보고서 정보
주관연구기관 |
(주)천랩 |
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 |
한국어
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발행년월 | 2015-11 |
과제시작연도 |
2015 |
주관부처 |
보건복지부 [Ministry of Health & Welfare(MW)(MW) |
등록번호 |
TRKO201600003524 |
과제고유번호 |
1465019553 |
사업명 |
감염병관리기술개발연구 |
DB 구축일자 |
2016-07-02
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키워드 |
항균제.내성.세균.유전체.antibiotics.resistance.bacteria.genome.
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DOI |
https://doi.org/10.23000/TRKO201600003524 |
초록
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○ Klebsiella pneumoniae 분석 균주 10주의 경우 CRKP-291 균주를 제외한 나머지 분리균주들은 매우 상동성이 높은 유사균주들로 판명되었으며, 기존 보고된 다른 균주들과는 다른 유전체 구성을 갖는 것으로 조사되었다. 완전 해독된 균주들 중에는 K. pneumoniae MGH 78578 균주와 가장 유사한 것으로 판명되었다.
○ Acinetobacter baumannii 분석 균주 10주들은 종 내의 다른 균주들에 비해서 비교적 유사한 균주들로 판명되었으며, 3개의 cluster를 형성하는 것으로 나타났다.
○ Klebsiella pneumoniae 분석 균주 10주의 경우 CRKP-291 균주를 제외한 나머지 분리균주들은 매우 상동성이 높은 유사균주들로 판명되었으며, 기존 보고된 다른 균주들과는 다른 유전체 구성을 갖는 것으로 조사되었다. 완전 해독된 균주들 중에는 K. pneumoniae MGH 78578 균주와 가장 유사한 것으로 판명되었다.
○ Acinetobacter baumannii 분석 균주 10주들은 종 내의 다른 균주들에 비해서 비교적 유사한 균주들로 판명되었으며, 3개의 cluster를 형성하는 것으로 나타났다. 이들 10개의 균주들과 유사한 완전 해독 내성균은 Acinetobacter baumannii TYTH-1 균주로 2006년에 대만에서 분리, 보고된 다제 내성균이다.
○ Stalphylococcus aureus 분석 균주 25주들은 종 내의 다른 균주들에 비해서 비교적 유사한 균주들로 판명되었으며, 3개의 main cluster를 형성하는 것으로 나타났다.특히, 이들 3개 그룹중 가장 많은 균주가 포함된 clade3에서는 21개가 단인 그룹으로 묶였으며, 이들 균주들과 유사한 완전 해독 내성균은 S. aureus Mu50 균주로 1997년에 일본에서 수술후 감염된 남아에서 분리, 보고된 vancomycin 내성균이다
○ 본 연구과제를 통해서 분석된 대부분의 항생제 내성균주들은 aminoglycoside,beta-lactam, macrolide, fluoroquinolone, phenicol, rifampicin, sulphonamide, trimethoprim 등의 항생제대한 내성 유전자를 보유하고 있었다.
○ 결론적으로, 전체 유전체 분석 균주들과의 계통 분석에서도 분석균주들은 비교적 유사한 유전학적 유연관계를 형성하였으나, 기존에 보고된 항생제 내성균들과는 차이가 나는 것이 대부분이었다. 이는 분리균주들이 기존에 보고된 항생제 내성균들과는 다른 역학적 특성을 보유하는 것으로 추정할 수 있다.
Abstract
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○ Ten strains of Klebsiella pneumoniae have been sequenced for their genome using NGS technologies. The results showed that 10 isolates had relatively similar genome sequences compared to other reference strains. Reference strain, K. pneumoniae MGH 78578 was the closest strain to these 10 isolates.<
○ Ten strains of Klebsiella pneumoniae have been sequenced for their genome using NGS technologies. The results showed that 10 isolates had relatively similar genome sequences compared to other reference strains. Reference strain, K. pneumoniae MGH 78578 was the closest strain to these 10 isolates.
○ Ten strains ofAcinetobacter baumannii have been sequenced for their genome using NGS technologies. The results showed that 10 isolates had relatively similar genome sequences compared to other reference strains. Reference strain,Acinetobacter baumannii TYTH-1, which was isolated in Taiwan, 2006 and reported as multi-drug resistant bacteria, was the closest strain to these 10 isolates.
○ Twenty five strains of Stalphylococcus aureus have been sequenced for their genome using NGS technologies. The results showed that they clustered as 3 main groups. Among them, clode 3 had 21 strains, and was similar to reference strain, S. aureus Mu50, which was isolated in Japan, 1997 and reported as vancomycin- resistant bacteria.
○ From this study, it was observed that most of isolates have resistance genes which are related to various antibiotics, mainly aminoglycoside, beta-lactam, macrolide, fluoroquinolone, phenicol, rifampicin, sulphonamide and trimethoprim.
○ In conclusion, most of sequenced isolates from this study had similar phylogenetic positions and genome structures though they are relatively different clusters with other reference strains. This results imply that these antibiotic resistant bacteria may have similar genomic traits and similar resistant patterns, but may have different epidemiological origin and resistant characters to other reference strains.
목차 Contents
- 표지 ... 1
- 학술연구개발용역과제 최종결과보고서 ... 2
- 목차 ... 3
- 연구결과최종보고서 요약문 ... 4
- Summary ... 5
- 학술연구개발용역과제 연구결과 ... 6
- 제1장 최종 목표 ... 6
- 제2장 국내외 기술 현황 ... 7
- 제3장 최종 연구 내용 및 방법 ... 10
- 제4장 최종 연구 결과 ... 19
- 제5장 연구결과 고찰 및 결론 ... 101
- 제6장 연구성과 및 활용계획 ... 103
- 제7장 연구용역과제 진행과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 105
- 제8장 기타 중요변경사항 ... 105
- 제9장 연구비 사용 내역(당해년도) 및 연구원 분담표 ... 106
- 제10장 참고문헌 ... 108
- 제11장 첨부서류 ... 109
- 끝페이지 ... 110
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