[논문]Viscous-medium-based crystal support in a sample holder for fixed-target serial femtosecond crystallography

Lee, Keondo; Lee, Donghyeon; Baek, Sangwon; Park, Jaehyun; Lee, Sang Jae; Park, Sehan; Chung, Wan Kyun; Lee, Jong-Lam; Cho, Hyun-Soo; Cho, Yunje; Nam, Ki Hyun

doi:10.1107/s1600576720008663

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Journal of applied crystallography : JAC, v.53 no.4, 2020년, pp.1051 - 1059

Lee, Keondo , Lee, Donghyeon , Baek, Sangwon , Park, Jaehyun , Lee, Sang Jae , Park, Sehan , Chung, Wan Kyun , Lee, Jong-Lam , Cho, Hyun-Soo , Cho, Yunje , Nam, Ki Hyun

Abstract ▼ AI-Helper

Serial femtosecond crystallography (SFX) enables the determination of the room-temperature crystal structure of macromolecules, as well as providing time-resolved molecular dynamics data in pump-probe experiments. Fixed-target SFX (FT-SFX) can minimize sample consumption and physical effects on crystals during sample delivery. In FT-SFX studies, having a sample holder that can stably fix crystal samples is one of the key elements required for efficient data collection. Hence, development of sample holders from new materials capable of supporting various crystal sizes and shapes may expand the applications of FT-SFX. Here, a viscous-media-based crystal support in a sample holder for FT-SFX is introduced. Crystal samples were embedded in viscous media, namely gelatin and agarose, which were enclosed in a polyimide film. In the vertically placed sample holder, 10-15%(w/v) viscous gelatin and 1-4%(w/v) agarose gel stably supported crystals between two polyimide films, thereby preventing the crystals from descending owing to gravity. Using this method, FT-SFX experiments were performed with glucose isomerase and lysozyme embedded in gelatin and agarose, respectively. The room-temperature crystal structures of glucose isomerase and lysozyme were successfully determined at 1.75 and 1.80 Å resolutions, respectively. The glucose isomerase and lysozyme diffraction analyses were not impeded by excessive background scattering from the viscous media. This method is useful for delivering crystal samples of various sizes and shapes in FT-SFX experiments.

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표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

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