-1 isolate는 2005년 인도에서 보고된 WSSV-IN-05-01과 99.84%의 상동성을 보였다. 이는 과거 알려진 바와 같이 새우의 교역을 통한 국가 간 WSSV가 확산되었음을 뒷받침해주는 결과이다.
Abstract
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In this study, of the imported shrimps between 2017 and 2020, we investigated white spot syndrome virus (WSSV), covert mortality nodavirus (CMNV) and decapod iridescent virus 1 (DIV-1). Of the imported shrimps (a total of 29 groups), WSSV was detected as 31% (9/29) by nested PCR assay. And CMNV and ...
주제어
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