초록 ▼

Ⅳ. 연구개발결과
자포니카와 인디카 벼 간의 eQTLs를 분리에서 eOTL선발 과정 및 각 eQTLs의 특성분석에 대한 결과를 Rice Journal에 게재 후 Nature 논문에 연구결과가 인용되는 등으로 eQTL 연구의 가치를 인정받았으며, Rice Oligonucleotide Array Database(ROAD) 관련 논문게재를 통해 벼 유전자 삽입 및 활성 계통 색인 돌연변이를 활용한 벼에 특화된 웹 기반 발현 분석 데이터베이스 구축하고 벼 연구자들의 연구 효율성 향상에 기여하였다. 이러한 과정을 통해서 총 7 편의 S

Ⅳ. 연구개발결과
자포니카와 인디카 벼 간의 eQTLs를 분리에서 eOTL선발 과정 및 각 eQTLs의 특성분석에 대한 결과를 Rice Journal에 게재 후 Nature 논문에 연구결과가 인용되는 등으로 eQTL 연구의 가치를 인정받았으며, Rice Oligonucleotide Array Database(ROAD) 관련 논문게재를 통해 벼 유전자 삽입 및 활성 계통 색인 돌연변이를 활용한 벼에 특화된 웹 기반 발현 분석 데이터베이스 구축하고 벼 연구자들의 연구 효율성 향상에 기여하였다. 이러한 과정을 통해서 총 7 편의 SCI논문을 출판하였다. 또한 벼의 조직 특이적 및 전신 발현 유도 프로모터를 이용한 형질 전환체를 제작하여 11건의 특허출원 성과와 2건의 등록 성과를 달성하였다. 또한 대규모 돌연변이 계통 연구를 통해서 수확기 작물의 종자 생산에 관여하는 3개 이상의 신규 유전자들을 발굴하여 작물 생산성 향상 기작 연구 및 신품종 개발에 활용이 진행 중에 있다.

Abstract ▼

Accumulation of genome-wide transcriptome data provides new insight on a genomic scale which cannot be gained by analyses of individual data. The majority of rice (O. sativa) species are japonica and indica cultivars. Genome-wide identification of genes differentially expressed between japonica and

Accumulation of genome-wide transcriptome data provides new insight on a genomic scale which cannot be gained by analyses of individual data. The majority of rice (O. sativa) species are japonica and indica cultivars. Genome-wide identification of genes differentially expressed between japonica and indica cultivars will be very useful in understanding the domestication and evolution of rice species. In this study, we analyzed 983 of the 2753 entries in the Affymetrix array data in the public database: 595 generated from indica and 388 from japonica rice cultivars. To discover differentially expressed genes in each cultivar, we performed significance analysis of microarrays for normalized data, and identified 520 genes preferentially expressed in japonica and 160 genes in indica. Gene Ontology analyses revealed that defense response-related genes are significantly enriched in both cultivars, indicating that japonica and indica might be under strong selection pressure for these traits during domestication. In addition, 36 (34.6%) of 104 genes preferentially expressed in indica and 256 (52.2%) of 490 genes preferentially expressed in japonica were annotated as genes of unknown function. Biotic stress overview in the MapMan toolkit revealed key elements of the signaling pathway for defense response in japonica or indica eQTLs. The percentage of screened genes preferentially expressed in indica wa 4-fold higher (34.6%) and that in japonica was 5-fold (52.2%) higher than expected (11.1%), suggesting that genes of unknown function are responsible for the novel traits that distinguish japonica and indica cultivars. The identification of 10 functionally characterized genes expressed preferentially in either japonica or indica highlights the significance of our candidate genes during the domestication of rice species. Functional analysis of the roles of individual components of stress-mediated signaling pathways will shed light on potential molecular mechanisms to improve disease resistance in rice.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 요약문 ... 3
• SUMMARY ... 5
• 목차 ... 6
• 제 1 장 서 론 ... 7
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 8
• 제 3 장 연구개발 수행 내용 및 결과 ... 9
• 1절 : 목표대비 대외 달성도 ... 9
• 2절 : 연구결과 ... 12
• 제 4 장 연구개발 목표 달성도 및 대외 기여도 ... 28
• 1절 : 목표대비 대외 달성도 ... 28
• 2절 : 정량적 성과 ... 29
• 제 5 장 연구개발 결과의 활용계획 ... 32
• 제 6 장 연구개발 과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 33
• 제 7 장 기타 중요 변동사항 ... 33
• 제 8 장 국가과학기술종합정보시스템에 등록한 연구장비 현황 ... 33
• 제 9 장 참고문헌 ... 34
• 끝페이지 ... 35