초록

딥러닝을 이용한 프라임에디팅 효율 예측 시스템, 상기 시스템을 구축하는 방법, 상기 시스템을 이용한 프라임에디팅 효율 예측 방법 및 상기 방법을 컴퓨터로 실행하기 위한 프로그램이 기록된 컴퓨터 판독가능 기록매체를 제공한다.

대표청구항 ▼

프라임에디터(Prime editor)의 프라임에디팅(Prime editing) 효율에 대한 데이터를 입력받는 정보 입력부;상기 정보 입력부에서 입력 받은 데이터를 이용하여 프라임에디팅 효율에 영향을 미치는 특징과 프라임에디팅 효율 간의 관계를 학습하는 딥러닝을 수행하여 프라임에디팅 효율 예측 모델을 생성하는 예측 모델 생성부;프라임에디팅의 후보 표적 서열을 입력받는 후보 서열 입력부; 및상기 후보 서열 입력부에 입력된 후보 표적 서열을 상기 예측 모델 생성부에서 생성된 효율 예측 모델에 적용하여 프라임에디팅 효율을 예측하는 효율 예

프라임에디터(Prime editor)의 프라임에디팅(Prime editing) 효율에 대한 데이터를 입력받는 정보 입력부;상기 정보 입력부에서 입력 받은 데이터를 이용하여 프라임에디팅 효율에 영향을 미치는 특징과 프라임에디팅 효율 간의 관계를 학습하는 딥러닝을 수행하여 프라임에디팅 효율 예측 모델을 생성하는 예측 모델 생성부;프라임에디팅의 후보 표적 서열을 입력받는 후보 서열 입력부; 및상기 후보 서열 입력부에 입력된 후보 표적 서열을 상기 예측 모델 생성부에서 생성된 효율 예측 모델에 적용하여 프라임에디팅 효율을 예측하는 효율 예측부를 포함하는,딥러닝을 이용한 프라임에디팅(Prime editing) 효율 예측 시스템으로서,상기 프라임에디터는 프라임에디터2인 것이며,상기 프라임에디팅 효율에 대한 데이터는,pegRNA를 암호화하는 뉴클레오티드 서열 및 상기 pegRNA가 목적하는 표적 뉴클레오티드 서열을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 세포 라이브러리에 프라임에디터(Prime editor)를 도입하는 단계;상기 프라임에디터가 도입된 세포 라이브러리로부터 수득한 DNA를 이용하여 딥시퀀싱을 수행하는 단계; 및상기 딥시퀀싱으로 수득한 데이터로부터 프라임에디팅 효율을 분석하는 단계를 포함하는 방법을 수행하여 수득된 것이고, 상기 예측 모델 생성부는 pegRNA 및 표적 서열 정보로부터 프라임에디팅 효율에 영향을 미치는 특징을 추출하는 특징 추출 모듈을 포함하는 것인, 딥러닝을 이용한 프라임에디팅 효율 예측 시스템.