[논문]GenotypingCryptosporidium parvum by single-strand conformation polymorphism analysis of ribosomal and heat shock gene regions

Gasser, Robin B.; Zhu, Xingquan; Caccio, Simone; Chalmers, Rachel; Widmer, Giovanni; Morgan, Una M.; Thompson, R. C. Andrew; Pozio, Edoardo; Browning, Glenn F.

doi:10.1002/1522-2683(200102)22:3<433::AID-ELPS433>3.0.CO;2-K

[해외논문] GenotypingCryptosporidium parvum by single-strand conformation polymorphism analysis of ribosomal and heat shock gene regions

Electrophoresis, v.22 no.3, 2001년, pp.433 - 437

Gasser, Robin B. , Zhu, Xingquan , Caccio, Simone , Chalmers, Rachel , Widmer, Giovanni , Morgan, Una M. , Thompson, R. C. Andrew , Pozio, Edoardo , Browning, Glenn F.

Abstract ▼ AI-Helper

Polymerase chain reaction (PCR)-coupled single-strand conformation polymorphism (SSCP) approaches utilizing nuclear DNA regions of the small subunit (SSU) of ribosomal RNA and heat shock protein 70 gene (HSP70) were established for genotyping Cryptosporidium parvum. The regions were amplified (individually or in a multiplex reaction) by PCR from DNA extracted from oocysts from ruminant or human hosts, then denatured and subjected to electrophoresis in a mutation detection enhancement (nondenaturing) gel matrix. Single-strand profiles produced in SSCP allowed the unequivocal identification/differentiation of the two common (human, 1 and cattle, 2) genotypes of C. parvum and the direct display of sequence variability within some samples, reflecting population variation. As these are considered among the most closely related genotypes (based on SSU and HSP70 sequence data), these findings and other preliminary results for C. felis (from cat) C. serpentis (from snake) and C. baileyi (from bird) indicate that the SSCP approaches established could be employed to identify any of the currently recognised genotypes and species of Cryptosporidium.

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표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

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