초록 ▼

Ⅳ. 연구개발결과
‣조성된 참조축군에 대해 Porcine SNP 60 BeadChip 분석을 실시하고, 형질과의 통계적 분석을 통해 QTL을 탐구하였다. 호르몬 및 근내지방을 분석하고 그과 관련된 후보유전자를 탐색하였다. Cortisol과 관련하여 유의적인 SNP는 돼지 7번 염색체 말단에 밀집하고 있는 것으로 확인되었고, 근내지방, 수분 및 적색도와 관련하여 유의적인 SNP는 돼지 12번 염색체에 밀집되어 있는 것으로 확인되었다.
‣그 외, 근섬유 타입, 성장관련 형질에 관한 QTL 분석에서 다수의 유의적인 결과를 얻을

Ⅳ. 연구개발결과
‣조성된 참조축군에 대해 Porcine SNP 60 BeadChip 분석을 실시하고, 형질과의 통계적 분석을 통해 QTL을 탐구하였다. 호르몬 및 근내지방을 분석하고 그과 관련된 후보유전자를 탐색하였다. Cortisol과 관련하여 유의적인 SNP는 돼지 7번 염색체 말단에 밀집하고 있는 것으로 확인되었고, 근내지방, 수분 및 적색도와 관련하여 유의적인 SNP는 돼지 12번 염색체에 밀집되어 있는 것으로 확인되었다.
‣그 외, 근섬유 타입, 성장관련 형질에 관한 QTL 분석에서 다수의 유의적인 결과를 얻을 수 있었다. Cortisol과 성장관련 형질에 관한 후보유전자 연구를 통해 유의성을 검증하였다. Bonferroni correction에 따라 SNP의 유의성을 판별하였고, genome-wide 수준의 유의성을 보이는 것에 대해서는 대상 형질을 판별 할 수 있는 DNA 마커로서 개발을 하고자 하며 특허 출원이 진행 중에 있다.
‣돼지 육질형질 유전자좌위에 대해 GWAS 분석을 실시하였고, 돼지 염색체 12번에 밀집하고 있음을 확인 할 수 있었다. 후보유전자 내에서 SNP를 선정 분석하여 근내지방함량과 적색육을 판별할 수 있는 DNA 마커로서 효과를 확인하였다. 흑모색 고정을 위해 참조축 군에서 흑모색 유전자 좌위를 분석하였고, 이를 판별할 수 있는 DNA 마커를 개발하였다. 뿐만 아니라, 두 형질을 한 번에 판별 가능한 진단방법을 개발하였다.
‣장체장형 돼지를 선발하기 위한 QTL 결과를 통해 돼지 7번 염색체에 갈비뼈수를 조절하는 유전자가 밀집해 있음을 확인하였고, 후보유전자 연구를 통해 장체장형 개체를 선발가능한 DNA 마커를 개발하였다.
‣제주재래흑돼지와 듀록의 교잡축군을 조성하고 생산된 2세대 개체의 형질 및 QTL 분석을 통해 스트레스, 육질, 흑모색, 장체장형 형질을 선발 할 수 있는 DNA 마커를 개발하였고, 이들 유전자형에 따른 선택적 교배와 선발을 통해 육질이 좋고 강건한 흑돼지 부계종돈을 개발할 수 있게 되었으며 특허출원이 진행중에 있다.

Abstract ▼

This study aims to help marker excavation and to develop an excavation technology by exploring and identifying a stress-related genetic locus in order to develop a method of selecting robust individual pigs that are immune. In addition, through marker development, this study intends to assist in the

This study aims to help marker excavation and to develop an excavation technology by exploring and identifying a stress-related genetic locus in order to develop a method of selecting robust individual pigs that are immune. In addition, through marker development, this study intends to assist in the production of commercial pigs that form a livestock group with industrial applicability. The Jeju native black pigs and Duroc pigs were interbred by reciprocal cross. Stress, metabolic hormones, and boar taint related hormones were measured in F2 progeny. In order to examine changes in meat quality in relation to the effects of hormones, this study measured intramuscular fat, moisture, degree of redness, as well as the growth of 11 traits, such as weight, the number of vertebrae, and the number of teats. A large capacity single nucleotide polymorphism (SNP) chip was used to conduct a quantitative analysis of a trait-related locus. The genetic types of 62,163 SNPs in the constructed reference families were obtained by using the Porcine SNP 60 BeadChip. The PLINK program was used to conduct efficient SNP filtering for the statistical analysis. Before the statistical analysis, we verified whether the F2 phenotypes followed normal distribution. The outliers were then removed, and GRAMMAR performed using Asreml3. The results of the genome-wide association study showed that genes that were significantly related to cortisol levels were located at the end of Sus scrofa chromosome (SSC) 7. In addition, in relation to intramuscular fat, degree of redness, and muscle tissue traits, significant SNP was densely located at SSC12. Moreover, significant SNP was identified in relation to growth traits. Through candidate gene study, we identified many SNPs with significant association with cortisol and growth traits. Some of which had very high significance in comparison with the SNPs included in the Porcine SNP 60 BeadChip. The study developed genes to control the amount of cortisol secreted by the stress hormones, a source technology for control, and a method to fix concurrently meat traits and black color in an interbred population of native Jeju pigs and Duroc pigs. The male line of black pigs showed strong resistance to stress. Based on these results, we applied for a patent on the mail line of black pigs regarding meat traits, black color, and the grafting of tall height genes.

목차 Contents

• 완결과제 최종보고서 ... 1
• 제출문 ... 2
• 요약문 ... 3
• SUMMARY ... 6
• 목 차 ... 7
• 제 1 장 서 론 ... 8
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 9
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 11
• 1절 : 돼지 강건성과 면역력이 우수한 개체선발을 위한 참조축군 조성 ... 11
• 2 절 : 제주재래흑돼지 기반 참조축군의 강건성과 스트레스 연관 후보유전자 발굴 및 마커 선발 ... 34
• 제 4 장 연구개발목표 달성도 및 대외 기여도 ... 65
• 1절 : 목표대비 달성도 ... 65
• 2절 : 정량적 성과(논문게재, 특허출원, 기타)를 기술 ... 67
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획 ... 68
• 제 6 장 연구개발 과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 70
• 제 7 장 기타 중요 변동사항 ... 71
• 제 8 장 국가과학기술종합정보시스템에 등록한 연구장비 현황 ... 72
• 제 9 장 참고문헌 ... 73
• 끝페이지 ... 75