보고서 정보
주관연구기관 |
질병관리본부 Korea Center for Diease Control and Prevention |
연구책임자 |
이복권
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보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 |
한국어
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발행년월 | 2009-04 |
과제시작연도 |
2008 |
주관부처 |
식품의약품안전청 |
사업 관리 기관 |
식품의약품안전청 Korea Food & Drug Administration |
등록번호 |
TRKO201000014907 |
과제고유번호 |
1475003777 |
사업명 |
식품등안전관리 |
DB 구축일자 |
2013-04-18
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키워드 |
살모넬라.항생제 내성.파아쥐타이핑.피에프지이.Salmonella. Antibiotic resistance.PFGE.Phage typing.
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초록
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본 과제는 사람과 동물에서 분리된 살모넬라균을 대상으로 항생제 내성시험 및 분자역학적인 시험을 통하여 내성균의 분포 및 내성의 경향을 분석하고, 역학연구를 통하여 사람과 동물에서의 살모넬라 유행주를 분석하기 위하여 연구를 수행하였다. 대상 살모넬라 분리주는 사람에서 분리한 S. Enteritidis 141균주, S. Typhimurium 83균주와 동물 및 가축에서 분리한 S. Enteritidis 54균주, S. Typhimurium 128균주를 대상으로 하였다.
1.사람과 동물에서 분리된 살모넬라균의 항생제 내성 및 다제내
본 과제는 사람과 동물에서 분리된 살모넬라균을 대상으로 항생제 내성시험 및 분자역학적인 시험을 통하여 내성균의 분포 및 내성의 경향을 분석하고, 역학연구를 통하여 사람과 동물에서의 살모넬라 유행주를 분석하기 위하여 연구를 수행하였다. 대상 살모넬라 분리주는 사람에서 분리한 S. Enteritidis 141균주, S. Typhimurium 83균주와 동물 및 가축에서 분리한 S. Enteritidis 54균주, S. Typhimurium 128균주를 대상으로 하였다.
1.사람과 동물에서 분리된 살모넬라균의 항생제 내성 및 다제내성
사람에서 분리된 S. Enteritidis의 경우 ampicillin, ticarcillin, streptomucin에 대한 내성이 각각 49.6%m 48.9%, 44.7%로 가장 높게 나타났다. S. Typhimurium은 tetracycline과 streptomycin에 대한 내성이 각각 67.5%와 59%로 가장 높게 나타났다. 사람에서 분리된 S. Enteritidis는 4약제 다제내성주가 가장 많이 나타났다. S. Typhimurium은 6약제에 대한 내성주가 12주로 가장 많았다. 동물에서 분리한 S. Typhimurium은 1약제내성, 3약제내성, 7약제내성균이 확인되었다. S. Enteritidis은 5주가 2약제 이상의 항생제에 내성을 가지고 있었다. 대표적인 내성양상으로는 NA이며, 38주가 확인되었다.
2. 살모넬라균의 내성에 대한 통계학적 비교분석
S. Typhimurium에 대한 $X^2$ 통계분석을 해본 결과 사람보다 동물분리주에서 항생제 내성이 높게 나타났다 (P value < 0.05). 로 나타난 streptomycin, cephalothin, sulfamethoxazole/ trimethoprim 항생제에 대한 내성이 동물분리주에서 두배이상 높으로 것으로 나타났다. S. Enteritidis는 사람분리주가 동물분리주보다 streptomycin, chloramphenicol, ampicillin에 대한 항생제 내성이 높은 것으로 확인되었다. 축종별 항생제 내성을 비교한 결과 돼지에서 항생제 내성이 가장 높게 나타났다.
3. 사람과 동물에서 분리한 살모넬라에 대한 내성기전 연구
사람분리 S. Enteritidis 1주에서 ESBL (CTX-M-14) 생성을 확인하였다. 사람 분리주와 동물 분리주 6주에서 PABL CMY-2 유전자가 확인되었다. PABL 양성균주는 모두 S. Typhimurium이었으며, 3주는 돼지에서 분리된 균주였다. PABL 양성인 6주에 대한 PFGE에서 사람 분리주 3주와 동물 분리주 3주는 각각같은 PFGE 유형을 나타냈고, 1 band의 차이로 유전적으로 매우 높은 연관성을 나타내었다. Nalidixic acid 내성균을 대상으로 qnr 유전자를 확인한 결과 qnrA 유전자 양성인 균주는 없었으며, 2주가 qnrS 양성이었다. qnrS 양성인 2균주 중, 1주는 식품에서 분리된 균주이었고, 다른 1주는 돼지에서 분리된 균주이었다. 내성 Integron 유전자에 대한 확인결과 사람분리주에서는 16주 (7.17%), 동물분리주에서는 19주 (10.4%)에서 Class 1 integron이 확인 되었고, 모두 Salmonella Typhimurium에서 확인되었다.
