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NTIS 바로가기주관연구기관 | (주)천랩 |
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보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 | 한국어 |
발행년월 | 2013-12 |
과제시작연도 | 2013 |
주관부처 | 보건복지부 [Ministry of Health & Welfare(MW)(MW) |
등록번호 | TRKO201400011513 |
과제고유번호 | 1465014571 |
사업명 | 감염병관리기술개발연구(구.질병관리연구지원) |
DB 구축일자 | 2014-07-05 |
키워드 | 카바페넴 내성.전유전체 분석.Carbapenem resistant.whole genome sequence analysis. |
DOI | https://doi.org/10.23000/TRKO201400011513 |
국내 분리 카바페넴 내성 균주를 항생제 감수성 시험 및 분자 역학 특성을 이용하여 총 16 균주를 선별하였다. 선별된 균주들의 genomic DNA를 추출한 후 이들의 16S rRNA gene을 sequencing하여 대상 균주임을 확인하였다. 확인을 한 균주들은 Illumina system을 이용하여 sequencing data를 얻었다. Raw sequence data들은 CLC genomics workbench를 이용하여 assemble을 한 후 구축된 pipeline을 이용하여 annotaion을 수행하여 draft geno
Total of 16 strains were selected by resistance test of carbapenem and molecular epidemiological methods from clinical isolates in Korea. Genomic DNA was extracted from selected strains and verified their taxonomic assignment by 16S rRNA gene sequencing. Whole genome sequencing was performed using I
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