$\require{mediawiki-texvc}$

연합인증

연합인증 가입 기관의 연구자들은 소속기관의 인증정보(ID와 암호)를 이용해 다른 대학, 연구기관, 서비스 공급자의 다양한 온라인 자원과 연구 데이터를 이용할 수 있습니다.

이는 여행자가 자국에서 발행 받은 여권으로 세계 각국을 자유롭게 여행할 수 있는 것과 같습니다.

연합인증으로 이용이 가능한 서비스는 NTIS, DataON, Edison, Kafe, Webinar 등이 있습니다.

한번의 인증절차만으로 연합인증 가입 서비스에 추가 로그인 없이 이용이 가능합니다.

다만, 연합인증을 위해서는 최초 1회만 인증 절차가 필요합니다. (회원이 아닐 경우 회원 가입이 필요합니다.)

연합인증 절차는 다음과 같습니다.

최초이용시에는
ScienceON에 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 로그인 (본인 확인 또는 회원가입) → 서비스 이용

그 이후에는
ScienceON 로그인 → 연합인증 서비스 접속 → 서비스 이용

연합인증을 활용하시면 KISTI가 제공하는 다양한 서비스를 편리하게 이용하실 수 있습니다.

미호강 수계 생물막의 환경유전자를 이용한 담수해파리 (Craspedacusta sowerbii Lankester, 1880) 유전자 탐색
Detection of Freshwater Jellyfish (Craspedacusta sowerbii Lankester, 1880) by Biofilm eDNA in Miho River Watershed 원문보기

생태와 환경 = Korean journal of ecology and environment, v.56 no.3, 2023년, pp.250 - 258  

김건희 (건국대학교 휴먼앤에코케어센터) ,  조현진 (건국대학교 휴먼앤에코케어센터) ,  김정희 (주식회사 에코리서치) ,  양윤모 (국립환경과학원 금강물환경연구소) ,  주현지 (국립환경과학원 금강물환경연구소) ,  정현기 (국립환경과학원 금강물환경연구소)

초록
AI-Helper 아이콘AI-Helper

담수해파리는 담수에서만 발견되는 해파리로써 다양성은 낮지만 전 세계적으로 보고 되고있다. 하지만 이들의 생태 및 발생 원인에 대해서는 정확하게 밝혀진 바가 없다. 따라서 모니터링을 통해 유생에서 폴립(polyp)단계를 통해 성장하는 담수해파리의 분포를 파악하는 것은 이들의 생태를 이해하는 데 중요하다. 본 연구는 미호강 수계 생물막(biofilm)의 환경유전자(eDNA)를 이용하여 담수해파리의 COI 유전자를 탐색하고 환경유전자를 이용한 담수해파리 탐색 가능성을 확인하고자 하였다. 미호강 수계 내 12개 지점 중 8개 지점에서 담수해파리 유전자가 확인되었으며, 대부분 상류에 저수지가 위치한 특성을 보였다. 이들 유전자는 대표적인 담수해파리로 알려진 소워비꽃모자해파리(Craspedacusta sowerbii)의 유전자로 확인되었으며 미호강 조사 지점에서 발견된 C. sowerbii는 이탈리아에서 발견된 종과 같은 계통이었다. 결과적으로 생물막의 환경유전자를 이용한 담수해파리 유전자 탐색방법은 담수해파리 출현 가능성이 높은 지역을 선택적으로 빠르게 선별(screening)할 수 있으며 이는 국내 담수해파리의 분포와 발생기작을 이해하는 데 중요한 단서를 제공할 수 있을 것으로 판단된다.

Abstract ▼ AI-Helper 아이콘AI-Helper

Freshwater jellyfish, a type of jellyfish exclusively found in freshwater, has a limited number of species but is found globally. However, their ecology and causes of occurrence are largely unknown. Therefore, understanding the distribution of polyps, which produce the larvae of freshwater jellyfish...

주제어

#Miho River   #biofilm eDNA   #freshwater jellyfish   #Craspedacusta sowerbii   #polyp  

참고문헌 (59)

  1. Acker, T.S. and A.M. Muscat. 1976. The ecology of Craspedacusta sowerbii Lankester, a freshwater hydrozoan. American Midland Naturalist. pp. 323-336. 

  2. Anderson, D. 1998. Introduction to arthropods, Oxford University？Press, Oxford. 

  3. Angradi, T.R. 1998. Observations of freshwater jellyfish, Craspedacusta sowerbyi Lankester (Trachylina: Petasidae), in a？West Virginia reservoir. Brimleyana. pp. 34-42. 

  4. Arbaciauskas, K. and J. Lesutiene. 2005. The freshwater jellyfish？(Craspedacusta sowerbii) in Lithuanian waters. Acta Zoologica Lituanica 15: 54-57. 

