[논문]Novel features of the XRN-family in Arabidopsis : Evidence that AtXRN4, one of several orthologs of nuclear Xrn2p/Rat1p, functions in the cytoplasm

Kastenmayer, J. P.; Green, P. J.

doi:10.1073/pnas.97.25.13985

[해외논문] Novel features of the XRN-family in Arabidopsis : Evidence that AtXRN4, one of several orthologs of nuclear Xrn2p/Rat1p, functions in the cytoplasm 원문보기

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v.97 no.25, 2000년, pp.13985 - 13990

Kastenmayer, J. P. (Michigan State University, Department of Energy Plant Research Laboratory, and Biochemistry Department, 322 Plant Biology Building, East Lansing, MI 48824-1312) , Green, P. J. (Michigan State University, Department of Energy Plant Research Laboratory, and Biochemistry Department, 322 Plant Biology Building, East Lansing, MI 48824-1312)

Abstract ▼ AI-Helper

The 5′-3′ exoribonucleases Xrn1p and Xrn2p/Rat1p function in the degradation and processing of several classes of RNA in Saccharomyces cerevisiae . Xrn1p is the main enzyme catalyzing cytoplasmic mRNA degradation in multiple decay pathways, whereas Xrn2p/Rat1p functions in the processing of rRNAs and small nucleolar RNAs (snoRNAs) in the nucleus. Much less is known about the XRN-like proteins of multicellular eukaryotes; however, differences in their activities could explain differences in mRNA degradation between multicellular and unicellular eukaryotes. One such difference is the lack in plants and animals of mRNA decay intermediates like those generated in yeast when Xrn1p is blocked by poly(G) tracts that are inserted within mRNAs. We investigated the XRN-family in Arabidopsis thaliana and found it to have several novel features. First, the Arabidopsis genome contains three XRN-like genes ( AtXRN s) that are structurally similar to Xrn2p/Rat1p, a characteristic unique to plants. Furthermore, our experimental results and sequence database searches indicate that Xrn1p orthologs may be absent from higher plants. Second, the lack of poly(G) mRNA decay intermediates in plants cannot be explained by the activity of the AtXRNs, because they are blocked by poly(G) tracts. Finally, complementation of yeast mutants and localization studies indicate that two of the AtXRNs likely function in the nucleus, whereas the third acts in the cytoplasm. Thus, the XRN-family in plants is more complex than in other eukaryotes, and, if an XRN-like enzyme plays a role in mRNA decay in plants, the likely participant is a cytoplasmic Xrn2p/Rat1p ortholog, rather than an Xrn1p ortholog.

참고문헌 (39)

Mol Cell Biol Heyer W-D 2728 15 1995 10.1128/MCB.15.5.2728 W-D Heyer, A W Johnson, U Reinhart, R D Kolodner Mol Cell Biol 15, 2728-2736 (1995).

상세보기
Mol Cell Biol Hsu C L 4826 13 1993 C L Hsu, A Stevens Mol Cell Biol 13, 4826-4835 (1993).
mRNA Metabolism & Post-Transcriptional Gene Regulation Tharun S 181 1997 S Tharun, R Parker mRNA Metabolism & Post-Transcriptional Gene Regulation, eds J B Harford, D Morris (Wiley-Liss, New York), pp. 181-200 (1997).
EMBO J Henry Y 2452 13 1994 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06530.x Y Henry, H Wood, J P Morrissey, E Petfalski, S Kearsey, D Tollervey EMBO J 13, 2452-2463 (1994).

상세보기
J Bacteriol Stevens A 7024 21 1991 10.1128/jb.173.21.7024-7028.1991 A Stevens, C L Hsu, K R Isham, F W Larimer J Bacteriol 21, 7024-7028 (1991).

상세보기
Mol Cell Biol Kenna M 341 13 1993 M Kenna, A Stevens, M McCannon, M G Douglas Mol Cell Biol 13, 341-350 (1993).

상세보기
Mol Cell Biol Johnson A W 6122 17 1997 10.1128/MCB.17.10.6122 A W Johnson Mol Cell Biol 17, 6122-6130 (1997).

상세보기
Mol Cell Biol Petfalski E 1181 18 1998 10.1128/MCB.18.3.1181 E Petfalski, T Dandekar, Y Henry, D Tollervey Mol Cell Biol 18, 1181-1189 (1998).

상세보기
Mol Cell Biol Villa T 3376 18 2000 10.1128/MCB.18.6.3376 T Villa, F Ceradini, C Presutti, I Bozzoni Mol Cell Biol 18, 3376-3383 (2000).

상세보기
Mol Cell Biol Vreken P 2986 12 1992 P Vreken, H A Raué Mol Cell Biol 12, 2986-2996 (1992).

상세보기
Genes Dev Decker C J 1632 7 1993 10.1101/gad.7.8.1632 C J Decker, R Parker Genes Dev 7, 1632-1643 (1993).

상세보기
Genes Dev Muhlrad D 855 8 1994 10.1101/gad.8.7.855 D Muhlrad, C J Decker, R Parker Genes Dev 8, 855-866 (1994).

