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[해외논문] Crystal structure of the mouse endonuclease G

Biochemical and biophysical research communications, v.526 no.1, 2020년, pp.35 - 40  

Park, Kwang-Hyun (Disease Target Structure Research Center, Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology (KRIBB)) ,  Yoon, Sei Mee (Disease Target Structure Research Center, Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology (KRIBB)) ,  Song, Hyung Nam (Disease Target Structure Research Center, Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology (KRIBB)) ,  Yang, Joon-Hyuck (Disease Target Structure Research Center, Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology (KRIBB)) ,  Ryu, Seong Eon (Department of Bioengineering, College of Engineering, Hanyang University) ,  Woo, Eui-Jeon (Disease Target Structure Research Center, Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology (KRIBB))

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Abstract Endonuclease G (EndoG) is a mitochondrial enzyme that responds to apoptotic stimuli by translocating to the nucleus and cleaving the chromatin DNA. The molecular mechanism of EndoG still remains unknown in higher organisms. Here, we determined the crystal structure of mouse EndoG at ∼1...

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참고문헌 (25)

  1. Nature Li 412 95 2001 10.1038/35083620 Endonuclease G is an apoptotic DNase when released from mitochondria 

  2. Cell Death Differ. Apostolov 14 1971 2007 10.1038/sj.cdd.4402217 Role of EndoG in development and cell injury 

  3. J. Biol. Chem. Huang 277 21071 2002 10.1074/jbc.M201785200 Endonuclease G, a candidate human enzyme for the initiation of genomic inversion in herpes simplex type 1 virus 

  4. Cell Res. Tang 29 347 2019 10.1038/s41422-019-0164-5 The molecular machinery of regulated cell death 

  5. FEBS Lett. Friedhoff 443 209 1999 10.1016/S0014-5793(98)01660-3 Cleavage experiments with deoxythymidine 3’,5’-bis-(p-nitrophenyl phosphate) suggest that the homing endonuclease I-PpoI follows the same mechanism of phosphodiester bond hydrolysis as the non-specific Serratia nuclease 

  6. Nucleic Acids Res. Belfort 25 3379 1997 10.1093/nar/25.17.3379 Homing endonucleases: keeping the house in order 

  7. EMBO J. Li 22 4014 2003 10.1093/emboj/cdg377 DNA binding and cleavage by the periplasmic nuclease Vvn: a novel structure with a known active site 

  8. J. Biol. Chem. Widlak 276 48404 2001 10.1074/jbc.M108461200 Action of recombinant human apoptotic endonuclease G on naked DNA and chromatin substrates: cooperation with exonuclease and DNase I 

  9. Apoptosis Kalinowska 10 821 2005 10.1007/s10495-005-0410-9 Regulation of the human apoptotic DNase/RNase endonuclease G: involvement of Hsp70 and ATP 

  10. Nucleic Acids Res. Loll 37 7312 2009 10.1093/nar/gkp770 Crystal structure of the EndoG/EndoGI complex: mechanism of EndoG inhibition 

  11. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun Yoon 65 504 2009 10.1107/S1744309109013335 Purification, crystallization and data collection of the apoptotic nuclease endonuclease G 

  12. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr Storoni 60 432 2004 10.1107/S0907444903028956 Likelihood-enhanced fast rotation functions 

  13. Methods Enzymol. Otwinowski 276 307 1997 10.1016/S0076-6879(97)76066-X Processing of X-ray diffraction data collected in oscillation mode 

  14. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr Terwilliger 55 Pt 4 849 1999 10.1107/S0907444999000839 Automated MAD and MIR structure solution 

  15. Acta Crystallogr D Struct Biol Liebschner 75 861 2019 10.1107/S2059798319011471 Macromolecular structure determination using X-rays, neutrons and electrons: recent developments in Phenix 

  16. J. Biol. Chem. Lin 287 7110 2012 10.1074/jbc.M111.316075 Structural insights into apoptotic DNA degradation by CED-3 protease suppressor-6 (CPS-6) from Caenorhabditis elegans 

  17. Nucleic Acids Res. Wu 47 5405 2019 10.1093/nar/gkz241 A unique exonuclease ExoG cleaves between RNA and DNA in mitochondrial DNA replication 

  18. Nucleic Acids Res. Loll 37 7312 2009 10.1093/nar/gkp770 Crystal structure of the EndoG/EndoGI complex: mechanism of EndoG inhibition 

  19. J. Mol. Biol. Miller 288 975 1999 10.1006/jmbi.1999.2729 The active site of Serratia endonuclease contains a conserved magnesium-water cluster 

  20. J. Biol. Chem. Ghosh 280 27990 2005 10.1074/jbc.M501798200 Structural insights into the mechanism of nuclease A, a betabeta alpha metal nuclease from Anabaena 

  21. Oncogene Gole 34 3391 2015 10.1038/onc.2014.268 Endonuclease G initiates DNA rearrangements at the MLL breakpoint cluster upon replication stress 

  22. Nucleic Acids Res. Robertson 42 13280 2014 10.1093/nar/gku1032 Endonuclease G preferentially cleaves 5-hydroxymethylcytosine-modified DNA creating a substrate for recombination 

  23. J. Biol. Chem. Temme 284 8337 2009 10.1074/jbc.M808319200 The Drosophila melanogaster gene cg4930 encodes a high affinity inhibitor for endonuclease G 

  24. Nucleic Acids Res. Pingoud 29 3705 2001 10.1093/nar/29.18.3705 Structure and function of type II restriction endonucleases 

  25. Oncogene Vahsen 25 1763 2006 10.1038/sj.onc.1209206 Physical interaction of apoptosis-inducing factor with DNA and RNA 

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