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NTIS 바로가기주관연구기관 | 한국생명공학연구원 Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology |
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연구책임자 | 허철구 |
참여연구자 | 최재필 , 전효재 , 우민정 , 최준경 |
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 | 한국어 |
발행년월 | 2010-10 |
주관부처 | 미래창조과학부 KA |
사업 관리 기관 | 한국과학기술정보연구원 Korea Institute of Science and Technology Information |
등록번호 | TRKO201500007749 |
DB 구축일자 | 2015-06-13 |
키워드 | 차세대 서열결정법, 블라스트, 클러스터링, 어셈블리, 클라우딩 컴퓨터.Next generation sequencing, BLAST, clustering, assembly, cloud computing. |
sequencing 기술이 발달함에 따라 next generation technology (NGS)를 기반으로 한 de novo sequence assembly를 수행하는 것은 현 genomics 연구의 트랜드 이다. 하지만, 기존에 알려진 프로그램은 eukaryote의 de novo assembly를 하기에 부적합하다. 또한 read length가 짧고 양이 많아진 NGS sequences의 특징은 기존의 server급에서 분석하기 부적합하다. 이러한 트랜드에 발맞추기 위하여, 우리는 NGS를 기반으로 만들어진 98x의 고추 re
Ⅳ. Result of the study
In this research, we suggest strategy for De novo assembly applying the cloud computing Based on the GA machine, we constructed 0.3 tera-base pair (Tbp) sequence reads which covered approximately 98x of total genomic size of hot pepper. First, we suggested simple First Clus
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