초록 ▼

문서암호 : www.kosen21.org

1. 분석자 서문
1990년대 들어 인간유전체 지도가 밝혀지고 유전체 및 단백질의 기능연구가 활발하게 이루어지면서 신약도출이 가능한 작용점의 수가 증대되었고, 화학, 생물학 등의 신약관련 학문분야뿐 아니라 장비의 개발, 분석기술개발, 컴퓨터 및 정보산업 등의 발전과 함께 구조기반 약물설계, 고속검색, 조합화학, 등의 새로운 기술 및 패러다임들이 신약개발연구에 적용되었다. 특히 컴퓨터를 이용하여 신약을 합리적으로 설계하고자 하는 기술은 1990년대 중반 이후 신약개발 연

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1. 분석자 서문
1990년대 들어 인간유전체 지도가 밝혀지고 유전체 및 단백질의 기능연구가 활발하게 이루어지면서 신약도출이 가능한 작용점의 수가 증대되었고, 화학, 생물학 등의 신약관련 학문분야뿐 아니라 장비의 개발, 분석기술개발, 컴퓨터 및 정보산업 등의 발전과 함께 구조기반 약물설계, 고속검색, 조합화학, 등의 새로운 기술 및 패러다임들이 신약개발연구에 적용되었다. 특히 컴퓨터를 이용하여 신약을 합리적으로 설계하고자 하는 기술은 1990년대 중반 이후 신약개발 연구에서 시간과 비용을 크게 감소시키는 효율성이 입증된 기술이다. 컴퓨터를 이용한 신약설계를 위해 가장 필수적인 표적단백질에 작용하는 약물 (리간드) 을 도킹시켜 상호작용을 분석하는 방법들은 많은 연구진들에 의해 개발되었으며, 그 가운데 분자동력학적 모의실험 방법 (Molecular dynamics simulation)은 단순화된 도킹방법들의 가장 큰 문제점으로 지적되었던 표적단백질의 유연성과 용매효과를 분자수준에서 고려할 수 있다는 장점을 지닌 방법으로 주목을 받게 되었다. 그러므로 본 분석에서는 신약설계에서 최근 유용하게 사용되는 분자동력학적 모의실험방법을 이용한 합리적인 신약개발 전략에 대해 살펴봄으로써 컴퓨터를 이용한 약물설계기술에 대한 이해를 돕고자 한다.

2. 목차
분석자 서문
1. 개요
1.1. 합리적인 신약설계
1.2. 표적단백질의 유연성
2. 도킹된 복합체 구조의 최적화
3. 자유에너지 계산
4. 분자동력학적 모의실험을 이용한 도킹
5. 결론
Reference


3. 원문정보
Alonso, Combining Docking and Molecular Dynamic Simulations in Drug Design, Medicinal Research Reviews, 2006, 2006년 12월

※ 이 자료의 분석은 KRICT의 강남숙님께서 수고해 주셨습니다.