초록 ▼

1. 생물정보시스템을 이용한 돼지 ESTs DB 구축, 자료관리 및 유용유전자 구조기능 예측(제 1 세부)
o 공개된 돼지 ESTs와 eDNA를 이용한 자체 Database 검색 System 구축(DB 구축.검색 개요 참조)
o Web을 통한 검색 System과 DB 국내활용 Service System 개발
o Web을 통한 검색 System과 DB 국내활용 Service 시험 운영
o 시험공시돈 확보와 능력검정 및 시료 채취
o 조직별 또는 성장단계별 cDNA와 ESTs 분류
o eDNA Chip

1. 생물정보시스템을 이용한 돼지 ESTs DB 구축, 자료관리 및 유용유전자 구조기능 예측(제 1 세부)
o 공개된 돼지 ESTs와 eDNA를 이용한 자체 Database 검색 System 구축(DB 구축.검색 개요 참조)
o Web을 통한 검색 System과 DB 국내활용 Service System 개발
o Web을 통한 검색 System과 DB 국내활용 Service 시험 운영
o 시험공시돈 확보와 능력검정 및 시료 채취
o 조직별 또는 성장단계별 cDNA와 ESTs 분류
o eDNA Chip 제작용 후보유전자 염기서열 확보와 구조 및 기능예측 Program 개발
o eDNA Chip 제작용 후보지역 선정 Program 개발
o eDNA Chip 제작용 후보지역 선정과 Primer Design
o 연구진 자체 확보 ESTs와 추가로 공개되는 eDNA 및 ESTs sequene를 포함하는 통합 DB 구축
o Web을 통한 검색 System과 DB 국내활용을 위한 Service 개시 및 보완
o 통합 DB Upgrade
o DNA Chip 분석결과의 주요 경제형질간 연관성 분석
o 발현양상 해석을 통한 유용유전자 대량 확보 및 연관 정보정리
2. eDNA chip을 이용한 돼지의 성장, 육질, 번식 유전자 기능분석 및 조기 선발용 Kit 개발(제 2 세부)
o 돼지 유전자원(ESTs) 확보 및 eDNA Chip 제작
o 돼지의 eDNA library를 이용한 대량의 ESTs 확보
- NCBI에 등록되어 경제형질과의 연관성이 예측된 ESTs clone의 primer 제작 및 clone 확보
- DNA Cloning, sequencing 에 의한 유전자원 확보
- PCR에 의한 DNA 농도 증폭 및 eDNA Chip 제작
o eDNA Chip을 이용한 유전자 발현양상 분석
- 돼지의 성장단계별, 육질별, 산자수별 관련조직으로부터 mRNA 분리 및 Hybridization 분석
- 돼지의 성장, 육질, 번식에 따른 분류된 그룹별 hybridization 분석 후 gene expression profiling
- 성장, 육질, 번식 유전자 확보
o 성장, 육질, 번식 유전자 기능분석
- 성장, 육질, 번식 유전자의 full-length sequence 확보
- 유전자의 genome안 존재 여부를 알아보기 위해 Southern blotting 실시
- 유전자의 정확한 발현 정도를 알아보기 위해 Northern blotting 실시
- 유전자의 단백질 발현 여부를 알아보기 위해 Western blotting 실시
- 조직을 이용한 in-situ hybridization 실시
o 능력검정 종돈의 검정성적별 High/Low 집단에 대한 주요 경제형질 유전자 재현성검증
o 성장, 육질, 번식 유전자의 기능 분석으로 조기 선발용 chip 제작 및 보급
o 성장, 육질, 번식 유전자의 기능 분석으로 조기 선발용 KIT 개발 및 농가 보급.판매

Abstract ▼

1. Pig ESTs DB construction by bioinformatics system, data management, and estimation of structure and function of useful genes (first sub-project)
o Implementation of internal database(DB) search syste~ using the opened pig ESTs and cDNA
o Development of web-based search system and DB localiz

