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전통천연물 멀티오믹스 기반 맞춤형 바이오마커 기술 개발
Identification of the biomarkers of the traditional natural products by multi-omics technologies 원문보기

보고서 정보
주관연구기관 차의과학대학교
CHA University
연구책임자 김성진
참여연구자 최명숙 , 전향숙 , 조명행 , 류광현 , 김승일
보고서유형1단계보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2015-11
과제시작연도 2013
주관부처 미래창조과학부
Ministry of Science, ICT and Future Planning
등록번호 TRKO201800008171
과제고유번호 1711001941
사업명 바이오·의료기술개발
DB 구축일자 2018-05-19
키워드 멀티오믹스.차세대염기서열분석법.전통천연물.대체독성.바이오마커.대사성 스트레스.복합천연물제제/복합표적.시스템 생물학.다중 진단 키트.Multi-omics.Next generation sequencing.Traditional natural products.Alternative toxicity test.Biomarker.Metabolic stress.Multi-component/multi-target.Systems Biology.Multiple diagnosis kit.
DOI https://doi.org/10.23000/TRKO201800008171

초록

본 연구과제에서는 다음과 같은 연구결과를 달성. (1) 대사성 질환 마우스 모델의 조직에 대한 대규모 전사체 분석을 통하여 신규 오믹스 비만마커 유전자들의 발현량을 검증하였고, in vitro 모델에서 역할을 규명하였으며, 마커 유전자 변이 동물 모델을 디자인하고 제작. (2) 임상 데이터베이스를 구축하고 오믹스마커 단백질을 임상샘플에서 검증. (3) 오믹스마커 분비 단백질 진단 키트 제작을 위한 기반기술 마련. (4) 대사성 스트레스 동물모델을 대상으로 천연물 복합 조성물의 유효성을 검증. (5) 전통천연물의 독성 유발 가능성을

Abstract

The ultimate goals of the study are to identify multi-component/multi-target (MC/MT) biomarkers through multi-omics data analysis and to establish a clinical database for the development of personalized diagnostic technology. Under the objective of identifying biomarkers from multi-omics data analys

