보고서 정보
주관연구기관 |
순천향대학교 산학협력단 |
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 |
한국어
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발행년월 | 2011-04 |
과제시작연도 |
2007 |
주관부처 |
보건복지부 [Ministry of Health & Welfare(MW)(MW) |
등록번호 |
TRKO201100007882 |
과제고유번호 |
1465009280 |
사업명 |
보건의료기술 연구개발 |
DB 구축일자 |
2013-04-18
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키워드 |
천식.임상경과질병모델.유전체.천식예측 및 조기진단.조직 및 체액은행.Asthma.Disease model.Genomics.Asthma prediction and early diagnosis.Tissue & body fluid bank.
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DOI |
https://doi.org/10.23000/TRKO201100007882 |
초록
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o천식 및 천식아형 논문 62편, 천식아형 진단특허 42편, 아스피린 천식 진단 기술이전 1건. 국제협력 연구 논문 11편.
o임상자료 DB구축 및 Biobank운용: 14,230명의 호흡기환자 DB구축. 아스피린 천식(1479명), 스테로이드 반응환자(487명), 기도 개형환자(682명), Leukotriene길항제 사용환자(181명). 30,000건 시료수집, 2901건 B-cell line구축. 15회 국내, 1회 국외분양
o57억SNP genotype수행, 천식아형 198SNP, 아스피린 과민성 257SNP, 기도
o천식 및 천식아형 논문 62편, 천식아형 진단특허 42편, 아스피린 천식 진단 기술이전 1건. 국제협력 연구 논문 11편.
o임상자료 DB구축 및 Biobank운용: 14,230명의 호흡기환자 DB구축. 아스피린 천식(1479명), 스테로이드 반응환자(487명), 기도 개형환자(682명), Leukotriene길항제 사용환자(181명). 30,000건 시료수집, 2901건 B-cell line구축. 15회 국내, 1회 국외분양
o57억SNP genotype수행, 천식아형 198SNP, 아스피린 과민성 257SNP, 기도과민성 59SNP, IgE 231SNP, FEV1 68SNP발굴.
oGWAS이용, 6억9천만 genotype(아스피린 과민성 관련 11개 SNP개발)
o아스피린과민성 진단 콘텐츠개발: GWAS와 Arachidonate 경로유전자 (43개 SNP를 이용한 진단 콘텐츠개발)
o질병관련 SNP기능연구: 29건
o질병관련 유전자발굴: DD-PCR (20건 유전자)과 methylation microarray(아스피린천식 관련 384건 유전자)를 이용.
o기도세척액,혈장에서 천식관련 단백마커 16종, 아토피관련 단백마커 13종, 아스피린관련 단백마커 15종발굴
o폐섬유화증 250명 cohort구축, 관련 단백마커 25종개발
o천식 동물모델에서 천식치료제 개발을 위한 6종 후보 물질 전임상
Abstract
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Ⅰ. Background and Objectives : Disease specific genome studies have been in progress to reveal the genetic mechanisms of diseases and the different response of individuals to environments. Aims of the present study were to discover the diseases specific gene markers via genetic, proteomic and methyl
Ⅰ. Background and Objectives : Disease specific genome studies have been in progress to reveal the genetic mechanisms of diseases and the different response of individuals to environments. Aims of the present study were to discover the diseases specific gene markers via genetic, proteomic and methylation studies, and to develop the prevention and therapeutic strategy against asthma.
Ⅱ. Methods
Development of asthma and other lung disease (idiopathic interstitial lung disease) cohort and data base with maintenance of a biobank for B cell lines, tissues, body fluids and buffy coats. Genome wide association study and single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping were applied to discover the candidate SNPs to develop the diagnostic chip contents for asthma and aspirin hypersensitivity using statistical analysis. Function of SNPs was validated using measurement of the RNA and protein expression of the SNPs by target tissues. Candidate genes for asthma subtypes were discovered using Differential Display-PCR, and whole genome methylation assay.
Search for the candidate proteins for asthma in bronchoalveolar lavage, sputum and plasma and functional analysis was performed using 2 dimentional electrophoresis and Mass analysis. Preclincial anaimal studies were done to validate the therapeutic effect of the candidate gene or proteins.
