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다장기 상호연계독성 통합 분석 및 예측 모델 구축
Integrated analysis of associated toxicities in multiple organ and the construction of predictive model 원문보기

보고서 정보
주관연구기관 경희대학교
Korea Institute of Toxicology
보고서유형최종보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2015-11
과제시작연도 2015
주관부처 식품의약품안전청
Korea Food & Drug Administration
등록번호 TRKO201600010706
과제고유번호 1475008847
사업명 안전성평가기술개발연구
DB 구축일자 2016-10-29
키워드 시스템 독성학.독성 정보학.예측 모델.통합 오믹스 분석.메타 분석.Systems Toxicology.Toxicoinformatics.Prediction model.Integrated omics data analysis.meta-analysis.
DOI https://doi.org/10.23000/TRKO201600010706

초록

○ 연구목표
◦ 독성물질 투약 시 염증 매개성 pathway 기반 multi-omics database 통합 분석
◦ 메타분석을 통한 유의한 오믹스 자료의 도출
◦ 다장기 상호연계독성 예측 모델을 이용한 인체 위해성 평가활용 자료 구축 및 응용

○ 연구내용
◦ 다장기 상호연계 독성 특징을 갖는 물질들의 구조적/기능적 특성 분석
◦ 염증 연계 패스웨이를 활용한 다장기 연계독성 모델 연구
◦ 메타분석을 활용한 장기 간 상호연계 오믹스데이터 수집 및 통합 분석
◦ 독성물질 특성 분석에 기

목차 Contents

  • 표지 ... 1
  • 제출문 ... 3
  • 목차 ... 5
  • 제 3 중단위 과제 ... 8
  • 1. 요약서 ... 10
  • 2. 최종 연구개발 목표 ... 12
  • 1) 중단위 과제의 목표 ... 12
  • 2) 중단위 과제의 목표달성도 ... 14
  • 3) 국내ㆍ외 기술개발 현황 ... 14
  • 3. 연구개발 내용 및 방법 ... 18
  • 1) 다장기 상호 연계 독성 예측 모델 구축 ... 18
  • 2) Histopathology 기반 omics data 통합 분석 ... 20
  • 3) 다장기 세포주 모델 성능 평가 ... 21
  • 4) 오믹스 데이터 통합 독성 네트워크 정보 DB 구축 ... 22
  • 5) 메타분석을 활용한 다장기 상호연계 오믹스 데이터 수집 및 통합분석 ... 22
  • 6) 메타분석을 활용한 다장기 상호연계독성 예측 모델 구축과 예측 결과의 시각화 ... 25
  • 7) 메타분석 기반 다장기 상호연계독성 예측시스템 구현 및 평가체계 확립 ... 28
  • 4. 최종 연구개발 결과 ... 30
  • 1) 다장기 상호 연계 독성 예측 모델 구축 ... 30
  • 2) Histopathology 기반 omics data 통합 분석 ... 36
  • 3) 다장기 세포주 모델 성능 평가 ... 37
  • 4) 오믹스 데이터 통합 독성 네트워크 정보 DB 구축 ... 39
  • 5) 메타분석을 활용한 다장기 상호연계 오믹스 데이터 수집 및 통합분석 ... 47
  • 6) 메타분석을 활용한 다장기 상호연계독성 예측 모델 구축과 예측 결과의시각화 ... 51
  • 7) 메타분석 기반 다장기 상호연계독성 예측시스템 구현 및 평가체계 확립 ... 55
  • 5. 연구결과 고찰 및 결론 ... 61
  • 1) 약물 구조 정보와 유전자 발현 정보를 사용한 약물 독성 예측 ... 61
  • 2) Omics data 통합 분석을 통한 새로운 pathway 정보 확인 ... 61
  • 3) 다장기 세포주 모델 성능 평가 ... 61
  • 4) 오믹스 데이터 통합 독성 네트워크 정보 DB 구축 ... 62
  • 5) 독성에 대한 다장기 사이의 상호연계성의 확인 ... 62
  • 6) 다장기 상호연계독성에서의 패스웨이 마커 검출 및 유용성 검증 ... 62
  • 7) 오믹스 데이터에 의한 다장기 독성 예측시스템 구축 ... 63
  • 8) 독성 연구에서 In-vitro 및 IdMOC 플랫폼에 의한 데이터의 활용 가능성 확인 ... 63
  • 6. 참고문헌 ... 64
  • 제 3-1 세부 과제 : 패스웨이 기반 다장기 상호연계 독성 통합 분석 ... 68
  • 제 3-2 세부 과제 : 메타 분석에 의한 다장기 상호 연계 독성 예측 모델 구축 ... 226
  • 별첨자료 ... 436
  • 1. 다장기 상호연계 독성IdMOC assay를 위한 매뉴얼 ... 438
  • 2. 다장기 상호연계 독성유전자 발현 시험을 위한 매뉴얼 ... 456
  • 3. 다장기 상호연계 독성2-DE 단백체 분석 시험을 위한 매뉴얼 ... 490
  • 4. 다장기 상호연계 독성 예측 및 평가지표개발을 위한 대사체 분석 매뉴얼 ... 512
  • 5. Chemical induced cytotoxicity assay based on multi-organ originated cell-cell interaction ... 542
  • 6. Method for genomic Analysis using Affymetrix GeneChip Whole genome array ... 550
  • 7. 2-D Electrophoresis analysis using an Owl separation system ... 568
  • 8. LC/QTOF/MS based untargeted metabolomic analysis ... 584
  • 끝페이지 ... 634

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참고문헌 (25)

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