초록 ▼

본 연구과제의 장기 목표는 Medicago의 구조유전체와 기능유전체를 연구하는데 있다. 그 일환으로 일단계에서는 Multiplex PCB 방법을 사용하여 1000개의 Medicago ESTs에 대한 BAC clones 찾고 띠를 이용하여 Medicago 대한 physical map을 작성하는데 두었다. 그 결과
1. Multiplex TCR 방법을 사용하여
① R-gene homologue
②일부 BAC end sequencing 의 결과에서 얻어진 EST marker
③ Arabidopsis 유전자와의 hom

본 연구과제의 장기 목표는 Medicago의 구조유전체와 기능유전체를 연구하는데 있다. 그 일환으로 일단계에서는 Multiplex PCB 방법을 사용하여 1000개의 Medicago ESTs에 대한 BAC clones 찾고 띠를 이용하여 Medicago 대한 physical map을 작성하는데 두었다. 그 결과
1. Multiplex TCR 방법을 사용하여
① R-gene homologue
②일부 BAC end sequencing 의 결과에서 얻어진 EST marker
③ Arabidopsis 유전자와의 homologue
④ Soybean RFLP probe와의 homology
⑤ medicage의 nodule-specific TC
⑥ 특정 metabolism에 관여하는 유전자 (brassinosteroids와 isoflavonoid 생합성) 등 800개 Orthologous유전자에 대한 BAC ID 규명
2. BAC database 자료 제공
전체 multiplex 결과는 www.medicago.plaptpath.cedacis.ede에 자료 게시.
3. fingerprinting메 의한 contig 작성과정과 상호 보완 작업 수행
4. 다른 작물과의 유전자 구조 비교에 대한 자료 제시 등을 수행하였다

Abstract ▼

Medicago truncatula, a model system of legume biology, is an annual. self-fertile plant with a small diploid genome (about 500 Mb), is amenable to efficient molecular, genetic, and reverse-genetic analysis, and has a lot of resources including 2 different BAC libraries. Recent cytogenetic analysis i

Medicago truncatula, a model system of legume biology, is an annual. self-fertile plant with a small diploid genome (about 500 Mb), is amenable to efficient molecular, genetic, and reverse-genetic analysis, and has a lot of resources including 2 different BAC libraries. Recent cytogenetic analysis in M. truncatula predicted that the gene-rich regions of the genome may be efficiently organized into as little as 100 Mbp of mostly continuous euchromatin. The result suggests that the combination of a physical map, BAC end sequencing, and assignment of the location for several thousand ESTs can delimit the gene rich portions of the genome, and lay the foundation for developing a low pass gene inventory for the gene rich regions of the genome. In order to assign the location of thousand ESTs to BAC, we developed a high throughput multiplex PCR analysis. The multiplex contains 13,824 BAC clones with an average insert size of 130 Kbp, representing 3X genome coverage. Up to now, we identified BAC IDs for about 800 ESTs including about 300 genetically mapped ESTs. Among them, about 500 BACs have been completely sequenced by Dr. Bruce Roe at University of Oklahoma. In addition, they were used for finger printing analysis which have been performed at Dr. Cook's lab in UCDavis, and acted as an anchor for integrating the genetic map into the physical map. These data will provide a good basis for map-based cloning of particular gene in further study.

목차 Contents

• 제 1 장 연구개발과제의 개요...9
• 제 1 절 연구개발의 목적 및 필요성...9
• 제 2 절 연구 범위...10
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황...11
• 제 3 장 연구개발 수행 내용 및 결과...13
• 제 1 절 연구 방법...13
• 1. BAC DNA 추출...13
• 2. Multiplex pooling strategy...13
• 3. PCR screeing...14
• 4. BAC clone analysis...15
• 제 2 절 연구 내용 및 결과...15
• 1. Multiplex pool 및 screening...15
• 2. 800개 EST에 대한 BAC ID 규명...15
• 3. Medicago BAC data base 구축...17
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도...18
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획...20
• 제 6 장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보...21
• 제 7 장 참고문헌...22
• 첨부자료 1-11...23