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Bulletin OEPP. EPPO bulletin, v.47 no.1, 2017년, pp.24 - 32
van Vaerenbergh, J. (Institute for Agriculture and Fisheries Research, ILVO, Centre for Diagnosis of Plant Pests, Laboratory of Bacteriology, Burgemeester Van Gansberghelaan 96, 9820, Merelbeke, (Belgium)) , Müller, P. (Julius Kü) , Elphinstone, J. G. (hn‐) , Vreeburg, R. A. M. (Institut, JKI, Federal Research Centre for Cultivated Plants, Institute for National and International Plant Health, Stahnsdorfer Damm 81, 14532, Kleinmachnow, (Germany)) , Janse, J. D. (Fera Science Ltd (Fera), Sand Hutton, York, YO41 1LZ, (UK))
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In the European Union (EU) potato production is surveyed for Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus (potato ring rot) and Ralstonia solanacearum (potato brown rot) under Commission Directives 93/85/EEC with its amendment 2006/56/EC and 98/57/EEC with its amendment 2006/63/EC. A regular update ...
Essais de comparaison inter‐laboratoires Euphresco (2009‐2012) pour la détection de Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus et Ralstonia solanacearum sur tubercules de pomme de terre: proposition d'inclusion de la PCR TaqMan® temps réel comme premier test de dépistage (test clé) dans les Directives européennes et Normes OEPPLa production de pommes de terre fait l'objet, dans l'Union européenne, d'une surveillance vis‐à‐vis de Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus (pourriture annulaire de la pomme de terre) et de Ralstonia solanacearum (pourriture brune de la pomme de terre), encadrée par les Directives 93/85/CEE (amendée par la directive 2006/56/EC) et 98/57/CEE (amendée par la directive 98/57/EC) de la Commission. Une mise à jour régulière de ces Directives est nécessaire au regard de l’évolution des connaissances sur la biologie de ces organismes et sur les méthodes de diagnostic recommandées en vue de leur détection et identification. Trois Tests Inter‐Laboratoires (ILT1, ILT2 and ILT 3), ont été menés de 2009 à 2012, au sein d'un projet de l'ERA‐NET phytosanitaire EUPHRESCO pour évaluer la performance des méthodes de détection officielles actuelles vis‐à‐vis de C. michiganensis subsp. sepedonicus et de R. solanacearum. L'un des principaux objectifs des tests inter‐laboratoires était de générer des données sur la performance des protocoles PCR temps‐réel, afin de soutenir leur inclusion comme premiers tests de dépistages (tests clés) pour ces deux agents pathogènes. Au total 29 laboratoires de 23 pays ont participé à ILT1, 23 laboratoires de 18 pays à ILT2 et 42 laboratoires de 24 pays à ILT3. La précision relative des tests PCR temps réel est en moyenne de 92% pour R. solanacearum et de 96% pour C. michiganensis subsp. sepedonicus, laquelle est comparée avec celle des premiers tests de dépistage (test clés) existants (immunofluorescence, PCR conventionnelle, mise en culture semi‐sélective sur boite de Petri et biotests), en terme de sensibilité analytique, spécificité analytique et robustesse. Il est conclu que toutes les méthodes testées, dont la PCR temps réel, peuvent être considérées comme équivalentes. C'est pourquoi il est recommandé d'ajouter la PCR TaqMan® temps réel dans les Directives européennes et Normes OEPP comme un premier test de dépistage (test clé) digne de confiance.
Official Journal of the European Communities EC 1 182 2006 Council directive 2006/56/EC
Official Journal of the European Communities EC 1 206 2006 Council directive 2006/63/EC
Journal of Plant Pathology Jansing H 590 105 1998 Physiological capabilities of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus and development of a semi‐selective medium
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Pastrik, K.-H., Elphinstone, J.G., Pukall, R.. Sequence Analysis and Detection of Ralstonia solanacearum by Multiplex PCR Amplification of 16S–23S Ribosomal Intergenic Spacer Region with Internal Positive Control. European journal of plant pathology, vol.108, no.9, 831-842.
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Gesunde Pflanzen Seigner L 37 49 1997 Der Nachweis von Burkholderia (Pseudomonas) solanacearum mit der Polymerase‐Kettenreaktion (PCR) - Vergleich verschiedener DNA‐Extraktionsmethoden
Methode und praktische Hinweise, Gesunde Pflanzen Seigner L 1001 59 2007 Realtime‐PCR zum Nachweis von Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus und Ralstonia solanacearum - Grundlagen
Vreeburg, R. A. M., Bergsma‐Vlami, M., Bollema, R. M., de Haan, E. G., Kooman‐Gersmann, M., Smits‐Mastebroek, L., Tameling, W. I. L., Tjou‐Tam‐Sin, N. N. A., van de Vossenberg, B. T. L. H., Janse, J. D.. Performance of real‐time PCR and immunofluorescence for the detection of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus and Ralstonia solanacearum in potato tubers in routine testing. Bulletin OEPP. EPPO bulletin, vol.46, no.1, 112-121.
Weller, S. A., Elphinstone, J. G., Smith, N. C., Boonham, N., Stead, D. E.. Detection of Ralstonia solanacearum Strains with a Quantitative, Multiplex, Real-Time, Fluorogenic PCR (TaqMan) Assay. Applied and environmental microbiology, vol.66, no.7, 2853-2858.
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