    상세보기

  5. Bista, I., G.R. Carvalho, M. Tang, K. Walsh, X. Zhou, M. Hajibabaei, S. Shokralla, M. Seymour, D. Bradley and S. Liu. 2018. Performance of amplicon and shotgun sequencing？for accurate biomass estimation in invertebrate community？samples. Molecular Ecology Resources 18: 1020-1034. 

    상세보기

  6. Boothroyd, I.K., M.K. Etheredge and J.D. Green. 2002. Spatial？distribution, size structure, and prey of Craspedacusta？sowerbyi Lankester in a shallow New Zealand lake. Hydrobiologia 468: 23-32. 

    상세보기

  7. De Kluijver, M. and R. Leewis. 1994. Changes in the sublittoral？hard substrate communities in the Oosterschelde estuary？(SW Netherlands), caused by changes in the environmental？parameters. The Oosterschelde Estuary (The Netherlands):？a case-study of a changing ecosystem. pp. 265-280. 

  8. DeVries, D.R. 1992. The freshwater jellyfish Craspedacusta sowerbyi: a summary of its life history, ecology, and distribution. Journal of Freshwater Ecology 7: 7-16. 

  9. Dodson, S.I. and S.D. Cooper. 1983. Trophic relationships of the？freshwater jellyfish Craspedacusta sowerbyi Lankester 1880. Limnology and Oceanography 28: 345-351. 

  10. Duggan, I.C. and K.R. Eastwood. 2012. Detection and distribution of Craspedacusta sowerbii: observations of medusae？are not enough. Aquatic Invations 7: 271-275. 

  11. Dumont, H.J. 1994. The distribution and ecology of the fresh-and？brackish-water medusae of the world. Studies on the ecology？of tropical zooplankton. pp. 1-12. 

  12. Elbrecht, V. and F. Leese. 2015. Can DNA-based ecosystem assessments quantify species abundance? Testing primer bias and？biomass-sequence relationships with an innovative metabarcoding protocol. PLoS One 10: e0130324. 

    상세보기

  13. Elbrecht, V. and F. Leese. 2017. Validation and development of？COI metabarcoding primers for freshwater macroinvertebrate bioassessment. Frontiers in Environmental Science 5: 11. 

    상세보기

  14. Fuentes, R., L. Cardenas, A. Abarzua and L. Caputo. 2019. Southward invasion of Craspedacusta sowerbii across mesotrophic lakes in Chile: geographical distribution and genetic？diversity of the medusa phase. Freshwater Science 38: 193-202. 

    상세보기

  15. Galarce, L.C., K.V. Riquelme, D.Y. Osman and R.A. Fuentes. 2013. A new record of the non indigenous freshwater jellyfish Craspedacusta sowerbii Lankester, 1880 (Cnidaria) in？Northern Patagonia (40 S, Chile). BioInvasions Records 2:？263-270. 

  16. Illumina. 2020. Illumina DNA Prep reference guide (10000000？25416), Illumina, Inc. San Diego, CA. 

  17. Jang, T. 2018. Hyodon stream freshwater jellyfish, who exactly are？you? Seogwipo Newspaper, http://www.seogwipo.co.kr/news/articleView.html?idxno150997. 

  18. Jankowski, T. 2001. The freshwater medusae of the world - a taxonomic and systematic literature study with some remarks？on other inland water jellyfish. Hydrobiologia 462: 91-113. 

    상세보기

  19. Jankowski, T., A.G. Collins and R. Campbell. 2008. Global diversity of inland water cnidarians. Freshwater Animal Diversity？Assessment. pp. 35-40. 

  20. Jankowski, T., T. Strauss and H.T. Ratte. 2005. Trophic interactions of the freshwater jellyfish Craspedacusta sowerbii.？Journal of Plankton Research 27: 811-823. 

    상세보기

  21. Karaouzas, I., S. Zogaris, M. Lopes-Lima, E. Froufe, S. Varandas,？A. Teixeira and R. Sousa. 2015. First record of the freshwater？jellyfish Craspedacusta sowerbii Lankester, 1880 in Greece？suggests distinct European invasion events. Limnology？16: 171-177. 

    상세보기

  22. Kayal, E., B. Roure, H. Philippe, A.G. Collins and D.V. Lavrov. 2013. Cnidarian phylogenetic relationships as revealed by？mitogenomics. BMC Evolutionary Biology 13: 1-18. 

  23. Kozuharov, D., R. Kalchev, M. Beshkova, M. Stanachkova, L.？Kenderov, V. Vasilev and T. Trichkova. 2017. Occurrence？of the alien freshwater jellyfish Craspedacusta sowerbii？Lankester, 1880 (Cnidaria: Hydrozoa) in some Bulgarian？reservoirs. Acta Zoologica Bulgarica. pp. 67-72. 

