[논문]Hepatitis C virus types 7, 8 and 9 should be classified as type 6 subtypes

Mizokami, M.; Gojobori, T.; Ohba, K.-i.; Ikeo, K.; Ge, X.-M.; Ohno, T.; Orito, E.; Lau, J.Y.N.

doi:10.1016/S0168-8278(96)80149-8

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[해외논문] Hepatitis C virus types 7, 8 and 9 should be classified as type 6 subtypes

Journal of hepatology : the journal of the European Association for the Study of the Liver, v.24 no.5, 1996년, pp.622 - 624

Mizokami, M. , Gojobori, T. , Ohba, K.-i. , Ikeo, K. , Ge, X.-M. , Ohno, T. , Orito, E. , Lau, J.Y.N.

Abstract ▼ AI-Helper

Tokita et al. reported the identification of hepatitis C virus type 7, 8 and 9 in Southeast Asia, based on the unweighed pair-group method with the artihmetic mean, a method that may not be appropriate when the nucleotide substitution rate is not constant over time. To determine more accurately the relationship of these proposed types 7, 8, and 9 with other types, a more appropriate approach, the neighbor-joining method, was applied to re-evaluate the phylogenetic relationship. A total of 660 HCV sequences, including the reported sequences, were collected from DNA databases. For every region, the nucleotide substitution rate was estimated by the 6-parameter method, and phylogenetic trees were constructed using the neighbor-joining method. The results of this analysis indicate that the newly proposed HCV types 7, 8 and 9 should be classified as type 6 subtypes. HCV type 6 appears to be diversified

참고문헌 (9)

Gastroenterology Mizokami 107 1181 1994 10.1016/0016-5085(94)90245-3 Molecular evolutionary medicine - its application to the study of hepatitis C virus

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Hepatology Simmonds 19 1321 1994 10.1002/hep.1840190538 A proposed system for the nomenclature of hepatitis C viral genotypes (correspondence)

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Hepatology Simmons 21 570 1995 10.1002/hep.1840210243 Variability of hepatitis C virus

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Proc Natl Acad Sci USA Tokita 91 11022 1994 10.1073/pnas.91.23.11022 Hepatitis C virus variants from Vietnam are classifiable into the seventh eight and ninth major genetic groups

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Nei 1987
Proc Natl Acad Sci USa Ogata 88 3391 1991 10.1073/pnas.88.8.3392 Nucleotide sequence and mutation rate of the H strain of hepatitis C virus

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Genetic drift of hepatitis C virus during a 8.2-year infection in a chimpanzee: variability and stability Okamoto 190 894 1992
J Mol Evol Gojobori 18 414 1982 10.1007/BF01840889 Estimation of avarage number of nucleotide substitutions when the rate of the substitution varies with nucleotide

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Mol Biol Evol Saitou 4 406 1987 The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees

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