주식회사 메디리타 / 서울특별시 구로구 디지털로**길 **, ***호(구로동, 마리오타워)
대리인 / 주소
강범주
심사청구여부
있음 (2019-11-17)
심사진행상태
등록결정(일반)
법적상태
등록
초록▼
본 발명의 한 실시예에 따른 데이터 처리 장치의 신약 후보 물질 발굴을 위한 데이터 처리 방법은 오믹스를 이루는 복수의 오믹스 레벨 중 적어도 일부의 오믹스 레벨을 사용자 인터페이스를 통하여 입력 받는 단계; 상기 오믹스를 이루는 복수의 상호 연관도 종류 중 적어도 일부의 상호 연관도 종류를 사용자 인터페이스를 통하여 입력 받는 단계; 오믹스 레벨 별 데이터 및 상호 연관도 종류 별 데이터를 포함하는 오믹스 DB로부터 상기 적어도 일부의 오믹스 레벨에 관한 DB 및 상기 적어도 일부의 상호 연관도 종류에 관한 DB를 선택하는 단계;
본 발명의 한 실시예에 따른 데이터 처리 장치의 신약 후보 물질 발굴을 위한 데이터 처리 방법은 오믹스를 이루는 복수의 오믹스 레벨 중 적어도 일부의 오믹스 레벨을 사용자 인터페이스를 통하여 입력 받는 단계; 상기 오믹스를 이루는 복수의 상호 연관도 종류 중 적어도 일부의 상호 연관도 종류를 사용자 인터페이스를 통하여 입력 받는 단계; 오믹스 레벨 별 데이터 및 상호 연관도 종류 별 데이터를 포함하는 오믹스 DB로부터 상기 적어도 일부의 오믹스 레벨에 관한 DB 및 상기 적어도 일부의 상호 연관도 종류에 관한 DB를 선택하는 단계; 상기 적어도 일부의 오믹스 레벨에 관한 DB 및 상기 적어도 일부의 상호 연관도 종류에 관한 DB로 이루어진 제1 매트릭스를 생성하는 단계; 사용자 인터페이스를 통하여 소정의 검색어를 입력 받는 단계; 상기 적어도 일부의 오믹스 레벨에 관한 DB 및 상기 적어도 일부의 상호 연관도 종류에 관한 DB로부터 상기 소정의 검색어와 관련된 복수의 생물학적 엔티티 및 상기 복수의 생물학적 엔티티 간 상호 연관도를 추출하는 단계; 그리고 상기 복수의 생물학적 엔티티를 포함하는 복수의 노드를 상기 복수의 생물학적 엔티티 간 상호 연관도에 따라 연결한 멀티오믹스 네트워크를 생성하는 단계를 포함하고, 상기 복수의 생물학적 엔티티 중 일부는 나머지 생물학적 엔티티와 서로 다른 오믹스 레벨에 포함된다.