Ⅲ. Results
o DB and Biobank: 14,230 subjects with respiratory diseases including 8191 asthmatics and more than 30,000 samples (DNA, tissues, plasma, urines and other biospecimen). 15 local donations, one international donation.
o Asthma subphenotypes cohort : 1479 asthmatics challenged with aspirin, 487 asthmatics with steroid response, 682 asthmatics with airway remodelling, 181 asthmatics with leukotriene antagonist trial.
o 57 millions' SNPs were genotyped using several methods including Genome Wide Scan (GWAS)
o The number of SNPs associated with asthma and asthma sub-phenotypes: asthma : 198 SNPs, aspirin hypersensitivity : 257 SNPs, airway hyper-reactivity : 59 SNPs, IgE : 231 SNPs, FEV1 : 68 SNPs,
o Function study of the asthma and subphenotypes - associated SNPs : 29 SNPs
o Total 62 Publications and 42 licenses: Clinical study (24 publications), asthma SNP (21 publications, 15 licences), aspirin hypersensitivity SNP (25 publications, 18 licenses), airway hyperreactivity SNP(3 publications, 3 licenses), eosinophil SNP (3 publications, 2 licenses), atopy SNP (9 publications, 4 licenses), Occupational asthma SNP (1 publication), steroid response SNP (1 license).
o License out of SNPs' contents to diagnose aspirin hypersensitivity using 43 SNPs
o International collaboration of 7 countries for asthma research (IL1RL1, Nature genetics)
o 28 asthma specific genes discovered by Differential display PCR including Myosin heavy chain
o 381 aspirin hypersensitivity related genes of altered methylation using Whole genome methylation scan o 15 Function study of the asthma and subtypes related SNPs (asthma: 9SNPs, ASA: 3SNPs, atopy:3SNPs건). o Discovery asthma related 91 proteins using 2DE proteomcis and MS/MS based on 9 publications (asthma: 3, ASA: 1, IPF: 1, Particle related : 2, Lung Ca : 2).
o Preclincal animal study with 6 candidate molecules (gamma secretase, Cytoplasmic doamin of CTLA-4, Asp-Tyr-leu-Lys, BLT2 inhibitor, Group-specific component protein, Apolipoprotein A1)
Ⅳ. Future application of the results
Furure development of first line molecular contents using genetic, genomic and proteomic candiates for convenient diagnostic tools of aspirin hypersensitivity in asthma and other asthma phenotypes such as steroid responsiveness will reduce the prevalence of severe asthmatics. These results will upgrade the national bio economics and international competition in bio-industry.
목차 Contents
- 1. 겉표지 (앞면) ...1
- 2. 제출문 ...3
- 3. 보고서 요약서 ...4
- 4. 요약문 (한글) ...5
- 5. 요약문 (영문) ...7
- 6. 연구 성과 실적 및 향후 계획 ...9
- 7. 참여연구원 현황표 ...31
- I. 총괄연구과제 연구결과 ...34
- 1. 연구개발과제의 배경 및 필요성 ...35
- 2. 국내외 기술개발 현황 ...41
- 3. 연구개발과제의 추진체계 ...43
- 4. 연구개발수행 내용 및 결과 ...44
- 5. 목표달성도 및 관련분야 기여도 ...45
- 6. 향후 연구성과 추진 계획 ...48
- 7. 연구개발결과의 파급효과 ...48
- 8. 연구개발결과의 활용계획 ...51
- 9. 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...53
- 10. 참고문헌 ...53
- II. 제 1세부 연구과제 연구결과 ...54
- 1. 연구개발과제의 목표 ...55
- 2. 연구개발과제의 추진체계 ...61
- 3. 연구개발수행 내용 및 결과 ...63
- 4. 참고문헌 ...114
- III. 제 2세부 연구과제 연구결과 ...115
- 1. 연구개발과제의 목표 ...116
- 2. 연구개발과제의 추진체계 ...119
- 3. 연구개발수행 내용 및 결과 ...121
- 4. 참고문헌 ...153
- IV. 제 3세부 연구과제 연구결과 ...155
- 1. 연구개발과제의 목표 ...156
- 2. 연구개발과제의 추진체계 ...159
- 3. 연구개발수행 내용 및 결과 ...161
- 4. 참고문헌 ...177
- VI. 제 4세부 연구과제 연구결과 ...181
- 1. 연구개발과제의 목표 ...182
- 2. 연구개발과제의 추진체계 ...185
- 3. 연구개발수행 내용 및 결과 ...187
- 4. 참고문헌 ...193
- VII. 첨부서류 ...195
- 목차 ...196
- 1. 자체평가의견서 ...197
- 2. 실적 증빙자료 ...202
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