초록

- 21세기 프론티어 미생물유전체활용기술개발사업단 인프라 연구를 통해 확보한 미생물자원의 재검토 및 분양시스템 구축
- 미생물 유전체 정보 재검토 및 활용 시스템 구축

(출처 : 보고서 요약서 2p)

Abstract ▼

II. Results

○ Build-up of KCTC distribution system and resource set for storage of microbial strains, meta-genome libraries or useful protein over-expression clones obtained through infrastructure work of research for Microbial Genomics and Applications Center.
1) Confirmation of survival

II. Results

○ Build-up of KCTC distribution system and resource set for storage of microbial strains, meta-genome libraries or useful protein over-expression clones obtained through infrastructure work of research for Microbial Genomics and Applications Center.
1) Confirmation of survival on positive strains including microbial culture isolates obtained from the hard-to-culturable/particular circumstances from a variety of environments. Establishment of 4 sets of proven 18,672strains and meta-genomic library 1098 clones for deposits.
2) For 2000 strains of the microbial resources, ampules were designated and lyophilized for storage.
3) Establishment of management system on the KCTC web of microbial protein information DB and completion of distribution system through KCTC recognition tag (barcode) on the web

○ Microbial genome information web portal (GEM)
1) Advanced web-portal
2) Enhancement of GEM server performance

○ Specified DB update and performance improvement
1) Analysis of genome information for 30 strains listed on the GEM
2) Advancement of microbial functional information DB

○ Collection of PAI information and organization
1) Prediction of pathogenic and resistant genes from the microbial genome
2) Build-up of WEB-DB system.

(출처 : SUMMARY 5p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 2
• 요 약 문 ... 3
• SUMMARY ... 5
• CONTENTS ... 7
• 목차 ... 8
• 제1장 연구개발과제의 개요 ... 9
• 제1절 연구개발의 목적 ... 9
• 1. 연구의 최종목표 ... 9
• 제2절 연구개발의 필요성 ... 9
• 1. 연구개발의 개요 ... 9
• 2. 연구개발 대상 기술의 경제적·산업적 중요성 및 연구개발의 필요성 ... 10
• 제3절 연구개발의 범위 ... 10
• 1. 연차별 연구개발의 내용 및 범위 ... 10
• 제2장 국내외 기술개발 현황 ... 12
• 제1절 해외 기술개발 현황 ... 12
• 제2절 국내 기술개발 현황 ... 12
• 제3절 국내외 연구현황 ... 13
• 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 15
• 제1절 장기보존용 set 확보 및 분양시스템 구축 ... 15
• 1. 미생물균주, 메타게놈 및 단백질 클론의 장기보존용 set 확보 ... 15
• 2. 미생물균주, 메타게놈 및 단백질클론의 관리 및 분양 시스템 구축 ... 16
• 3. 자원의 품질검정 및 생존력 검정 ... 18
• 4. 자원의 분양 ... 18
• 제2절 미생물유전체 정보 웹포털 (GEM 2.0 구축) ... 20
• 1. 특화 DB 업데이트 ... 20
• 2. 유전체 주석 파이프라인 구성 ... 24
• 3. 미생물유전체 web interface 구현 ... 26
• 4. GEM 2.0의 향후 운영 방안 ... 32
• 제3절 Pathogenicity Island Database (PAIDB) 2.0 개발 ... 33
• 1. PAI 정보 수집 및 체계화 ... 33
• 2. 미생물 genome에서의 병원성 유전자군 및 저항성 유전자군 예측 ... 33
• 3. Web-DB system 구축 ... 33
• 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 36
• 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 37
• 제1절 연구개발결과의 활용방안 ... 37
• 제2절 기대성과 ... 37
• 1. 기술적 측면 ... 37
• 2. 경제적·산업적 측면 ... 38
• 제6장 연구시설·장비 현황 ... 38
• 제7장 본 연구에서 구축된 미생물 자원의 가치 평가 ... 39
• 1. 신종후보군 보존셋 (전체의 2%) ... 39
• 2. 일반균주 보존셋 ... 39
• 3. 단백질발현클론 ... 39
• 제8장 참고문헌 ... 45
• 끝페이지 ... 46