보고서 정보
주관연구기관 |
질병관리본부 Korea Center for Diease Control and Prevention |
연구책임자 |
이영선
|
참여연구자 |
정경태
,
유재일
,
유정식
,
이경민
,
정영희
,
신은심
,
정순임
,
윤선한
,
황민
,
고주현
,
박상훈
,
강경국
|
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 |
한국어
|
발행년월 | 2007-11 |
과제시작연도 |
2007 |
주관부처 |
식품의약품안전청 |
사업 관리 기관 |
식품의약품안전청 Korea Food & Drug Administration |
등록번호 |
TRKO200800006407 |
과제고유번호 |
1475003278 |
사업명 |
식품규격및안전관리 |
DB 구축일자 |
2013-04-18
|
키워드 |
메티실린.반코마이신.황색포도구균.장구균.Methicillin.vancomycin.Staphylococcus aureus.Enterococcus.PFGE.MLST.
|
초록
▼
1) 임상센터에서 분리된 분리주의 내성률
- 2007년 임상센터를 통한 의원급에서 분리된 황색포도상구균에서 MRSA 율과 장구균의 VRE 내성률은 각각 55.6%, 18.4%로 나타났다.
2) 내성 유전자의 검출
- 식품(4.9%)이나 동물(2주), 화장실이나 문고리(25%) 등에서도 MRSA가 검출되었으며 MRSA에서의 ermA 유전자가 95%이상 aac(6′)-Ie aph(2″)-I a는 77.1% 이상을 차지하였다.
- 반코마이신 내성 장구균에서는 ermB가 85% 이상을 차지하고 aminoglycosid
1) 임상센터에서 분리된 분리주의 내성률
- 2007년 임상센터를 통한 의원급에서 분리된 황색포도상구균에서 MRSA 율과 장구균의 VRE 내성률은 각각 55.6%, 18.4%로 나타났다.
2) 내성 유전자의 검출
- 식품(4.9%)이나 동물(2주), 화장실이나 문고리(25%) 등에서도 MRSA가 검출되었으며 MRSA에서의 ermA 유전자가 95%이상 aac(6′)-Ie aph(2″)-I a는 77.1% 이상을 차지하였다.
- 반코마이신 내성 장구균에서는 ermB가 85% 이상을 차지하고 aminoglycoside의 내성유전자는 aac(6′)-Ie aph(2″)-I a가 우세하였다. Q/D내성 가축분리주와 임상분리주에서 vatE 유전자(39주)가 검출되었고 vatE의 염기서열을 분석한 결과 돼지와 임상을 비롯하여 5주에서 vatE-3형을 확인하였다.
3) 유전자의 구조분석
- MRSA의 SCCmec type은 3차 병원에서는 typeII와 typeIII가, 1,2차 병원에서는 typeII가, 호흡기 감염증환자에서는 typeIV가, 동물이나 식품, 환경에서의 분리주는 typeII나 typeIV인 것으로 확인되었다.
- VRE에서 Tn1546의 구조를 확인한 결과 동물주에서 분리된 VRE는 9주를 제외한 나머지가 prototype인 BM4147과 동일한 것으로 확인되었고, 1,2차와 3차 병원에서 분리된 임상주는 orf1 부분이 없는 type이 가장 많은 것으로 확인되었다. Streptogramin A acetyltransferase의 유전자 vatE-ermB의 유전자 구조에서 연관성 확인한 결과 앞쪽에 1kb 정도 떨어진 것은 4주, 3kb 정도 떨어진 것은 4주였으며 나머지는 PCR 단편이 확인되지 않았다.
4) 병원성인자 확인
- MRSA에서 생성된 독소유전자형을 SCCmec type에 따라 분류하였다. TypeII에서의 장독소는 seg/sei/test-1이 주를 이루었고 typeIII는 sea 또는 독소 유전형이 검출되지 않았고, typeIV에서는 seg/sei가 우세하였다. PVL 유전자는 임상 2주와 동물 2주에서 확인되었다. 황색포도상구균에서 병원성을 높이는 arginine catabolic mobile element (ACME)의 유전자 arcA는 1,2차 의료기관에서 분리된 638주의 MRSA를 대상으로 확인하였을 때 29주에서 확인되었으며, SCCmec typeII와 typeIV에서만 확인되었다.
- E. faecium의 반코마이신과 streptogramin 내성분리주에서 병원성인자 esp, hy1의 특성 조사한 결과 임상주에서는 대부분 esp와 hy1 유전자가 발견되었으나 동물주와 건강인에서 분리된 장구균에서는 gel이나 asa 유전자만 검출되었다. 그러나 E. faecalis에서는 esp 유전자가 동물주, 건강인, 양식장에서도 검출되었고, cy1 유전자는 건강인과 동물주에서 1주씩 확인되었다.
5) PFGE 및 MLST 분석
- 황색포도상구균에서 PFGE와 MLST 유형을 확인한 결과 임상주에서는 SCCmec type과 연관성이 많았으며 typeII는 ST5, typeIII는 ST239, typeIV는 ST1이나 ST72, 동물이나 환경, MSSA 분리주에서는 ST 형이 다양하였다.
