초록 ▼

연구의 목적 및 내용
<최종목표>
담도암 유전체 분석을 통한 분자적 특징 규명 및 예후관련인자 발굴
<당해연도목표>
- 담도암 환자의 예후에 따른 임상적 분류 및 시료수집
- 임상검체를 이용한 유전체 정보 스크리닝 및 연관분석

연구개발성과
- 종양억제유전자인 APC 유전자의 불활성화를 유발하는 frameshift는 1번, 7번 환자에서, ARID1A 유전자의 frameshift는 3번 환자에서 발견되었음. 담도암에서 약 37%의 환자에서 보고된 TP53 돌연변이는 1명에서만 발견되었고 N

연구의 목적 및 내용
<최종목표>
담도암 유전체 분석을 통한 분자적 특징 규명 및 예후관련인자 발굴
<당해연도목표>
- 담도암 환자의 예후에 따른 임상적 분류 및 시료수집
- 임상검체를 이용한 유전체 정보 스크리닝 및 연관분석

연구개발성과
- 종양억제유전자인 APC 유전자의 불활성화를 유발하는 frameshift는 1번, 7번 환자에서, ARID1A 유전자의 frameshift는 3번 환자에서 발견되었음. 담도암에서 약 37%의 환자에서 보고된 TP53 돌연변이는 1명에서만 발견되었고 NID2, EPHA2, FNTB, HMCN1, PSD3 등 담도암과의 관련성이 아직 알려지지 않은 유전자의 변이는 추후 연구가 필요함.
- 담도암에서 활성화된 oncogenic pathway에 포함된 Ras, Raf 관련유전자 중 KRAS, NRAS 돌연변이가 모두 3명의 환자에서 발견됨. 특히 7번환자는 KRAS G13D 돌연변이와 함께 APC, TP53의 종양억제유전자 변이를 함께 가지고 있어 임상적으로 불량한 예후와 상관관계가 있을 것으로 추정됨.
- 유전체분석을 실시한 환자중 2번환자는 원발성 담도암조직과 전이조직을 모두 수집하였으므로 체성돌연변이가 전이과정에서 변화하는 패턴을 분석하였음. 특히 원발암조직에서는 발견되지 않고 전이조직 특이적으로 TP53BP1의 frameshift 돌연변이가 검출되었음. 이는 전이에 유리한 evolution이 진행되었음을 시사함. 후속연구를 통하여 이에 대한 기능적 연구와 실험이 뒷받침되어야 할 것임.
-KRAS와 TP53 돌연변이가 조기 재발 환자군 4명 중 각각 2명(50%), 1명(25%)의 환자에서만 나타나며 무재발 환자군에서 나타나지 않음. 이는 KRAS와 TP53 돌연변이의 나쁜 예후와의 관련성을 보고한 최근보고 결과와 일치함. ARID1A나 KANSL1 등의 chromatin-modulation gene들의 변이가 조기재발 환자군에서만 발견되어 추후 연구가 필요함.

연구개발성과의 활용계획(기대효과)
○ 담도암 예후/치료반응 예측용 유전자변이 패널
- 과제 진행결과 발굴된 유전체 정보기반의 바이오마커는 항암치료에 대한 반응성 예측, 전이 및 재발등의 위험도를 예측할 수 있는 패널로 활용가능함을 목표로 함.
-이를 위해 선택된 유전자 지표를 현재 종양은행에 보관된 검체를 대상으로 예후 예측인자로서의 가능성을 검증하는 단계로 진행을 계획함.
-이와 함께 후속연구로 ‘담도계암 환자유래 종양 이종이식모델의 약물 반응성과 유전체학 분석을 통한 항암제 반응 예측인자 마커 발굴’을 목표로 진행할 예정임

Abstract ▼

Results
-Through exomic sequencing of 8 intrahepatic cholangiocarcinomas, we discovered frameshift mutation in APC in 2 patients, and in ARID1A in one patient. We also identified TP53 mutations in only patient, although TP53 has been reported as one of the most frequently mutated gene in cholangi

Results
-Through exomic sequencing of 8 intrahepatic cholangiocarcinomas, we discovered frameshift mutation in APC in 2 patients, and in ARID1A in one patient. We also identified TP53 mutations in only patient, although TP53 has been reported as one of the most frequently mutated gene in cholangiocarcinoma(35%). We also identified NID2, EPHA2, FNTB, HMCN1, PSD3 mutation. However, additional data are needed to determine the significance of these mutations.
-KRAS, NRAS mutations involving the oncogenic pathway of cholangiocarcinoam were found in 3 patients. One patient (No. 7) with KRAS, APC, and TP3 mutation showed the poor prognosis.
- TP53BP1 frameshift mutation not found in the primary tumor was present in the metastatic tumor (No.2 patient).
- KRAS and TP53 mutations was found in 2 and 1 of 4 patients with early recurrence. Previous studies reported that KRAS, TP53 mutations are significantly associated with a worse prognosis.

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 최종보고서 (기관고유연구사업) ... 2
• 국문요약문 ... 3
• 영문요약문 ... 4
• 목차 ... 5
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 6
• 1-1. 연구개발 목적 ... 6
• 1-2. 연구개발의 필요성 ... 6
• 1-3. 연구개발 범위 ... 7
• 2. 국내외 기술개발 현황 ... 9
• 3. 연구수행 내용 및 결과 ... 11
• 4. 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 18
• 4-1. 목표달성도 ... 18
• 4-2. 관련분야 기여도 ... 18
• 5. 연구결과의 활용계획 ... 19
• 6. 연구과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 19
• 7. 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 20
• 8. 참여연구원 현황 ... 20
• 9. 기타사항 ... 20
• 10. 참고문헌 ... 21
• 끝페이지 ... 21