가. 자생 멸종위기 생물종의 유전체 분석·연구 1) 우리나라 멸종위기 생물종의 미토콘드리아(동물) 또는 엽록체(식물)의 유전체 염기서열 결정 2) 유전자 배열 구조 및 특성 분석을 통해 분류군별 특성 파악 나. 주요 생물종의 집단분석용 마커 개발 및 유전다양성 연구 1) microsatellite, COI, cytochrome b 등 멸종위기생물종의 집단분석을 위한 분자 마커 개발 2) 개체군간 및 개체군내 유전적 다양성 분석 3) 유용 생물자원의 원산지 구별을 위한 마커 개발 다. 자생 야생생
가. 자생 멸종위기 생물종의 유전체 분석·연구 1) 우리나라 멸종위기 생물종의 미토콘드리아(동물) 또는 엽록체(식물)의 유전체 염기서열 결정 2) 유전자 배열 구조 및 특성 분석을 통해 분류군별 특성 파악 나. 주요 생물종의 집단분석용 마커 개발 및 유전다양성 연구 1) microsatellite, COI, cytochrome b 등 멸종위기생물종의 집단분석을 위한 분자 마커 개발 2) 개체군간 및 개체군내 유전적 다양성 분석 3) 유용 생물자원의 원산지 구별을 위한 마커 개발 다. 자생 야생생물자원으로부터 유용유전자 발굴·분석 1) 자생 유용 생물자원으로부터 전체 유전체 혹은 발현 유전체 염기서열을 차세대 염기서열 분석기법을 이용하여 확보. 2) 생물정보학을 이용한 유전체 서열 분석, 유용 유전자군 발굴 및 기능 분석
Abstract▼
Genes are fundamental units to determine the characteristics and functions of an organism, thereby confer genetic diversity. As such, assessments of genetic make-ups cannot be overemphasized for scientific conservation and magnagement of endangered species as well as sustainable use of biological r
Genes are fundamental units to determine the characteristics and functions of an organism, thereby confer genetic diversity. As such, assessments of genetic make-ups cannot be overemphasized for scientific conservation and magnagement of endangered species as well as sustainable use of biological resources. In this study, we have conducted genetic analyses of biological resources. In this study, we have conducted genetic analyses of important biological resources with three complementary approaches. At first, whole mitochondrial genomes of endangered species, including 4 avian (Haliaeetus albicilla, Pernis ptilorhynchus, Milvus migrans, Falco amurensis) and one mammalian (Hydroptes inermis) species, were analyzed. Mitochondrial genomes of 4 avian species were similar to previously known Falconiformes mitogenomes in their structure and size, while H. inermis mitogenome showed characteristic features of mammalian ones. At second, fast, easy, and cost-efficient way of molecular marker development for genetic diversity assessment was designed using Next Generation Sequencing technology. Microsatellite markers were selected from low depth genome sequences of endangered of vulnerable species of Triops longicaudatus, Aconitus coreanum, Paeonia obovata, and H. inermis, and successfully applied for differentiating individuals or populations of these species. Genetic diversity of red fox, Vulpes vulpes, individuals from northeast Asia was also evaluated using mitochondrial cytochrome b region as a molecular marker to provide genetic basis for restoration of endangered species. For the last part, genome and/or transcriptome of Korean native wild species were analyzed to provide basis for translational approaches for their sustainable use. Transcriptome sequences of Japanese thistle, Cirsium japonicum, was obtained using Illumina's HiSeq2000 platform from the combined RNAs of leaves, stems, roots, and flower to result in 88,130 contigs. About 220 genes involved in secondary metabolic process were identified after Gene Ontology assignment, and the expression of 20 genes involved in phenylpropanoid biosynthetic pathways were analyzed by RT-PCR. Draft whole genome sequences of a medicinal mushroom, Phellinus sp. nova were also analyzed. A total of 4,159 contigs encompassing 41.7Mb genome were obtained to annotate 8,999 consensus gene model followed by functional prediction.
목차 Contents
표지 ... 1
참여 연구진 ... 4
요약문 ... 6
목차 ... 10
표목차 ... 12
그림목차 ... 16
Abstract ... 18
I. 서언 ... 20
II. 멸종위기생물종 및 고유종의 소기관 유전체 특성규명 ... 26
가. 서 론 ... 28
나. 재료 및 방법 ... 29
다. 연구결과 ... 33
라. 고찰 ... 69
마. 참고문헌 ... 73
III. 주요 생물종의 집단분석용 마커 개발 및 유전다양성 연구 ... 76
1. 차세대염기서열분석법을 이용한 주요 생물종의 집단분석용 마커개발 ... 78
가. 서론 ... 78
나. 재료 및 방법 ... 79
다. 연구결과 ... 84
라. 고찰 ... 93
마. 참고문헌 ... 95
2. Next generation sequencing(NGS) 방법을 이용한 고라니의 micorsatellite 마커 개발 및 다양성 분석 ... 98
가. 서 론 ... 98
나. 재료 및 방법 ... 100
다. 연구결과 ... 103
라. 고찰 ... 112
마. 참고문헌 ... 115
3. 유전자 분석을 통한 한국여우의 유전다양성 규명 ... 119
가. 서 론 ... 119
나. 재료 및 방법 ... 121
다. 연구결과 ... 124
라. 고찰 ... 130
마. 참고문헌 ... 133
IV. 야생생물유래 유용유전자 발굴·분석 ... 138
1. 야생 식물자원(엉겅퀴)의 전사체 분석 및 생리활성 물질 생합성 유전자 대량탐색 ... 140
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