초록 ▼

Empirical potential function을 이용하여 생물학적으로 큰 의미를 갖고 있는 두 가지의 다른 생체분자의 구조 연구를 수행하였다. 첫째, anthracycline 항생제인 daunomycin의 구조 연구로서, daunomycin자체의 구조 규명에 역할을 하는 것으로 보이는 D-ring 의 interconversion에 따른 conformational energy 을 backbone 의 torsion angles 을 변화 시키면서 계산하였다. 자유상의 daunomycin은 분자 내의 수소 결합으로 인하여 α-구조가

Empirical potential function을 이용하여 생물학적으로 큰 의미를 갖고 있는 두 가지의 다른 생체분자의 구조 연구를 수행하였다. 첫째, anthracycline 항생제인 daunomycin의 구조 연구로서, daunomycin자체의 구조 규명에 역할을 하는 것으로 보이는 D-ring 의 interconversion에 따른 conformational energy 을 backbone 의 torsion angles 을 변화 시키면서 계산하였다. 자유상의 daunomycin은 분자 내의 수소 결합으로 인하여 α-구조가 가장 안정함을 알았다.
둘째, Stentor coerleus의 광 혐기 반응 mechanism을 규명하는 과정에서, 일차적으로 해결 되어야 하는 proton 방출 mechanism을 이해하기 위하여, 광 수용체 분자 구조 연구에 중요한 자료가 되는 hypericin-linked dipeptide amides 의 구조 에너지를 이론적으로 계산하였다. Peptide의 carbonyl group과 chromophore 인 hypericin의 hydroxyl group 사이에 분자 내수소 결합이 이루어지므로써 hydroxyl group의 proton 방출이 촉진될 수 있음을 알았다. 또한 아미노산의 residue 의 종류는 구조의 안정도에 크게 영향을 주지 않음을 알았다.

Abstract ▼

Conformational study on the two physiologically significant biomolecules have been performed by using an empirical potential function. In the first place, the conformation of an anthracycline antibiotics daunomycin has been investigated varying backbone torsion angles along the interconversion of D-

Conformational study on the two physiologically significant biomolecules have been performed by using an empirical potential function. In the first place, the conformation of an anthracycline antibiotics daunomycin has been investigated varying backbone torsion angles along the interconversion of D-ring of daunomycin. It is proved that the α-conformation of daunomycin in a free state is the most stable one due to the intramolecular hydrogen bond. In the second place, the conformation of hypericin-linked dipeptide amides has been investigated to understand the proton dissociation mecnanism of Stentor coerleus upon the photo-excitation. It is found that the proton dissociation might be facilitated by the intramolecular hydrogen bond between hydroxyl group of hypericin and carbonyl group of peptide, and that the contribution of residues of amino acids to the stability of the dipeptide amides is to be of less consequence.

목차 Contents

• 생체 분자 구조에 관한 이론적 연구...1
• 표지...1
• 1. 서론...6
• 2. Daunomycin의 구조 연구...8
• 2.1 연구내용...8
• 2.2 방법...8
• 2.3 결과 및 토의...10
• 2.4 결론...12
• 3. $\underline{Stentor \: coerleus}$ 광수용체 분자의 구조 연구...13
• 3.1 연구내용...13
• 3.2 방법...13
• 3.3 결과 및 토의...15
• 3.4 결론...17
• 4. 참고문헌...19