[논문]Grid workflow system을 이용한 인공 심장 Parallel pipelined volume render ing system

박진성; 류소현; 권용원; 정창성

Grid workflow system을 이용한 인공 심장 Parallel pipelined volume render ing system
Parallel Pipelined volume rendering of artifical heart using WISE on Grid 원문보기

박진성 (고려대학교 전자공학과) , 류소현 (고려대학교 전자공학) , 권용원 (고려대학교 전자공학) , 정창성 (고려대학교 전자공학과)

본 논문은 Grid상의 workflow 시스템인 Workflow based Grid Portal for PSE(이하 WISE)를 이용한 인공 심장의 3차원 병렬 volume rendering system 디자인과 구현에 대하여 기술한다. Grid는 전 세계에 분산되어 있는 고성능, 대용량 자원들을 고속 네트워크로 연동하여 사용할 수 있게 하는 환경이며, WISE 시스템은 workflow 개념을 도입하여, 이런 자원들의 효율적이고 편리하게 관리해주고 아울러 여러 가지 패턴을 이용해 프로그래밍 할 수 있게 해주는 middleware이다. 본 논문에서는 Grid 상에서 WISE system에서 제공하는 프로그래밍 패턴을 이용하여 구조화되어 있지 않은 인공심장 데이터를 병렬 processing Pipeline 모델을 바탕으로 효율적인 parallel 3차원 가시화를 하기 위한 parallel pipelined volume rendering system을 구현하였다.

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문제 정의

본 논문에서는 Grid환경하에서 WISE를 이용하여 인공심장 데이터를 빠르고 효율적이로 가시화 하기 위해 parallel pipelined volume renderer를 구현하였으며 실험을 통하여 효율성을 입증하였다. 앞으로는 viewport에 따른 load balancing문제를 보안하여 시스템을 개량 시켜야 하겠다.
이 논문은 많은 processing 시간과 저장공간이 필요한 3차원 인공심장의 가시화를위해 parallel pipeline 개념올 적용하고 Grid상에서 workflow system인 WISE를이용한 parallel pipelined volume rendering system의 구현과 디자인에 대해서 소개한다,

제안 방법

WISE systeme 손쉽게 분산/병렬 프로그래밍 할 수 있도록 다수의 과학 기술 분야의 예제들을 분석하여 만둔 parallel workflow pattern과 편리한 프로그래밍 환경을 위한 visual editor 및 GUI을 제공하여 준다.
대부분의 의료나 과학 데이터들이 비구조화(instructed)되어 있기 때문에 그러한 데이터들을 손쉽게 volume rendering하기 위해서 fileConverter를 구현하였다.
우리는 여기서 WISE가 제공하는 패턴 중 pipelined, split-join pattern을 사용하여 분산/병렬 프로그래밍 하였다.

대상 데이터

실험은 100Mbps Ethernet으로 연결되어있는 SGI 02 1대, SGI Octane 1대, 펜티엄 4 8대, 총 10대의 이기종 자원들을 이용하였다. 파일변환을 통해 만들어낸 256*256*225 data# 사용하여 512*512 이미지를 만들어 내었다.

이론/모형

우리는 이러한 문제를 해결하기 위해 분산되어 있는 고성능, 대용량 자원을 고속네트워크를 통해 사용할 수 있는 Grid 환경을 사용하여 인공심장의 dataset을 분산/ 병렬 프로그래밍 환경을 제공하는 WISE system에서 rendering 가속화 알고리즘인 space-leaping알고리즘과 parallel pipeline model 을 적용하여 3차원 가시화하는 parallel pipelined volume rendering system 을 구현하였다,

후속연구

앞으로는 viewport에 따른 load balancing문제를 보안하여 시스템을 개량 시켜야 하겠다.

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표제어: PCR

동의어: Packet Collision Rate

용어 설명 출처 목록 (6)

용어 설명: PCR은 세균 특이성이 있는 primer를 이용하여 적은 수의 세균이 있을지라도 쉽게 검출할 수 있는 유용한 방법이며, 이를 이용하여 구강 내 치면세균막이나 타액에서 직접 세균을 검출할 수 있게 되었다[8].

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