목차 Contents

  • 표지 ... 1
  • 제 출 문 ... 2
  • 보고서 요약서 ... 3
  • 요 약 문 ... 4
  • SUMMARY ... 7
  • 목차 ... 9
  • 제1장 연구개발과제의 개요 ... 11
  • 제1절 연구개발의 필요성 ... 11
  • 제2절 연구의 범위 ... 12
  • 제2장 국내외 기술개발 현황 ... 13
  • 제1절 해외 기술개발 현황 ... 13
  • 제2절 국내 기술개발 현황 ... 13
  • 제3절 국내외 연구개발 완료 및 개발중인 천연물소재의 활용 현황 ... 14
  • 제4절 바이오마커개발 세계 컨소시엄 구성현황 ... 18
  • 제5절 국외 주요 독성유전체학 및 독성예측 연구개발 현황 ... 19
  • 제3장 연구개발수행 내용 및 결과 ... 21
  • 4중과제 1세부 ... 21
  • 제1절 비만 동물모델에서 얻은 전사체 데이터(RNA-seq 및 microarray) 분석을 통한 신규 바이오마커 발굴 ... 21
  • 제2절 신규 바이오마커에 대한 in vitro 검증 및 작용기작 규명 ... 44
  • 제3절 전통천연물의 항비만효과에 대한 in vitro 검증 ... 63
  • 제4절 마우스 혈액을 활용한 비만 바이오마커 검증 ... 74
  • 제5절 비만 바이오마커에 대한 임상 데이터베이스 구축 ... 79
  • 제6절. 비만 바이오마커 검증용 동물모델 제작 ... 85
  • 제7절. 오믹스마커를 활용한 분석키트 개발 기반마련 ... 90
  • 제8절. 대사성 질환인 위암에 대한 유전체 및 전사체 데이터 분석을 통한 신규 바이오마커 발굴 및 검증 ... 93
  • 제 9 절. 대사성 질환과 관련된 TGF-beta 신호전달에 관여하는 신규 바이오마커 발굴 및 검증 ... 114
  • 4중과제 2세부 ... 137
  • 제1절. 실험 Ⅰ. C57BL/6J mice의 비만 유도 및 비만 진행에 따른 phenotype과 전사체 마커분석 (Normal group vs High-fat group) ... 137
  • 제2절. 실험 Ⅱ. C57BL/6J mice를 이용한 항비만 전통천연물(녹차추출물, 태음조위탕, 방품통성산) 처방제의 유효성 확인 및 작용기작 규명 ... 193
  • 제3절. 실험Ⅲ. 추가 시료 확보를 위한 2차 동물 실험 ... 307
  • 제4절. 실험 Ⅳ. 비만 개선용 표준 전통천연물처방소재와 유효성분 스크린 방법 set up 및 효능평가 실시 ... 310
  • 제5절. 실험 Ⅴ. 태음조위탕 구성성분중 길경의 항비만 유효성 확인을 위한 phenotype 마커 분석 ... 334
  • 제6절. 실험Ⅵ. C57BL/6J mice를 이용한 항비만 전통천연물 태음조위탕 처방제 구성성분 나복자 유효성 확인을 위한 phenotype 및 관련 장내 미생물 균총 분석 (진행중) ... 343
  • 제7절. 실험Ⅶ. 비만 동물모델(C57BL/6J mice)에서 “비타민나무” 항비만 유효성 확인을 위한 phenotype 마커 분석 (진행중) ... 356
  • 제8절. 실험 Ⅷ. 태음조위탕내 유효성분을 선별하여, 해당되는 천연물 소재로부터 유효성분의 추출수율을 높이는 공정 개발 :설포라핀 (sulforaphene)이 강화된 내복자추출물 제조 공정 확립 (진행중) ... 364
  • 4중과제 3세부 ... 370
  • 제1절 in vitro 지방간 모델을 통한 기전 연구 및 바이오 마커 도출 ... 370
  • 제2절 미토콘드리아 독성 평가 기전 연구 ... 390
  • 4중과제 4세부 ... 422
  • 제1절 독성 후보 물질 탐색 ... 422
  • 제2절 적정 data mining 분석법 탐색 ... 422
  • 제3절 Combinatorial optimization 분석 및 독성 후보물질의 상호작용 분석 ... 422
  • 제4절 독성후보 물질의 상호작용 database 구축 ... 456
  • 제5절 세포 소기관 독성 여부 분석 ... 458
  • 제6절 독성 유발 조건 확립 및 독성 바이오마커 스크리닝 ... 473
  • 4중과제 5세부 ... 499
  • 제1절 천연물소재 주요 구성성분 구명 ... 499
  • 제2절 Compound K-강화 ginsenoside 분획의 항비만 효과 특이적 내인성 대사체지표 발굴 ... 500
  • 4중과제 6세부 ... 508
  • 제1절 동물모델을 이용한 천연물 복합성분의 항비만 효능 실험 1 : 몸무게 변화 분석 ... 508
  • 제2절 동물모델을 이용한 천연물 복합성분의 항비만 효능 실험 2 : 간 및 지방 조직 무게 비교 ... 508
  • 제4절 동물모델을 이용한 천연물 복합성분의 항당뇨 효능 실험 1 : 포도당 저항성 ... 509
  • 제5절 동물모델을 이용한 천연물 복합성분의 항당뇨 효능 실험 2 : 인슐린 저항성 ... 509
  • 제6절 천연물 복합성분에 의한 간조직 단백질체 변화 분석 1 : 단백질 순수 분리 ... 510
  • 제4장 목표달성도 및 관련분야에의 기여도 ... 511
  • 제5장 연구개발결과의 활용계획 ... 517
  • 제1절 2단계 연구의 필요성 ... 517
  • 제2절 다른 연구에의 응용방안 ... 517
  • 제3절 기업화 추진방안 ... 517
  • 제6장 연구개발과정에서 수집한 해외과학기술정보 ... 519
  • 제1절 식이유도비만 및 항비만효과에 대한 오믹스분석 ... 519
  • 제2절 CRISPR을 이용한 유전자결핍 ... 520
  • 제3절 치료용 펩타이드 및 안티바디 약재 개발 ... 522
  • 제7장 연구시설·장비 현황 ... 525
  • 제8장 참고문헌 ... 526
  • 끝페이지 ... 534

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연구자의 다른 보고서 :

참고문헌 (25)