  24. Kramp, P.L. 1961. Synopsis of the medusae of the world. Journal？of the Marine Biological Association of the United Kingdom？40: 7-382. 

    상세보기

  25. Lankester, E.R. 1880. On a new jelly-fish of the order Trachomedusae, living in fresh water. Science. 34p. 

  26. Lee, J. 2021. Unfamiliarly named 'freshwater jellyfish' found in？large quantities... "Concerns about ecosystem disturbance".？KBS News, https://news.kbs.co.kr/news/view.do?ncd5284174. 

  27. Lee, T. 1996. A study on the aquatic ecosystem changes in dam？reservoir(2nd year), Kwater research center, Kwater. 

  28. Lengkeek, W., J. Coolen, A. Gittenberger and N. Schrieken. 2013.？Ecological relevance of shipwrecks in the North Sea. Nederlandse Faunistische Mededelingen 41: 49-57. 

  29. Leray, M., J.Y. Yang, C.P. Meyer, S.C. Mills, N. Agudelo, V. Ranwez, J.T. Boehm and R.J. Machida. 2013. A new versatile？primer set targeting a short fragment of the mitochondrial？COI region for metabarcoding metazoan diversity: application for characterizing coral reef fish gut contents. Frontiers？in Zoology 10: 1-14. 

  30. Lucas, C.H., W.M. Graham and C. Widmer. 2012. Jellyfish life？histories: role of polyps in forming and maintaining scyphomedusa populations. Advances in Marine Biology 63:？133-196. 

    상세보기

  31. Lucas, K., S.P. Colin, J.H. Costello, K. Katija and E. Klos. 2013.？Fluid interactions that enable stealth predation by the upstream-foraging hydromedusa Craspedacusta sowerbyi.？The Biological Bulletin 225: 60-70. 

    상세보기

  32. Marchessaux, G., F. Luskow, G. Sara and E.A. Pakhomov. 2021.？Predicting the current and future global distribution of the？invasive freshwater hydrozoan Craspedacusta sowerbii.？Scientific Reports 11: 23099. 

    상세보기

  33. McKercher, E., D. O'Connell, P. Fuller, J. Liebig, J. Larson, T.？Makled, A. Fusaro and W. Daniel. 2017. Craspedacusta？sowerbyi Lankester, 1880: US Geological Survey, Nonindigenous Aquatic Species Database. Gainesville, Florida,？USA. 

  34. Meyling, A.G., I. van Lente, N. Schrieken, A. Gitteberger and R.？de Bruyne. 2014. Het Duiken Gebruiken 3. Gegevensanalyse van het Monitoringproject Onderwater Oever (MOO):？Fauna-onderzoek met sportduikers in de Oosterschelde en？de Grevelingen. Periode 1994 t/m 2012. 

  35. Minamoto, T., M. Miya, T. Sado, S. Seino, H. Doi, M. Kondoh, K.？Nakamura, T. Takahara, S. Yamamoto and H. Yamanaka. 2021. An illustrated manual for environmental DNA research: Water sampling guidelines and experimental protocols. Environmental DNA 3: 8-13. 

    상세보기

  36. Moreno-Leon, M.A. and A. Ortega-Rubio. 2009. First record of？Craspedacusta sowerbyi Lankester, 1880 (Cnidaria: Limnomedusae: Olindiidae) in Mexico (Adolfo Lopez Mateos reservoir), with notes on their feeding habits and limnological？dates. Biological Invasions 11: 1827-1834. 

  37. Murali, A., A. Bhargava and E.S. Wright. 2018. IDTAXA: a novel？approach for accurate taxonomic classification of microbiome sequences. Microbiome 6: 1-14. 

  38. NIER. 2019. Guidelines for Aquatic Ecosystem Assessment and？Health Evaluation Methods, National Instiute of Environmental Research, Incheon, Republic of Korea. 

  39. Ozbek, M. and H. Somek. 2020. Invasive freshwater jellyfish？Craspedacusta sowerbii (Lankester, 1880) in Turkey: New？locality record and habitat limnoecology, with an overview？of distributional data in the Middle East and Balkans. Acta？Aquatica Turcica 16: 487-497. 

    상세보기

  40. Peard, T. 2002. Freshwater Jellyfish! Indiana University of Pennsylvania, Indiana, PA. 25pp. 

  41. Pennak, R.W. 1989. Fresh-water invertebrates of the United States.？Wiley, 

  42. Quast, C., E. Pruesse, P. Yilmaz, J. Gerken, T. Schweer, P. Yarza,？J. Peplies and F.O. Glockner. 2012. The SILVA ribosomal？RNA gene database project: improved data processing and？web-based tools. Nucleic Acids Research 41: D590-D596. 