상세보기
Biochem Biophys Res Commun Poole T L 799 235 1997 10.1006/bbrc.1997.6877 T L Poole, A Stevens Biochem Biophys Res Commun 235, 799-805 (1997).

상세보기
Dissertation Johnson M A 2000 M A Johnson Dissertation (Michigan State University, East Lansing, MI, 2000).
Plant Molecular Biology Kastenmayer J P 125 1998 J P Kastenmayer, A van Hoof, M Johnson, P J Green Plant Molecular Biology, eds N Raikhel, R Last, G Morelli, F LaShavo (Springer, Berlin), pp. 125-133 (1998).
Plant Physiol Newman T C 1241 106 1994 10.1104/pp.106.4.1241 T C Newman, F de Bruijn, P J Green, K Keegstra, H Kende, L McIntosh, J Ohlrogge, N V Raikhel, S C Somerville, M Tomashow, et al. Plant Physiol 106, 1241-1255 (1994).

상세보기
Methods Enzymol Schena M 389 194 1991 10.1016/0076-6879(91)94029-C M Schena, D Picard, K R Yamamoto Methods Enzymol 194, 389-398 (1991).
Genes Dev Caponigro G 2421 9 1995 10.1101/gad.9.19.2421 G Caponigro, R Parker Genes Dev 9, 2421-2432 (1995).

상세보기
Genes Dev Amberg D C 1173 6 1992 10.1101/gad.6.7.1173 D C Amberg, A L Goldstein, C N Cole Genes Dev 6, 1173-1189 (1992).

상세보기
Proc Natl Acad Sci USA Taylor C B 5118 90 1993 10.1073/pnas.90.11.5118 C B Taylor, P A Bariola, S B DelCardayré, R T Raines, P J Green Proc Natl Acad Sci USA 90, 5118-5122 (1993).

상세보기
Gene von Arnim A G 35 221 1998 10.1016/S0378-1119(98)00433-8 A G von Arnim, X W Deng, M G Stacey Gene 221, 35-43 (1998).

상세보기
Plant Cell Vargona M J 1213 4 1992 M J Vargona, R J Schmidt, N Raikhel Plant Cell 4, 1213-1227 (1992).

상세보기
Annu Rev Cell Dev Biol Hicks G R 155 11 1995 10.1146/annurev.cb.11.110195.001103 G R Hicks, N Raikhel Annu Rev Cell Dev Biol 11, 155-188 (1995).

상세보기
Plant Cell Stacey M G 349 11 1999 10.1105/tpc.11.3.349 M G Stacey, S N Hicks, A G von Arnim Plant Cell 11, 349-363 (1999).

상세보기
Curr Genet Szankasi P 284 30 1996 10.1007/s002940050134 P Szankasi, G R Smith Curr Genet 30, 284-293 (1996).

상세보기
J Cell Biol Bashkirov V I 761 136 1997 10.1083/jcb.136.4.761 V I Bashkirov, H Scherthan, J A Solinger, J-M Buerstedde, W-D Heyer J Cell Biol 136, 761-773 (1997).

상세보기
Mech Dev Till D D 51 79 1998 10.1016/S0925-4773(98)00173-7 D D Till, B Linz, J E Seago, S J Elgar, P E Marujo, M D Elias, C M Arraiano, J A McClellan, J E G McCarthy, S F Newbury Mech Dev 79, 51-55 (1998).

상세보기
EMBO J Jacobs Anderson J S 1497 17 1998 10.1093/emboj/17.5.1497 J S Jacobs Anderson, R Parker EMBO J 17, 1497-1506 (1998).

상세보기
Curr Biol Jacobs Anderson J S 780 6 1996 10.1016/S0960-9822(02)00593-6 J S Jacobs Anderson, R Parker Curr Biol 6, 780-782 (1996).

상세보기
Nucleic Acids Res Aubourg S 628 10.1093/nar/27.2.628 27 S Aubourg, M Kreis, A Lecharny Nucleic Acids Res 27, 628-636 (999).

상세보기
Plant Cell Higgs D C 1007 6 1994 D C Higgs, J T Colbert Plant Cell 6, 1007-1019 (1994).

상세보기
Trends Plant Sci Gutiérrez R A 429 4 1999 10.1016/S1360-1385(99)01484-3 R A Gutiérrez, G C MacIntosh, P J Green Trends Plant Sci 4, 429-438 (1999).

상세보기
Plant J Palanivelu R 187 22 2000 10.1046/j.1365-313x.2000.00721.x R Palanivelu, D A Belostotsky, R B Meagher Plant J 22, 187-198 (2000).

상세보기
Mol Cell Biol Tanzer M M 6641 15 1995 10.1128/MCB.15.12.6641 M M Tanzer, R B Meagher Mol Cell Biol 15, 6641-6652 (1995).

상세보기
Plant Cell Tanzer M M 1411 9 1997 10.2307/3870391 M M Tanzer, W F Thompson, M D Law, E A Wernsman, S Uknes Plant Cell 9, 1411-1423 (1997).

