초록 ▼

■ Tissue Microarray(TMA)와 array CGH(aCGH) 실험 데이터의 객체 모델 구현 및 운용
▶ DNA 마이크로어레이의 국제표준 모델(OM/MAGE-ML)을 수용할 수 있는 모델로 발전
▶ CDE, HL-7 임상문서구조(CDA) 및 CAP Cancer Protocol을 기반으로 이용하여 암 임상정보와의 연동 및 확장
▶ UML을 이용한 객체 운연 유즈케이스 모델링, 암 유전체 연구 국제표준으로 제안 운용
■ TMA와 암 임상정보 통합 데이터베이스 구축
▶ 웹 기반의 임상정보와 TMA발

■ Tissue Microarray(TMA)와 array CGH(aCGH) 실험 데이터의 객체 모델 구현 및 운용
▶ DNA 마이크로어레이의 국제표준 모델(OM/MAGE-ML)을 수용할 수 있는 모델로 발전
▶ CDE, HL-7 임상문서구조(CDA) 및 CAP Cancer Protocol을 기반으로 이용하여 암 임상정보와의 연동 및 확장
▶ UML을 이용한 객체 운연 유즈케이스 모델링, 암 유전체 연구 국제표준으로 제안 운용
■ TMA와 암 임상정보 통합 데이터베이스 구축
▶ 웹 기반의 임상정보와 TMA발현의 통합 분석 데이터베이스 설계 및 개발
▶ 웹-관계형 데이터베이스 기반의 LIMS 구축
▶ NCI CDE, CDA 및 CAP Cancer Protocol을 포함하는 암 임상정보의 통합 처리 기술 개발
▶ DNA 마이크로에레이 정보도 함께 처리할 수 있는 유연한 설계
■ XML기반 미들웨어 및 인터페이스 개발
▶ XML 메시징, 파싱 및 데이터베이스에 입력을 위한 구문 해석기 적용
▶ 데이터베이스 정보를 XML로 변환 출력하는 변환기의 통합
■ 웹 기반 통합 분석 시스템 개발
▶ TMA 및 aCGH 데이터의 transfromation, normalization, filtering 등의 자료 전처리
▶ Diagnostic plot 등 Data와 Result의 multimodal visulization
▶ Statistical Analysis tools 개발 및 웹 기반 통합
▶ Supervised and unsupervised machine lerning algorithms and Data mining tools
▶ 전 과정이 데이터베이스와 연결된 일괄적 수행

Abstract ▼

① Implementation and application of object model for experimental data from TMA and aCGH
● Development of data model that should be designed with consideration of extensibility for integration with MAGE-OM/ML which are international standardization of DNA microarray.
● Extension with clinical

① Implementation and application of object model for experimental data from TMA and aCGH
● Development of data model that should be designed with consideration of extensibility for integration with MAGE-OM/ML which are international standardization of DNA microarray.
● Extension with clinical and histopathologic information based on CDE, HL-7 CDA, and CAP Cancer protocol.
● Use case modeling of Application object using UML for international standardization of genomic medicine.
② Development of a database management system for TMA experimental data with clinical and histopathologic information
● Database system for web-based analysis of clinical information and TMA expression data
● Development of LIMS based on web relational database
● Development of integrated technology of cancer clinical information for including NCI CDE, CDA, and CAP Cancer Protocol.
● Design the system with flexibility that supports diverse experimental designs.
③ Development of middlewae and interface based XML
● Syntactic interpreter for inserting into the database and XML messaging and parsing.
● Integration database with XML exchanger.
④ Development of web-based and integrated analysis system
● Data preprocessing: transformation, normalization, and filtering of TMA and aCGH data

목차 Contents

• 표지...1
• 제출문...2
• 보고서 초록...3
• 요약문...4
• SUMMARY...7
• 목차...12
• 제 1 장 연구개발과제의 개요...13
• 1. 연구개발의 목적...13
• 2. 연구개발의 필요성...13
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황...14
• 1. 데이터베이스...14
• 2. 분석 도구...16
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과...19
• 1. 연구개발 수행 내용...19
• 2. 연구개발 수행 결과...20
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도...24
• 1. 연구개발 목표의 달성도...24
• 2. 기술발전에의 기여도...24
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획...26
• 제 6 장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보...27
• 1. 국제적 동향...27
• 2. 국내 동향...27
• 제 7 장 참고문헌...28