1. Pig ESTs DB construction by bioinformatics system, data management, and estimation of structure and function of useful genes (first sub-project)
o Implementation of internal database(DB) search syste~ using the opened pig ESTs and cDNA
o Development of web-based search system and DB localization service system
o Classification of cDNA and ESTs by tissue and growth stage
o Securing of base sequence of candidate genes for making of cDNA chip and development of structure and function estimation program
o Implementation and upgrade of integrated DB including cDNA and ESTs sequence to be additionally opened as well as ESTs internally secured by the research staff
o Analysis of correlation among major economic traits for the results of DNA chip analysis
o Securing of useful genes in a large quantity through analysis of expression pattern and arrangement of related information
2. Analysis on growth, the quality of meat, and breeding gene function of pigs using cDNA chip and development of kit for early selection(second sub-project)
o Securing of pig gene resources(ESTs) and making of cDNA chip
o Analysis of gene expression using cDNA chip
o Analysis of growth, the quality of meat, and breeding gene function
o Reproducibility verification of major genes with economic traits for High/Low group by test record of performance-tested breeding pigs
o Making and distribution of chip for early selection through analysis of growth, the quality of meat, and breeding gene function
o Development of kit for early selection through analysis of growth, the quality of meat, and breeding gene function, and distribution and selling to farmhouses

목차 Contents

• 표지 ...1
• 제출문 ...3
• 요약문 ...4
• SUMMARY ...10
• CONTENTS ...17
• 목차 ...19
• 제 1장 서론 ...21
• 제 1절 연구개발의 목적 ...22
• 제 2절 연구개발의 필요성 ...22
• 1. 기술적 측면 ...22
• 2. 경제. 산업적 측면 ...23
• 3. 사회.문화적 측면 ...24
• 제 3절 연구개발의 범위 ...25
• 제 2장 국내외 기술개발 현황 ...26
• 제 1절 국외 관련기술의 현황 ...26
• 제 2절 국내 관련기술의 현황 ...29
• 제 3장 연구개발 수행 내용 및 결과 ...31
• 제 1절 생물정보 시스템을 이용한 돼지 ESTs DB 구축, 자료돤리 및 유용유전자 구조.기능 예측 ...31
• 1. 서설 ...31
• 2. 공개 ESTs DB 구축 및 검색 시스템 ...32
• 3. 시험 공시돈 확보 및 시료채취 ...34
• 4. cDNA chip 제작용 후보지역 선정 ...35
• 제 2절 cDNA chip에 의한 돼지의 성장, 육질, 번식 유전자 기능 분석 및 조기 선발용 KIT 개발 ...39
• 1. 서설 ...39
• 2. eDNA library 구축 및 유전자원ESTs) 확보 ...40
• 3. eDNA chip 제작 및 cDNA chip을 이용한 성장, 육질, 번식 유전자 발현양상 분석 ...48
• 4. 성장, 육질, 번식 유전자 기능분석 ...73
• 5. 능력검정 종돈의 검정성적별 High/Low 집단에 대한 주요 경제형질 유전자 재현성 검증 ...151
• 6. 성장, 육질, 번식 유전자의 기능분석 및 재현성 검증으로 우수한 종돈의 조기 선발용 chip 개발 ...159
• 7. RT-, Real time- PCR 기법에 의한 우수 종돈의 조기 선발 유전자 진단 기법 개발 ...166
• 8. DNA marker에 의한 성장 관련 유전자 진단 기법 개발 ...169
• 제 4장 연구개발목표 달성도 및 대외기여도 ...170
• 제 1절 연도별 연구 목표 ...170
• 제 2절 연구개발목표의 달성도 ...172
• 제 3절 관련분야의 기술발전에의 기여도 ...182
• 제 5장 연구개발결과의 활용계획 ...183
• 제 6장 기타 중요 변동사항 ...184
• 제 7장 참고문헌 ...185