초록 ▼

◉ 분열효모 유전체 적중 라이브러리와 microarray 시스템을 활용한 약물작용점 분석 방법을 NGS(next generation sequencing)를 이용한 시스템으로 전환하기 위해 분열효모 유전자 적중 균주 라이브러리를 신규 계대배양

◉ 분석 완료된 균주를 대상으로 신규 유전체 적중 라이브러리 pool을 제조

◉ ~5,000종의 균주 모두를 NGS를 통해 바코드 분석을 완료하고 NGS기반 약물 작용점 분석시스템 수립 및 최적화

◉ 항암제 10종과 항진균제 5종에 대상으로 약물작용점 탐색을

◉ 분열효모 유전체 적중 라이브러리와 microarray 시스템을 활용한 약물작용점 분석 방법을 NGS(next generation sequencing)를 이용한 시스템으로 전환하기 위해 분열효모 유전자 적중 균주 라이브러리를 신규 계대배양

◉ 분석 완료된 균주를 대상으로 신규 유전체 적중 라이브러리 pool을 제조

◉ ~5,000종의 균주 모두를 NGS를 통해 바코드 분석을 완료하고 NGS기반 약물 작용점 분석시스템 수립 및 최적화

◉ 항암제 10종과 항진균제 5종에 대상으로 약물작용점 탐색을 microarray법과 NGS법으로 각각 수행 후 둘 간의 장단점을 상호 비교분석함

(출처 : 요약서 3p)

Abstract ▼

Purpose & Contents
ㅇ A systematic deletion of ~5,000 genes in S. pombe is useful for functional studies of each genes, but also applicable for the screening of drug targets

ㅇ Switch from chip method to NGS technique

ㅇ Target analysis of each 10 anti-cancer drug and 5 anti-fungal dru

Purpose & Contents
ㅇ A systematic deletion of ~5,000 genes in S. pombe is useful for functional studies of each genes, but also applicable for the screening of drug targets

ㅇ Switch from chip method to NGS technique

ㅇ Target analysis of each 10 anti-cancer drug and 5 anti-fungal drug and confirmation of screened targets by biochemical /genetic method

ㅇ Confirmation of the bar-code region in the deletison mutant strains by NGS and re-location of heterozygous diploid 4,800 and haploid deletion 3,200 strains

ㅇ First select candidates showing sensitivity for drugs and Optimization of NGS analysis method

ㅇ Target analysis of each 10 requently used anti-cancer and 5 anti-fungal drugs and analyis with microarray result

Results
1. Re-construction of bad mutants 358 diploid mutants with gene synthesis and host exchange method, and 802 haploid mutants with tetrad analysis

2. Location with new construction deletion mutants and removal bad mutants, re-location 5000 diploid deletion mutants and 3200 haploid deletion strains,

3. Construction of heterozygous deletion mutants pool and haploid deletion mutants pool.

4. Progrss the bar-code sequencing use the pool.

5. Select showing sensitivity for 10 anti-cancer and 5 anti-fungal drug and drug target screening and the same method with microarray by the comparison with microarray data.

6. Target analysis of drug sensitive target with NGS method and confirmation of screened targets by an individual deletion mutants

Expected Contribution
1. Target analysis of each anti-cancer drug and anti-fungal drug are expected to help develop new medicines in the field of drug treatment, which is expected the technical transfer through meaningful target screening

2. NGS-driven drug-screening system is capable of microarray systems, additional technical transfer is possible

(출처 : SUMMARY 5p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 국문 요약문 ... 4
• SUMMARY ... 5
• CONTENTS ... 6
• 목차 ... 7
• 제1장. 연구개발과제의 개요 ... 8
• 제2장. 국내외 기술 개발 현황 ... 9
• 제3장. 연구 수행 내용 및 성과 ... 10
• 제 1절 균주의 재제조와 재배치 및 pool 제조 ... 10
• 1. 균주의 재제조 ... 10
• 2. 균주 재배치 ... 13
• 3. 2배체 및 1배체 유전자 적중 균주 라이브러리 pool을 제조 ... 13
• 제 2절. 바코드의 재검증 ... 14
• 1.염색체 DNA 추출 ... 14
• 2. Bar-code sequencing ... 14
• 제 3절. 약물의 선정과 약물작용점 탐색 ... 15
• 1. 약물의 선정과 약물의 농도 결정 ... 15
• 2. 항암제 항진균제 약물작용점 탐색 실험 진행 ... 16
• 3. NGS 방법을 통한 약물 민감성 균주 분석 ... 16
• 제 4절. 약물 민감성 균주의 개별 타겟 검증 ... 17
• 1. Plate assay ... 17
• 2. Liquid assay ... 24
• 제4장. 목표 달성도 및 관련 분야 기여도 ... 28
• 1. 목표 달성도 ... 28
• 2. 관련 분야 기여도 ... 28
• 제5장. 연구개발성과의 활용계획 ... 29
• 제6장. 연구 과정에서 수집한 해외 과학기술 정보 ... 29
• 제7장. 연구개발성과의 보안등급 ... 30
• 제8장. 국가과학기술종합정보시스템에 등록한 연구시설·장비 현황 ... 30
• 제9장. 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전 조치 이행 실적 ... 30
• 제10장. 연구개발과제의 대표적 연구 실적 ... 31
• 제11장. 기타 사항 ... 32
• 제12장. 참고 문헌 ... 32
• 끝페이지 ... 33