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NTIS 바로가기주관연구기관 | 한림대학교 HalLym University |
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연구책임자 | 조윤신 |
참여연구자 | 임지선 , 박종훈 , 권호정 |
보고서유형 | 1단계보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 | 한국어 |
발행년월 | 2015-01 |
과제시작연도 | 2013 |
주관부처 | 미래창조과학부 Ministry of Science, ICT and Future Planning |
과제관리전문기관 | 한국연구재단 National Research Foundation of Korea |
등록번호 | TRKO201800009566 |
과제고유번호 | 1711003856 |
사업명 | 바이오·의료기술개발 |
DB 구축일자 | 2018-05-26 |
키워드 | 차세대염기서열분석.miRNA 타겟 유전자.miRNA 타겟 예측.차별발현 miRNA.질환후보유전자.microRNA.microRNA-sequencing.Next Generation Sequencing.Cyst formation.ADPKD.Phenotype.Mouse model.Kidney function.Gene expression. |
DOI | https://doi.org/10.23000/TRKO201800009566 |
본 세부과제는 다요인성 질환의 분자생물학적 원인 규명의 일환으로 생산된 miRNA 시퀀싱 데이터의 분석 pipeline 구축을 최종 목적으로 하여 (1) 질환 모델로부터 total miRNAs의 발굴, (2)질환 관련 후보 miRNAs 발굴 그리고 (3) 질환 관련 후보 miRNAs의 타겟유전자 예측 의 3개 세부목표를 설정하여 진행하였음. 1단계 연구에서는 제1세부과제의 두 가지 대표적인 다낭신 마우스 모델인 Pkd1 conditional knockout (cKO) 마우스 및 Pkd2 cKO 마우스를 이용하여 낭포형성 관련 miR
Ⅳ. Results
(1) Isolation of total miRNA from the disease model system
- miRNA-seq data were obtained from ADPKD mouse and UQCRB mutant cell line
- Quality control (QC) standard was determined by excluding miRNAs with group average read count less than 10.
- Quantile method was selected f
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