초록 ▼

본 연구센터의 연구기간동안 대사성질환의 주요 사망원인인 동맥경화를 조기에 진단하고 모니터 할 수 있는 새로운 진단법 개발을 위한 연구를 수행 하는 것을 목표로 하였음. 대사성질환의 하나인 비만관련 선행연구결과를 기반으로 1차년도에 비만관련 바이오마커 발굴을 수행하여 6 종의 신규 바이오마커 후보물질을 발굴 하였음. 2 세부 연구팀에서 확보한 1500 명의 환자들중 정상/대조군이 잘 구분되어 좋은 결과가 기대되는 환자 시료를 충분히 확보하였음. 1세부의 공동연구팀에서는 대규모 환자시료 처리를 위한 시료 전처리 과정의 자동화, 대용량화

본 연구센터의 연구기간동안 대사성질환의 주요 사망원인인 동맥경화를 조기에 진단하고 모니터 할 수 있는 새로운 진단법 개발을 위한 연구를 수행 하는 것을 목표로 하였음. 대사성질환의 하나인 비만관련 선행연구결과를 기반으로 1차년도에 비만관련 바이오마커 발굴을 수행하여 6 종의 신규 바이오마커 후보물질을 발굴 하였음. 2 세부 연구팀에서 확보한 1500 명의 환자들중 정상/대조군이 잘 구분되어 좋은 결과가 기대되는 환자 시료를 충분히 확보하였음. 1세부의 공동연구팀에서는 대규모 환자시료 처리를 위한 시료 전처리 과정의 자동화, 대용량화를 가능케 하는 시스템을 개발하여 이번 연구결과에 적용 할 수 있도록 하였음.또한 당쇄화 단백체를 통한 바이오마커 발굴을 위하여 임상 조직 과 혈액에서의 당쇄화 단백체 추출 및 자동화 시스템을 개발하여 적용하였으며 동맥경화와 관련된 당쇄화 단백체를 동정함. 동맥경화 진단을 위한 바이오마커 발굴을 위하여 임상혈액 시료에서의 표지정량법을 통하여 99 종의 바이오마커 후보 단백체를 발굴 하였으며 소규모 환자에서의 MRM 검증을 수행 10 종의 바이오마커 후보를 선정하였음. 그리고 230 명 이상의 대규모 환자시료에서의 유용성 검증을 위하여 선정된 바이오마커 후보에 대한 AQUA 분석법을 확립하여 대규모 환자시료에서의 유용성 검증을 수행함. 그 결과 6 종의 단백체 바이오마커를 진단 바이오마커로서 선정 할 수 있었음.
2 세부 연구팀에서는 동맥경화 질환 관련 조직시료(혈관조직, 내방지방조직, 피하지방조직,심장주위지방 조직)에서의 단백체 master AMT-DB 를 구축하였음. 각 각 혈관조직(3593), 내장지방조직(4654), 피하지방조직(1518), 심장주위지방(2826) 단백질그룹을 동정 하고 872 종의 질환 마커 후보 단백질을 발굴 하였음. 관상동맥질환 바이오마커 발굴을 위하여 관상동맥질환 환자의 내장지방시료로부터 단백체 분석을 통하여 5143 종의 단백체를 동정하고 835 종의 후보 단백체를 선정하였으며 그 중에서 5종에 대한 임상 유용성 검증을 수행하여 확인함.
본 연구센터에서의 연구결과를 통하여 대사성질환인 당뇨에서의 동맥경화 진단을 위한 단백체 바이오마커를 발굴하고 관상동맥질환과 관련된 질환조직의 Master AMT-DB 를 구축하여 향후 관상동맥질환의 원인 규명과 질환 치료를 위한 관련 연구개발에 활용될수 있도록 함.

Abstract ▼

II. Results
● We collected tissues from surgery of coronary artery stenosis with MDCT record. In addition serum sapples were collected based on the degree of coronary artery stenosis. Their clinical records and biomarker candidate were correlated to select potential candidate proteins follwong ex

II. Results
● We collected tissues from surgery of coronary artery stenosis with MDCT record. In addition serum sapples were collected based on the degree of coronary artery stenosis. Their clinical records and biomarker candidate were correlated to select potential candidate proteins follwong extensive proteomics profiling. Total of 1500 samples were collected.
● Extensive proteomic profiling were conducted in adipose tissues from the patients of coronary artery stenosis followed by non-labeled quantification to construct master proteome map for adipose tissues of coronary artery stenosis
● Based on clinical data and proteome map, the network analysis were conducted to isolate candidate biomarkers for massive clinical validateion. Evetually, we identified 5143 proteins to construct proteome master map for adipose tissues of coronary artery stenosis.
● MRM, a quantitative proteomic method, analysis for the selected biomarker candidates with 300 serum samples collected from 300 patients and their corresponding controls.
● MRM analysis were inclued the differentially proteins as well as 8 proteins with nonsynonymous SNPs.