초록 ▼

본 연구에서는 KISTI에서 EGEE 인프라 기반 위에 개발한 신약후보물질 탐색을 위한 e-Science 시범환경인 Large-scale in silico 가상스크리닝 환경의 유효성을 검증하기 위하여 최근 KISTI의 알파-아밀라아제 in silico 가상스크리닝 결과의 in vitro 시험을 진행하였으며, 사용자 친화적 워크벤치인 DrugScreener-G의 개발을 위한 생화학 자료를 제공하고, 말라리아 질병 관련 plasmepsin IV의 예비 신약 후보 물질의 제공 가능성을 확인하기 위한 in vitro 시험을 진행 함. 연구

본 연구에서는 KISTI에서 EGEE 인프라 기반 위에 개발한 신약후보물질 탐색을 위한 e-Science 시범환경인 Large-scale in silico 가상스크리닝 환경의 유효성을 검증하기 위하여 최근 KISTI의 알파-아밀라아제 in silico 가상스크리닝 결과의 in vitro 시험을 진행하였으며, 사용자 친화적 워크벤치인 DrugScreener-G의 개발을 위한 생화학 자료를 제공하고, 말라리아 질병 관련 plasmepsin IV의 예비 신약 후보 물질의 제공 가능성을 확인하기 위한 in vitro 시험을 진행 함. 연구 내용은
1. 당뇨병 관련 효소 발현체 확보(사람의 췌장 알파-아밀라아제 유전자 클로닝 및 발현) 및 단백질 생산 최적화; 알파 아밀라아제 활성 조건 최적화 및 저해 특성의 역학적 연구
2. 말라리아 질병 관련 plasmepsin IV에 대한 신약 후보 물질 제공
3. KISTI 주도 데이터 챌린지를 위한 데이터 챌린지 타깃 질병 주원인 단백질 3차원 구조 제공 - 사람말타아제 단백질의 데이터 챌린지의 생화학적인 준비, in silico 도킹
4. KISTI에서 국제 WISDOM 협력을 통해 개발 중인 그리드 기반 Lerge-scale in silico 가상스크리닝 통합 워크벤치인 DrugScreener-G를 연구 또는 교육에 직접 적용하여, DrugScreener-G를 통한 그리드 기반 Large-scale 가상스크리닝 서비스에 대한 Feedback 제공

Abstract ▼

1) In vitro validation of data challenge results of alpha-amylase from KISTI
- Expression of human alpha-amylase (HPA) and purification
- Biochemical characterization of HPA and in vitro inhibition tests for obtained potential inhibitors from in silico virtual screening
2) Characterization

1) In vitro validation of data challenge results of alpha-amylase from KISTI
- Expression of human alpha-amylase (HPA) and purification
- Biochemical characterization of HPA and in vitro inhibition tests for obtained potential inhibitors from in silico virtual screening
2) Characterization of potential inhibitors for malaria(especially against Plasmepsin IV) and determination of $IC_{50}$
3) Supply for the new target protein information (human maltase) to KISTI for in silico docking, and following docking data analyses
4) Validation of Drugscreener-G program which has been developed as a user friendly program by KISTI and supply for feedback for improvement

목차 Contents

• 표지 ...1
• 제출문 ...2
• 보고서 요약서 ...3
• 요약문 ...4
• Summary ...6
• Contents ...9
• 목차 ...10
• 표차례 ...11
• 그림 차례 ...12
• 제1장 연구개발과제의 개요 ...14
• 1절. 연구의 목적 ...14
• 2절. 연구의 필요성 ...14
• 제2장 국내외 기술개발 현황 ...18
• 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ...20
• 1절. 연구개발의 내용 및 범위 ...20
• 2절. 돌연변이체 발현 연구와 단백질 제해제 제시 - 말라리아의 저해제인 플라스멥신-4의 활성 제해재 개발 ...21
• 3절. 알파-아밀라아제의 제해제로서 아카보스에 대한 상대 활성 제시 - 활성 저해 역학연구, 저해 소재 제시 (20종 이상) ...25
• 4절. 1종 단백질 선정 및 Autodock 챌린지 위한 매개 변수 확보 - 단백질 제시, 매개 변수 확보 ...29
• 5절. DrugScreener-G의 완성을 위한 Feedback을 제공 ...36
• 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ...39
• 1절. 목표달성도 ...39
• 2절. 관련분야에의 기여도 ...40
• 제5장 연구개발결과의 활용계획 ...41
• 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ...41
• 제7장 참고문헌 ...42