초록 ▼

- 단백질간의 상호작용 분석을 위한 CUPID 시스템의 다양한 적용성 확인
- CUPID시스템을 이용하여 잘 알려진 여러 조합의 단백질 상호작용들을 재현
- Transfected cell array 개발 전략 확립과 유전자 과발현 (cDNA printing)최적화 조건도출
- 제작된 Array의 안정성과 효율을 확립
- 단백질-단백질 상호작용을 수학적 모델링을 통해 정량화
- 단백질-단백질 상호작용과 관련된 feature들을 추출하여 그중 가장 계측하기 적합한 feature selection을 실행

- 단백질간의 상호작용 분석을 위한 CUPID 시스템의 다양한 적용성 확인
- CUPID시스템을 이용하여 잘 알려진 여러 조합의 단백질 상호작용들을 재현
- Transfected cell array 개발 전략 확립과 유전자 과발현 (cDNA printing)최적화 조건도출
- 제작된 Array의 안정성과 효율을 확립
- 단백질-단백질 상호작용을 수학적 모델링을 통해 정량화
- 단백질-단백질 상호작용과 관련된 feature들을 추출하여 그중 가장 계측하기 적합한 feature selection을 실행
- 이미지 분할 방법을 기반으로 유효 region (세포 핵, 세포 질, 세포막)에 관련된 feature들을 추출하는 방법을 구축
- 추출된 feature를 기반으로 negative control과 positive control간의 distribution shift를 분별할 수 있는 적합한 feature selection 연구와 각 control내의 variation을 최소화

( 출처 : 보고서 요약서 3p )

Abstract ▼

Purpose
To establish High Contents Screening platform for protein-protein interaction screening using CUPID system that was developed by KBSI,we are going to setup optimized cell-chip system and develop a software which can quantify automatically cell images in effective and reliable way.
We w

Purpose
To establish High Contents Screening platform for protein-protein interaction screening using CUPID system that was developed by KBSI,we are going to setup optimized cell-chip system and develop a software which can quantify automatically cell images in effective and reliable way.
We will also construct a program which is able to deposit and analyze properly the huge data produced by cell-chip screening. Using the novel target from our developed platform, we are going to discovery new drug candidate which can inhibit selected protein-protein interaction

Contents
- Checking the expression of proteins transfected into various kinds of cell lines
- Generating of numerous cell images which shows the different kinds of fluorescence intensity
- Validating of protein-protein interaction observed in HCS and elucidating of auxiliary proteins for binding
- Obtaining of optimized surface treatment method
- Setup the best condition for reverse transfection
- Finding of optimized condition for cell culture on the chip
- Settlement of preservation condition for printed cell-chips
- Basic studies for image acquiring method and mathematical modeling method for image processing
- Extraction of signal features for protein binding/unbinding in fluorescence images
- Construction of mathematical modeling for protein interaction
- Designing of optimal database for cell-chip data
- Designing of stacking of caell-chip data and analysis tool interface
- Performing of structural and functional studies for newly identified protein interactions
- Producing of biological assay data for SAR study

Expected Contribution
It is expected that the application of this study will not be limited only to cell-chip technology of imageprocessing technology. For example, the novel protein protein interaction information from present study may be able to use new target for drug discovery. In addition, the more reliable and punctual signal transduction pathway information will give groundbreaking clues to system biology field. The development of new drug candidate which can inhibit the targeted protein interaction will be great helpful for public health

( 출처 : SUMMARY 7p )

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 요 약 문 ... 5
• S U M M A R Y ... 7
• C O N T E N T S ... 9
• 목차 ... 10
• 제 1 장 연구개발과제의 개요 ... 11
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 11
• 제 3 장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 12
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 26
• 가. 연구개발목표의 달성도 ... 27
• 나. 평가의 착안점에 따른 목표달성도에 대한 자체평가 ... 27
• 제 5 장 연구개발결과의 활용계획 ... 27
• 가. 연구개발결과의 활용방안 ... 27
• 나. 기대성과 ... 28
• 제 6 장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 30
• 제 7 장 참고문헌 ... 30
• 끝페이지 ... 31