4.분자역학연구(PFGE, Phage typing)
사람에서 분리된 S. Typhimurium에 대한 PFGE 시험결과 가장 많이 나타난 pattern은 HSPXX01.009 으로 전체 83주 중 25주 (30.1%)에서 동일한 band pattern으로 확인되었다. Phage typing 자료와 비교분석해보면 전체 HSPXX01.009 pattern 25주 중에 11주가 U302형으로 나타났다. 동물 및 축산물유래 살모넬라에서는 ASPXX01.013과 ASPXX01.026, ASPXX01.029 pattern 3가지가 가장많이 나타났으며, 특히 돼지 유래 와 조류 및 축산물유래의 PFGE pattern이 상이하게 관찰되었다. 사람과 동물에서 분리된 S.Typhimurium은 HASPXX01.017 pattern이 45주로 가장 많이 나타났으며 공통된 오염원으로 추정된다. 2005년에는 HASPXX01.052 pattern이 유행하였고, 2006년과 2007년에는 HASPXX01.017 pattern이 유행한 것으로 판단된다.
사람에서 분리된 S. Enteritidis에서 가장 많이 나타난 pattern은 HSEGX01.005 으로 52주 (36.9%)에서 동일한 pattern으로 확인되었다. 동물에서 가장많이 나타난 pattern은 ASEGX01.003이 33주 (65%)로 나타났으며, 대부분 poultry와 meat에서 분리되었다. 사람과 동물에서는 HASEGX01.003 pattern이 85 (43.5%)주로 공통오염원으로 추정된다. 사람과 동물에서 분리된 S.Enteritidis에서 공통적으로 확인된 phage type은 PT1형이 각각 42주, 3주 그리고 PT3형이 각각 10주, 10주로 확인되었다. 사람과 동물에서 분리된 S.Typhimurium에서공통으로 확인되는 phage type은 U302형이 각각 34주, 13주로 DT193형이 각각 6주, 8주로 확인되었다.
Abstract
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This subject executed to antimicrobial experiment and molecular epidemiological study which was isolated Salmonella from Human and Animal. We analyzed the distribution and tendency of resistance. And we conducted a molecular epidemiological analysis and compared subtypes of S.Enteritidis and S.Typhi
This subject executed to antimicrobial experiment and molecular epidemiological study which was isolated Salmonella from Human and Animal. We analyzed the distribution and tendency of resistance. And we conducted a molecular epidemiological analysis and compared subtypes of S.Enteritidis and S.Typhimurium isolated from humans and animals using phage typing and PFGE. A total 195 isolates of S. Enteritidis and 201 isolates of S.Typhimurium were analyzed in this study during 2004~2007.
1. Antimicrobial resistance and multi-drug resistance of Salmonella isolates
Overall, S. Typhirmurium showed the highest rates of resistance rather than S.Enteritidis. Human S. Typhimurium isolates, there was an increase in resistance TE (67.5%), S (59%). In S.Enteritidis, the highest rates were observed for resistance to AM (49.6%) and TIC (48.9%) ). Animal and animal products S. Typhimurium isolates, there was an increase in resistance TE (77.3%) and S (77.3%). Human S.Typhimurium isolates, the highest rates were showed the six drug resistance. And S.Enteritidis isolates, the highest rates were showed the for drug resistance. Animal S.Typhimurium isolates, the highest rates were showed the one and three drug resistance.
2. Statistical analysis of antimicrobial resistance
S. Typhimurium isolates, the resistance rates of animal isolates showed in the $X^2$ statistical analysis so that it was high than human isolates (P value < 0.05). The treptomycin, cephalothin,, sulfamethoxazole/trimethoprim was over a twofold in the animal. S. Enteritidis, the resistance rates of Human isolates showed in the $X^2$ statistical analysis so that it was high than animal isolates (P value < 0.05). The streptomycin, chloramphenicol, ampicillin was over a for fold in the human.
