초록 ▼

본 연구에서는 대표적인 호산성 방선균인 Streptacidiphilus 속 3종의 표준균주인 Streptacidiphilus albus JL83^T, Streptacidiphilus oryzae TH49^T 및 Streptacidiphilus rugosus AM-16^T를 대상으로 유전체를 분석하였고, 이로부터 대사유형 및 생리활성에 관여하는 유전자를 발굴해 내고자 하였다. 유전체 분석 결과 세 종의 Streptacidiphilus의 유전체 크기는 7.81Mb에서 9.91Mb까지

본 연구에서는 대표적인 호산성 방선균인 Streptacidiphilus 속 3종의 표준균주인 Streptacidiphilus albus JL83^T, Streptacidiphilus oryzae TH49^T 및 Streptacidiphilus rugosus AM-16^T를 대상으로 유전체를 분석하였고, 이로부터 대사유형 및 생리활성에 관여하는 유전자를 발굴해 내고자 하였다. 유전체 분석 결과 세 종의 Streptacidiphilus의 유전체 크기는 7.81Mb에서 9.91Mb까지 광범위하며, G+C 함량은 각각 71.77%-73.36%, 유전자의 수는 6,920-8,794의 분포를 보였다. 유전자를 지정하는 DNA의 비율은 86.89􍾢 88.13%이었다. 리보솜을 구성하는 rRNA 유전자 오페론의 수는 7개, 또는 9개로 나타났다. 세 종의 contig는 1-6개 사이로 양질의 유전체 자료를 확보하였다.

세 종은 호산성 생장에 관련된 것으로 추정되는 chloride channel protein, H+ symporter 와 Na+/H+ antiporter와 같은 유전자를 가지고 있었다. 또한 2차 대사산물과 관련된 TypeⅠ polyketide 또는 non-ribosomal peptide 유전자, actinorhodin과 streptomycin 생합성에 관여하는 유전자 또한 구조를 예측 가능한 gene cluster를 보유하고 있는 것으로 나타났다. 유전체 분석을 통해서 Streptacidiphilus의 생장 방식 및 생리활성에 대한 유전정보를 확보하였으며, 또한 세 종간에 서로 구별되는 특징이 있음을 확인하였다.

세 종의 유전체는 COG DB에서 1,356개의 유전자를 공유하는 것으로 나타났고, KO DB 상에서도 1,209개의 기능 유전자를 공유하고 있는 것으로 나타났다. 하지만 그 젒 48.8%는 기능이 알려지지 않은 유전자군에 속했고, 43.2%는 대사 관련 유전자군, 5.6%는 환경 정보의 처리 관련 유전자군, 그리고 2.4%는 세포 내 과정에 관여하는 유전자군으로 각각 나타났다.

본 연구로부터 확보한 유전체 정보는 호산성 방선균이 가지는 생리, 생화학적 특징 및 이차대사산물 생산, 그리고 산성 환경에서의 적응 관련 형질을 밝혀내는 데 기반이 되었으며, 향후 호산성 방선균의 전반적인 생물학적 특징 및 산업적 유용성을 밝히는 데 젒요한 바탕이 될 것으로 기대된다.

본 연구에서 확보한 유전체 데이터는 전부 공공 DB에 등재하였다.

방선균 종 : Streptacidiphilus albus JL83^T
IMG ID : 2574179785
GenBank ID: JQML00000000
비고 : 호산성

방선균 종 : Streptacidiphilus oryzae TH49^T
IMG ID : 2574179794
GenBank ID: JQMQ01000000
비고 : 호산성

방선균 종 : Streptacidiphilus rugosus AM-16^T
IMG ID : 2574179761
GenBank ID: JQMJ00000000
비고 : 호산성

방선균 종 : Kitasatospora azatica KCTC 9699^T
IMG ID : 2574179793
GenBank ID: JQMO00000000
비고 : 호중성

방선균 종 : Kitasatospora mediocidica KCTC 9733^T
IMG ID : 2574179795
GenBank ID: JQLN00000000
비고 : 호중성

방선균 종 : Streptomyces yeocheonensis CN732^T
IMG ID : 2574179744
GenBank ID: JQNR00000000
비고 : 호산성

본 연구로부터 현재까지 1편의 국제전문학술지, 1편의 특허, 1편의 국내학술대회 구두발표 및 3건의 국제학술대회 포스터 발표를 하였고, 1편의 논문이 SCI 저널에 투고되고 현재 수정젒이며, 향후 2-3년 내 다수의 논문을 투고할 계획이다.

(출처:연구결과 요약문 p.3)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 목차 ... 2
• Ⅰ. 연구결과 요약문 ... 3
• Ⅱ. 연구내용 및 결과 ... 4
• 1. 연구과제의 개요 ... 4
• 2. 국내외 기술개발 현황 ... 4
• 3. 연구수행 내용 및 결과 ... 4
• 4. 목표 달성도 및 관련 분야에의 기여도 ... 6
• 5. 연구결과의 활용계획 ... 6
• 6. 연구과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 6
• Ⅲ. 연구성과 ... 7
• 끝페이지 ... 12