대표청구항▼
데이터 처리 장치에서 수행되는 신약 후보 물질 발굴을 위한 데이터 처리 방법에 있어서,오믹스를 이루는 복수의 오믹스 레벨 중 적어도 일부의 오믹스 레벨을 사용자 인터페이스를 통하여 입력 받는 단계;상기 오믹스를 이루는 복수의 상호 연관도 종류 중 적어도 일부의 상호 연관도 종류를 사용자 인터페이스를 통하여 입력 받는 단계;오믹스 레벨 별 데이터 및 상호 연관도 종류 별 데이터를 포함하는 오믹스 DB로부터 상기 적어도 일부의 오믹스 레벨에 관한 DB 및 상기 적어도 일부의 상호 연관도 종류에 관한 DB를 선택하는 단계;상기 적어도 일
데이터 처리 장치에서 수행되는 신약 후보 물질 발굴을 위한 데이터 처리 방법에 있어서,오믹스를 이루는 복수의 오믹스 레벨 중 적어도 일부의 오믹스 레벨을 사용자 인터페이스를 통하여 입력 받는 단계;상기 오믹스를 이루는 복수의 상호 연관도 종류 중 적어도 일부의 상호 연관도 종류를 사용자 인터페이스를 통하여 입력 받는 단계;오믹스 레벨 별 데이터 및 상호 연관도 종류 별 데이터를 포함하는 오믹스 DB로부터 상기 적어도 일부의 오믹스 레벨에 관한 DB 및 상기 적어도 일부의 상호 연관도 종류에 관한 DB를 선택하는 단계;상기 적어도 일부의 오믹스 레벨에 관한 DB 및 상기 적어도 일부의 상호 연관도 종류에 관한 DB로 이루어진 제1 매트릭스를 생성하는 단계;사용자 인터페이스를 통하여 검색어를 입력 받는 단계;상기 제1 매트릭스로부터 상기 검색어의 오믹스 레벨과 다른 오믹스 레벨에 속하고 상기 검색어와 관련된 생물학적 엔티티들을 추출하고, 상기 검색어 및 상기 생물학적 엔티티들 간의 상호 연관도를 추출하는 단계; 상기 검색어와 상기 생물학적 엔티티들을 나타내는 노드들을 상기 검색어와 상기 생물학적 엔티티들 간의 상호 연관도 또는 상기 생물학적 엔티티들 간의 상호 연관도에 따라 연결한 멀티오믹스 네트워크를 생성하는 단계;상기 멀티오믹스 네트워크의 노드들 각각에 대한 그래프 이론 지표를 생성하는 단계; 및상기 노드들 중 상기 그래프 이론 지표를 이용하여 추출된 일부 노드를 이용하여 상기 멀티오믹스 네트워크 내 서로 다른 오믹스 레벨 간 연결 관계를 가지는 일부 경로를 추출하는 단계를 포함하고,상기 생물학적 엔티티들 중 일부는 나머지 생물학적 엔티티와 서로 다른 오믹스 레벨에 포함되며, 상기 검색어는 유전자명, 단백질명, 신진대사체명, 증상명, 질환명, 화합물명 및 약품명 중 적어도 하나를 포함하고, 상기 생물학적 엔티티는 유전자, 단백질, 신진대사체, 증상, 질환, 화합물 및 약품 중 적어도 하나를 포함하며, 상기 상호연관도의 범주는 참여(participate), 공변(covariate), 조절(regulate), 연관(associate), 결합(bind), 업레귤레이트(upregulate), 유사(resemble), 치료(treat), 다운레귤레이트(downregulates), 완화(palliate), 포함(include), 및 표출(express)을 포함하며, 상기 제1 매트릭스는 상기 적어도 일부의 오믹스 레벨이 가로축 및 세로축 각각에 배치되며, 가로축과 세로축이 교차하는 지점에 상기 상호 연관도 종류가 표시되도록 생성되고,상기 그래프 이론 지표는 상기 멀티오믹스 네트워크를 구성하는 노드들 중 적어도 하나에 대한 노드 간 최단 경로, 노드 별 클러스터링 계수, 노드 별 센트럴리티 계수를 포함하고,상기 노드들 사이의 연결선이 나타내는 상호 연관도의 범주에 따라 상기 연결선의 가중치가 다르게 설정되고, 상기 노드 간 최단 경로는 상기 설정된 가중치를 반영하여 산출되고,상기 일부 경로를 구성하는 노드는,상기 멀티오믹스 네트워크의 노드들 각각에 대한 상기 노드 간 최단 경로, 상기 노드 별 클러스터링 계수, 및 상기 노드 별 센트럴리티 계수 중 적어도 하나에 대한 표준 점수가 임계 값 미만인 노드와 상기 임계 값 미만인 노드의 연결선을 삭제함으로써 생성되고,상기 표준 점수는 상기 멀티오믹스 네트워크의 노드들 각각에 대한 상기 그래프 이론 지표의 지표값과 상기 멀티오믹스 네트워크의 노드들에 대한 상기 그래프 이론 지표의 평균 지표값 간의 차를 표준 에러로 나눈 값인 데이터 처리 방법.
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