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자생식물 유전자 DB구축 운용
Construction and utilization of plant EST DB 원문보기

보고서 정보
주관연구기관 서울대학교
Seoul National University
연구책임자 최도일
참여연구자 오상근 , 박민규 , 염선인 , 김현정 , 김승일 , 이현아
보고서유형최종보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2010-03
과제시작연도 2007
주관부처 과학기술부
사업 관리 기관 한국과학재단
Korea Science and Engineering Foundtion
등록번호 TRKO201000012496
과제고유번호 1355049299
사업명 21세기프론티어연구개발사업
DB 구축일자 2013-04-18
키워드 식물유전정보.데이터베이스.생물정보.유전자발현 프로파일.plant bioinformatics.genome database.gene expression profile.

초록

자생식물 유전체 기능 연구를 위한 정보기지 구축 및 운용 과제를 수행하여 약용식물의 EST DB 구축, 식물유전정보 분석시스템, 고추유전자색인 데이터 베이스, 고추 유전자 발현 프로파일 데이터베이스, 가지과식물의 유전정보 데이터 베이스,
국제컨소시엄 토마토 게놈프로젝트를 위한 정보 분석 및 데이터베이스를 구축 하여 인터넷을 통하여 일반연구자에게 공개하고 있으며 2003년부터 2005년까지 세계 14개국에서 약 3백 25만회의 접속건수를 달성하여 생물정보 데이터 베이스로서의 위상을 확보하고 있음. 현재까지 약 130만 건의 식물

Abstract

Research of endemic plants functional genomics for DB construction and management of bioinformatics were performed. It develops the medicinal plant EST DB construction, plant genome information analysis system, pepper gene index DB, pepper gene expression profile DB, solanaceae gene index DB and int

목차 Contents

  • 표지 ...1
  • 제출문 ...2
  • 보고서 초록 ...3
  • 요약문 ...4
  • SUMMARY ...6
  • CONTENTS ...7
  • 목차 ...8
  • 제1장 연구개발과제의 개요 ...9
  • 1. 연구개발의 목적 및 필요성 ...9
  • 2. 연구개발의 범위 ...10
  • 제2장 국내외 기술개발 현황(국내.외 관련분야에 대한 기술개발현황과 연구결과가 국내.외 기술개발현황에서 차지하는 위치 등을 기술) ...11
  • 1. 본연구기관 기술개발 현황 ...11
  • 2. 국내 타기관 기술개발 현황...11
  • 3. 국외 기술개발 현황...11
  • 4. 국내.외 기술개발현황에서 차지하는 위치...11
  • 제3장 연구 개발 수행 내용 및 결과 ...12
  • 1. 약용식물 EST DB 구축...12
  • 2. 식물유전정보분석 시스템 구축...16
  • 3. 고추 유전자색인 테이터베이스 구축...20
  • 4. 고추 유전자발현프로파일 DB 구축...61
  • 5. 가지과식물 유전정보 DB 구축...69
  • 6. 국제 가지과식물 게놈프로젝트 DB 구축...88
  • 7. Pepper EST 재분석 DB구축...96
  • 8. NCBI dbEST data 업데이트 반영 후 재분석...98
  • 9. 약용식물(medical plants) EST 재분석...99
  • 10. vitis vinifera vs. 원예연구소 grape EST data 비교 및 분석...101
  • 11. tomato EST 재분석...102
  • 12 .Pepper protease 분석...103
  • 13. pattern recognition protein (PRR) 분석 - pepper, tomato, potato...104
  • 14. Cis-element analysis mapping on the tomato BAC...105
  • 15. SNP Analysis...108
  • 16. Intron finding from counsensus sequence...110
  • 17. Automatic primer design for intron amplification...111
  • 18. PGC...112
  • 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...113
  • 가. 추진목표 ...113
  • 나. 달성내용...113
  • 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...118
  • 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...124

표/그림 (10)

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참고문헌 (25)

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