초록 ▼

본 총괄과제는 각 세부과제에서 확보된 한국에 서식하는 주요 생물종의 DNA 바코드 정보를 체계적으로 데이터베이스화하였다. Korea Barcode of Life Database System(KBOL)은 전체 132개의 프로젝트로 이루어져 있으며, 국내 2,074종을 3,639 DNA 바코드와 국외 3,468종 14,768 DNA 바코드를 수록하였다. 또한 DNA 바코드 활용을 위해 기본적인 BLAST 검색을 비롯하여 약 6,000종에 대해 통계 알고리즘인 hidden Markov model(HMM)을 적용한 분자검색 시스템을 구축하

본 총괄과제는 각 세부과제에서 확보된 한국에 서식하는 주요 생물종의 DNA 바코드 정보를 체계적으로 데이터베이스화하였다. Korea Barcode of Life Database System(KBOL)은 전체 132개의 프로젝트로 이루어져 있으며, 국내 2,074종을 3,639 DNA 바코드와 국외 3,468종 14,768 DNA 바코드를 수록하였다. 또한 DNA 바코드 활용을 위해 기본적인 BLAST 검색을 비롯하여 약 6,000종에 대해 통계 알고리즘인 hidden Markov model(HMM)을 적용한 분자검색 시스템을 구축하였고, 담수 어류의 종 판별용 DNA 칩과 종 특이적인 oligonucleotide 를 개발하였다. KBOL system을 이용하여 DNA 바코드 뿐만 아니라 다양한 관련 연구를 진행할 수 있고, 생물 다양성에 있어 특정 개체의 발견과 모니터링을 통한 보전 연구를 수행할 수 있게 된다.

Abstract ▼

The project, 'DNA barcode system for construction and management of major organisms from Korea' allowed to make biodiversity database system and to implement systematic management of biological resources through collaborations with three particular projects. The Korea Barcode of Life Datab

The project, 'DNA barcode system for construction and management of major organisms from Korea' allowed to make biodiversity database system and to implement systematic management of biological resources through collaborations with three particular projects. The Korea Barcode of Life Database System(KBOL) currently holds a collection of 17,507 barcode sequences from 132 projects, which were performed by using several genetic markers. For biological species identification, this system offers a sequence-similarity search(BLAST) and a highly reliable statistical search based on a profile hidden Markov model(HMM). We also designed DNA chips with an optimized set of species-specific oligonucleotide probes. Using the KBOL database system, researchers can explore DNA barcode as well as various related biological information and undertake conservation activities for biodiversity, including monitoring and detection of specific organisms.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 보고서 초록 ... 3
• 목차 ... 5
• 그림목차 ... 6
• 표목차 ... 6
• 요약문 ... 7
• SUMMARY ... 7
• 제1장 서론 ... 8
• 가. 연구개발의 중요성 및 필요성 ... 8
• 나. 연구개발의 국내외 현황 ... 10
• 다. 연구개발대상 기술의 차별성 ... 12
• 제2장 연구개발의 목표 및 내용 ... 13
• 가. 연구개발의 최종목표 ... 13
• 나. 연도별 연구개발의 목표 및 평가방법 ... 14
• 다. 연도별 추진체계 ... 15
• 제3장 연구개발 결과 및 활용계획 ... 16
• 가. 연구개발 결과 및 토의 ... 16
• 나. 연구개발 결과 요약 ... 62
• 다. 연도별 연구개발목표의 달성도 ... 63
• 라. 연도별 연구성과(논문.특허 등) ... 63
• 마. 관련분야의 기술발전 기여도 ... 66
• 바. 연구개발 결과의 활용계획 ... 67
• 제4장 참고문헌 ... 69
• 연구성과 활용계획서 ... 72
• 끝페이지 ... 88