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단백질 네트워크 기반 후성유전학적 암 발생 기전 예측
Prediction of epigenetic carcinogenesis based on protein network 원문보기

한국콘텐츠학회 2016년도 춘계 종합학술대회 논문집, 2016 May 20, 2016년, pp.191 - 192  

진혜정 (충북대학교) ,  이지후 (충북대학교) ,  김학용 (충북대학교)

초록
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DNA 염기서열 자체에는 변화가 없으나 크로마틴의 변형을 통하여 유전자의 발현 양상이 변하는 현상을 후성유전이라 한다. 최근에 이런 후성유전학적 변이가 암 발생과 밀접한 연관이 있는 것으로 알려졌다. 본 연구에서는 암 관련 단백질과 암 관련 후성유전 단백질 상호작용 네트워크를 통하여 암과 후성 유전적 관계를 분석하고자 하였다. 먼저 상호작용 네트워크를 기반으로 허브에 해당하는 히스톤 변형 단백질 20개를 추출하였다. 추출한 20개 단백질을 KEGG pathway에 적용하여 암 관련 단백질과의 상관관계를 분석하였다. 암 관련 단백질 발현양상을 확인할 수 있는 Expression Atlas로부터 발현이 증가하거나 감소하는 단백질을 분류하고, 발현 정보를 KEGG pathway 위에 있는 단백질에 적용함으로써 후성유전학적 암 발생 기전을 도출하였다.

AI 본문요약
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문제 정의

  • 따라서 본 연구에서는 암과 관련된 단백질들과 암에서 후성유전적 변이가 일어나는 단백질들을 추출하여 네트워크 및 중심 경로를 분석하고 이들의 상관관계와 암 발생 기전을 예측하고자 한다.
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