3. Antimicrobial resistance mechanism study.
One S.Enteritidis isolate from human observed ESBL producing strain (CTX-M-14 type). PABL producing S. Typhimurium was observed six isolates in human (3 isolates) and animal (3 isolates). PFGE pattern of PABL producing strains was high degree of genetic association (1 band different). Qunolone resistance genes were tested with total 115 Salmonella isolates. Screening for qnr genes by multiplex PCR identified 2 isolates, with qnrS. One isolate was meat and other isolate was swine. PCR were used for screening and characterization of integron gene cassette. DNA sequencing analysis revealed the presence of 5 profiles of Class 1 integrons. All of the serovar were S. Typhimurium (Human 16isolates, Animal 19 isolates)
4. Molecular epidemiological study (PFGE, phage typing)
we conducted a molecular epidemiological analysis and compared subtypes of S.Typhimurium and S. Enteritidis isolated from human and animal using phage typing and PFGE. PFGE and phage typing was performed on 396 humans and chicken isolates. HSPXX01.009 PFGE pattern of S.Typhimurium were predominant pattern in total 83 human isolates (25; 30.1%). Major phage type was U302. And ASPXX01.013 (U302) pattern were predominant pattern in total 128 animal isolates. Interestingly, swine, poultry and meat showed different cluster group. A high degree of genetic association in human and animal was observed with HASPXX01.017 and HASPXX01.030. S.Enteritidis isolates, HSEGX01.005 pattern were predominant pattern in total 141 human isolates. Major phage type was PT1. And ASEGX01.003 pattern (PT3) was predominant pattern in total 54 animal isolates (33 isolates). A high degree of genetic association in human and animal was observed with HASEGX01.03 and PT1. 4 strains of the multidrug-resistant S.Typhimurium DT104 were characterized in this study.
목차 Contents
- 제출문 ...1
- 목차 ...3
- I. 연구개발결과 요약문 ...5
- 최종보고서 요약문...5
- Summary...6
- II. 총괄연구개발과제 연구결과 ...7
- 제1장 총괄연구개발과제의 최종 연구개발 목표 ...7
- 제2장 총괄연구개발과제의 최종 연구개발 내용 및 방법 ...13
- 제3장 총괄연구개발과제의 최종 연구개발 결과 ...25
- 제4장 총괄연구개발과제의 연구결과 고찰 및 결론 ...88
- 제5장 총괄연구개발과제의 연구성과 ...93
- 제6장 기타 주요변경사항 ...95
- 제7장 참고문헌 ...97
- 제8장 첨부서류 ...100
- II. 제1 세부연구개발과제 연구결과 ...104
- 제1장 세부연구개발과제의 최종 연구개발 목표 ...105
- 제2장 세부연구개발과제의 최종 연구개발 내용 및 방법 ...110
- 제3장 세부연구개발과제의 최종 연구개발 결과 ...116
- 제4장 세부연구개발과제의 연구결과 고찰 및 결론 ...152
- 제5장 제1 세부연구개발과제의 연구 성과 ...155
- 제6장 기타 주요변경사항 ...156
- 제7장 참고문헌 ...157
- IV. 제2 세부연구개발과제 연구결과 ...164
- 제1장 세부연구개발과제의 최종 연구개발 목표 ...165
- 제2장 세부연구개발과제의 최종 연구개발 내용 및 방법 ...166
- 제3장 세부연구개발과제의 최종 연구개발 결과 ...171
- 제4장 세부연구개발과제의 연구결과 고찰 및 결론 ...179
- 제5장 제2 세부연구개발과제의 연구성과 ...179
- 제6장 기타 주요변경사항 ...181
- 제7장 참고문헌 ...181
- V. 제3 세부연구개발과제 연구결과 ...186
- 제1장 세부연구개발과제의 최종 연구개발 목표 ...187
- 제2장 세부연구개발과제의 최종 연구개발 내용 및 방법 ...189
- 제3장 세부연구개발과제의 최종 연구개발 결과 ...192
- 제4장 세부연구개발과제의 연구결과 고찰 및 결론 ...196
- 제5장 제3 세부연구개발과제의 연구성과 ...197
- 제6장 참고문헌 ...199
- 제7장 첨부서류 ...199
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