  43. Riyas, A. and A. Kumar. 2017. Record of freshwater jellyfish？blooms of invasive Craspedacusta sowerbii Lankester, 1880？(Hydrozoa, Limnomedusae) from Kerala, India. Journal？of Aquatic Biology, Fisheries 5: 154-159. 

  44. Salonen, K., P. Hogmander, V. Langenberg, H. Molsa, J. Sarvala,？A. Tarvainen and M. Tiirola. 2012. Limnocnida tanganyicae？medusae (Cnidaria: Hydrozoa): a semiautonomous microcosm in the food web of Lake Tanganyika. Hydrobiologia？690: 97-112. 

    상세보기

  45. Salter, I. 2018. Seasonal variability in the persistence of dissolved？environmental DNA (eDNA) in a marine system: The role？of microbial nutrient limitation. PLoS One 13: e0192409. 

    상세보기

  46. Sandy, E. and P. Terry. 2014. Aquatic Invasive Species Monitoring？Training Materials, Paul Skawinski, Citizen Lake Monitoring Network Educator, University of Wisconsin. 

  47. Schrieken, N., A. Gittenberger, J. Coolen and W. Lengkeek. 2013.？Marine fauna of hard substrata of the Cleaver Bank and？Dogger Bank. Nederlandse Faunistische Mededelingen 41:？69-78. 

  48. Silva, W.M. and K.F. Roche. 2007. Occurrence of the freshwater？jellyfish Craspedacusta sowerbii(Lankester, 1880)(Hydrozoa, Limnomedusae) in a calcareous lake in Mato Grosso？do Sul, Brazil. Biota Neotropica 7: 227-230. 

    상세보기

  49. Slobodkin, L. and P. Bossert. 1991. The Freshwater Cnidaria or？Coelenterates in Ecology and Classification of North American Freshwater Invetebrates, JH Thorp and AP Covich？(edt). Academic Press, Inc. San Diego, USA. 

  50. Smith, A.S. and J.E. Alexander Jr. 2008. Potential effects of the？freshwater jellyfish Craspedacusta sowerbii on zooplankton？community abundance. Journal of Plankton Research 30:？1323-1327. 

    상세보기

  51. Spadinger, R. and G. Maier. 1999. Prey selection and diel feeding？of the freshwater jellyfish, Craspedacusta sowerbyi. Freshwater Biology 41: 567-573. 

  52. Stecher, G., K. Tamura and S. Kumar. 2020. Molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) for macOS. Molecular？Biology and Evolution 37: 1237-1239. 

    상세보기

  53. Stefani, F., B. Leoni, A. Marieni and L. Garibaldi. 2010. A new record of Craspedacusta sowerbii, Lankester 1880 (Cnidaria,？Limnomedusae) in northern Italy. Journal of Limnology 69: 189. 

    상세보기

  54. Tamura, K. and M. Nei 1993. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial？DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and？Evolution 10: 512-526. 

    상세보기

  55. Tamura, K., G. Stecher and S. Kumar. 2021. MEGA11: molecular？evolutionary genetics analysis version 11. Molecular Biology？and Evolution 38: 3022-3027. 

    상세보기

  56. Tittizer, T., F. Scholl, M. Banning, A. Haybach and M. Schleuter. 2000. Aquatische Neozoen im Makrozoobenthos der Binnenwasserstrassen Deutschland. Mauch, Germany. 

  57. Won, Y. 2018. Mass discovery of algal bloom and freshwater？jellyfish in Andong's Imha Lake. Kyungbook Newspaper,？http://www.kbsm.net/news/view.php?idx214768. 

  58. Zienkiewicz, L. 1940. Rasprostranenie presnovodnykh i slonovatovodnykh kishechnopolostnykh. Zoologicheskii Zhurnal？19: 580-602. 

  59. Zulkefli, N.S., K.-H. Kim and S.-J. Hwang. 2019. Effects of microbial activity and environmental parameters on the degradation of extracellular environmental DNA from a eutrophic？lake. International Journal of Environmental Research and？Public Health 16: 3339. 

저자의 다른 논문 :

관련 콘텐츠

오픈액세스(OA) 유형

GOLD

오픈액세스 학술지에 출판된 논문

이 논문과 함께 이용한 콘텐츠

저작권 관리 안내
섹션별 컨텐츠 바로가기

AI-Helper ※ AI-Helper는 오픈소스 모델을 사용합니다.

AI-Helper 아이콘
AI-Helper
안녕하세요, AI-Helper입니다. 좌측 "선택된 텍스트"에서 텍스트를 선택하여 요약, 번역, 용어설명을 실행하세요.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.

선택된 텍스트

맨위로