상세보기
Nucleic Acids Res van Eldik G J 5176 26 1998 10.1093/nar/26.22.5176 G J van Eldik, K Litiere, J J Jacobs, M Van Montagu, M Cornelissen Nucleic Acids Res 26, 5176-5181 (1998).

상세보기
Cell Metzlaff M 845 88 1997 10.1016/S0092-8674(00)81930-3 M Metzlaff, M O'Dell, P D Cluster, R B Flavell Cell 88, 845-854 (1997).

상세보기
BioEssays Sijen T 520 22 2000 10.1002/(SICI)1521-1878(200006)22:6<520::AID-BIES5>3.0.CO;2-W T Sijen, J M Kooter BioEssays 22, 520-531 (2000).

상세보기
Mol Cell Biol Solinger J A 5930 9 1999 10.1128/MCB.19.9.5930 J A Solinger, D Pascolini, W D Heyer Mol Cell Biol 9, 5930-5942 (1999).

상세보기

원문 보기

AccessON 원문보기

원문 URL 링크

DOI : 10.1073/pnas.97.25.13985 [무료]
PubMed Central : 저널 > 논문 [무료]
National Academy of Sciences : 저널> 권호 > 논문 [무료]
JSTOR : 저널> 권호 > 논문
EBSCO Industries, Inc. : 저널
AccessON : 저널

*원문 PDF 파일 및 링크정보가 존재하지 않을 경우 KISTI DDS 시스템에서 제공하는 원문복사서비스를 사용할 수 있습니다.

오픈액세스(OA) 유형

BRONZE

출판사/학술단체 등이 한시적으로 특별한 프로모션 또는 일정기간 경과 후 접근을 허용하여, 출판사/학술단체 등의 사이트에서 이용 가능한 논문

저작권 관리 안내

내보내기 메뉴

내보내기 구분

파일저장
인쇄
메일전송

구성항목

기본정보
상세정보

관리번호, 논문명, 저널/프로시딩명, 저자 , 발행년, 권, 호, 시작페이지, 끝페이지, 발행기관

저장형식

Text(ASCII format)
Excel format
RefWorks Direct Export
RIS format (for Reference Manager, ProCite, EndNote), Scholar's Aids, Mendeley

메일정보

받는사람 (필수): @
보내는사람 (선택): @
제목
내용: KISTI 검색결과 이메일 서비스

안내

총 건의 자료가 검색되었습니다.

다운받으실 자료의 인덱스를 입력하세요. (1-10,000)

검색결과의 순서대로 최대 10,000건 까지 다운로드가 가능합니다.

데이타가 많을 경우 속도가 느려질 수 있습니다.(최대 2~3분 소요)

다운로드 파일은 UTF-8 형태로 저장됩니다.
파일의 내용이 제대로 보이지 않을실 때는 웹브라우저 상단의 보기 -> 인코딩 -> 자동선택 여부를 확인하십시오.

Text(ASCII format)
Excel format

표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

AI-Helper ※ AI-Helper는 을 사용합니다.

AI-Helper

안녕하세요, AI-Helper입니다. 좌측 "선택된 텍스트"에서 텍스트를 선택하여 요약, 번역, 용어설명을 실행하세요.
※ AI-Helper는 부적절한 답변을 할 수 있습니다.

연합인증

[해외논문] Novel features of the XRN-family in Arabidopsis : Evidence that AtXRN4, one of several orthologs of nuclear Xrn2p/Rat1p, functions in the cytoplasm 원문보기

Abstract ▼ AI-Helper

참고문헌 (39)

이 논문을 인용한 문헌

관련 콘텐츠

원문 보기

원문 URL 링크

오픈액세스(OA) 유형

AI-Helper ※ AI-Helper는 오픈소스 모델을 사용합니다.

선택된 텍스트

내보내기 구분	파일저장 인쇄 메일전송
구성항목	기본정보 상세정보 관리번호, 논문명, 저널/프로시딩명, 저자 , 발행년, 권, 호, 시작페이지, 끝페이지, 발행기관 관리번호, 논문명, 대등논문명, 저자 , 저널/프로시딩명, 발행기관, 발행년, 발행언어, 권, 호, 시작페이지, 끝페이지, ISBN, ISSN, 주제분야, 키워드, 초록(한글), 초록(영문), 저자(소속기관)
저장형식	Text(ASCII format) Excel format RefWorks Direct Export RIS format (for Reference Manager, ProCite, EndNote), Scholar's Aids, Mendeley
메일정보	받는사람 (필수) @ 보내는사람 (선택) @ 제목 내용 KISTI 검색결과 이메일 서비스
안내	총 건의 자료가 검색되었습니다. 다운받으실 자료의 인덱스를 입력하세요. (1-10,000) 검색결과의 순서대로 최대 10,000건 까지 다운로드가 가능합니다. 데이타가 많을 경우 속도가 느려질 수 있습니다.(최대 2~3분 소요) 다운로드 파일은 UTF-8 형태로 저장됩니다. 파일의 내용이 제대로 보이지 않을실 때는 웹브라우저 상단의 보기 -> 인코딩 -> 자동선택 여부를 확인하십시오. ~ Text(ASCII format) Excel format