- VRE와 streptogramin A/B 내성주에서는 가축분리주의 경우 같은 농장에서 분리된 E. faecium의 경우는 PFGE나 MLST 유형에서 동일형으로 나타났으나 임상에서는 ST15나 ST78이 주를 이루고 있었으나 PFGE 유형에서는 다양한 것으로 확인되었다.
6) 임상에서 분리된 내성주와 비임상에서 분리된 내성주의 연관성 파악
- 황색포도상구균의 임상주에서 많이 나타나는 ST 형인 ST1과 ST72가 비임상 분리주에서 각각 1주씩 확인되었고 이들은 임상분리주의 MSSA나 MRSA에서도 같은 ST형을 가지며 유사한 PFGE 형을 갖고 있어 임상 및 비임상 간의 전파 가능성이 있는 것으로 나타났다. 그러나 PVL을 갖고 있는 임상주와 동물주는 서로 연관성이 없는 것으로 나타났하게 나타났다.
Abstract
▼
1) The resistance rates of isolates from clinics
The rates of MRSA and VRE isolated from clinics were 55.6% and 18.4%, respectively.
2) Detection of resistant genes
- mecA gene was detected from S. aureus isolates from foods (4.9%), animals (two) and rest rooms (25%). MRSA carried the ermA
1) The resistance rates of isolates from clinics
The rates of MRSA and VRE isolated from clinics were 55.6% and 18.4%, respectively.
2) Detection of resistant genes
- mecA gene was detected from S. aureus isolates from foods (4.9%), animals (two) and rest rooms (25%). MRSA carried the ermA gene (95%) and aac(6′)-Ie aph(2″)-I a (77.1%).
- VRE carried ermB (85%) and aac(6′)-Ie aph(2″)-I a was superior in VRE. The sequences of the vatE gene in 39 Q/D resistant E. faecium from pigs, poultry and clinics were determined; only five isolates were vatE-3 type; the rest were vatE-1.
3) Gene structure
- In MRSA, Type II and III of the Type SCCmec were shown in tertiary hospitals, TypeII in non-tertiary hospitals, TypeIV in patients with acute respiratory syndrome and Type II and Type IV in animals, foods and the environment.
- The structure of Tn1546 of VRE isolated from animals was identical to that of BM4147 and over 50% of VRE isolated from patients belonged to TypeIII. Distance of vatE-ermB in Q/D-resistant E. faecium was 1kb in four strains and 3kb in another four strains.
4) Virulence marker
- In toxin types based on SCCmec, seg/sei/tsst-1 was superior to Type II, sea or none in Type III and seg/sei in TypeIV. The PVL gene was detected in two isolates from animals and two from patients. In MRSA, the detection of the arc gene was observed from SCCmer Type II and IV was 4.5% in non-tertiary hospitals.
- The major virulence factors were esp and hy1 in E. faecium isolates from patients; however gel and asa genes were detected in isolates from animals and the environment. In E. faecalis, the esp gene was detected in isolates from animals, healthy humans, and fish farms.
5) PFGE and MLST
- In S. aureus isolates from patients, patterns of PFGE and MLST were closely related in SCCmec and ST5 was predominant in Type II, ST239 in TypeIII; ST1 and ST72 existed in Type IV. ST types were diverse in isolates from animals and the environment.
- In VRE from patients, ST15 and ST78 in MLST were the predominant type and PFGE patterns were diverse.
6) Relation of isolates from human and non-human
- In S. aureus, ST types in isolates from non-human were ST1 and ST72 and those types were identical to isolates from humans and non-humans, ST types and PFGE patterns of MRSA from patients were observed in MSSA.
- The patterns of PFGE and ST type of MLST in vatG containing E. faecium isolates from healthy humans and animals differed from each other. The pattern of PFGE and ST type (ST12) of MLST of one strain from healthy humans was identical to those of isolates from animals.
목차 Contents
- 용역연구사업 연구결과보고서 ...1
- 제출문 ...2
- 목차 ...3
- I. 연구개발결과 요약문 ...4
- 연구결과보고서 요약문 ...4
- Summary ...6
- II. 총괄연구개발과제 연구결과 ...8
- 제1장 연구개발과제의 최종 연구개발 목표 ...8
- 1.1 연구개발과제의 목표 ...8
- 1.2 연구개발과제의 목표달성도 ...11
- 1.3 국내.외 기술개발 현황 ...12
- 제2장 연구개발과제의 최종 연구개발 내용 및 방법 ...17
- 2.1 연구내용 ...17
- 2.2 연구방법 ...19
- 제3장 연구개발과제의 최종 연구개발 결과 ...27
- 3.1. 임상센터에서 분리된 분리주의 특성 및 항생제 내성률 ...27
- 3.2. 2007년 의원급에서 분리된 황색포도상구균과 장구균의 특성 ...28
- 3.3. 내성균의 분자유전학적 특성조사 ...28
- 3.3.1. 황색포도상구균 ...28
- 3.3.2. 장구균 ...40
- 제5장 총괄연구개발과제의 연구성과 ...46
- 5.1 활용성과 ...46
- 5.2 활용계획 ...47
- 제7장 참고문헌 ...47
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