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NTIS 바로가기한국HCI학회 2007년도 학술대회 1부, 2007 Feb. 05, 2007년, pp.1045 - 1050
방선이 (한국전자통신연구원) , 최재훈 (한국전자통신연구원) , 박종민 (한국전자통신연구원) , 박수준 (한국전자통신연구원)
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핵심어 | 질문 | 논문에서 추출한 답변 |
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실험을 통해 추출된 단백질간의 상호작용 데이터는 어떤 데이터베이스에 체계적으로 관리되고 있는가? | 일반적으로 하나의 단백질은 고유한 기능을 가지고 있지만, 생체 내에서 특정한 생물학적 역할을 하기 위해서 여러 다른 단백질들과 다양한 상호작용을 한다. 현재, 대부분의 단백질간의 상호작용 데이터는 ‘Yeast Two-Hybrid’ 와 ‘co-AP/MS’라는 생물학적 실험을 통해 빠르게 추출 되고 있으며, 추출된 데이터는 BIND[1], DIP[2], MINT[3], BioGRID[4] 등과 같이 데이터베이스에 체계 적으로 관리되고 있다[5,6]. | |
단백질간의 상호작용 데이터는 어떤 실험으로 추출되고 있는가? | 일반적으로 하나의 단백질은 고유한 기능을 가지고 있지만, 생체 내에서 특정한 생물학적 역할을 하기 위해서 여러 다른 단백질들과 다양한 상호작용을 한다. 현재, 대부분의 단백질간의 상호작용 데이터는 ‘Yeast Two-Hybrid’ 와 ‘co-AP/MS’라는 생물학적 실험을 통해 빠르게 추출 되고 있으며, 추출된 데이터는 BIND[1], DIP[2], MINT[3], BioGRID[4] 등과 같이 데이터베이스에 체계 적으로 관리되고 있다[5,6]. | |
Force-Directed Placement 알고리즘의 장단점은 무엇인가? | 에지들이 겹쳐져 레이아웃되는 것을 방지하기 위해, 인접노드들간의 에지는 서로 당기는 local force로 보며, 비인접노드들은 서로 밀어내는 global force로 본다. 이 알고리즘은 융통성 있고 구현하기 쉬우며 드로잉 결과도 양호하기 때문에 많이 사용되지만, 대용량의 데이터에 대해서는 느리다는 단점이 있다. 속도향상을 위해 노드집합에 대해 다단계로 클러스터를 이룬 후, 이를 확장하는 과정에서 FDP를 적용하는 ‘Multilevel for Force-Directed Placement’(MFDP) 알고리즘이 있다[9]. |
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