[보고서]벼, 맥류 유전자원 농업적 유용형질 특성평가 연구

현도윤

보고서 정보

주관연구기관

국립농업과학원
National Institute of Agricultural Sciences

연구책임자

현도윤

참여연구자

최유미 , 박홍재 , Asjad Ali , 이기안 , 고호철 , 허온숙 , 오세종 , 이명철 , 이수경

보고서유형

최종보고서

발행국가

대한민국

언어

한국어

발행년월

2018-02

과제시작연도

2017

주관부처

농촌진흥청
Rural Development Administration(RDA)

과제관리전문기관

농촌진흥청
Rural Development Administration

등록번호

TRKO201800043152

과제고유번호

1395050218

사업명

농업기초기반연구

DB 구축일자

2018-12-15

키워드

벼.밀.유전자원.유용형질.특성평가.Genetic resources.rice.wheat.evaluation.useful trait.

DOI

https://doi.org/10.23000/TRKO201800043152

표 List of germplasm used in development of NIRS Model for amylose and protein
표 List of germplasm used in development of NIRS Model for amylose and protein
표 Origin distribution of landrace germplasm used in this study
표 Origin distribution of rice variety germplasm used in NIRS analysis
표 Origin distribution of rice weed type germplasm used in NIRS analysis
표 Origin distribution of rice breeding line germplasm used in NIRS analysis
표 Division of the infrared region by wavelength and wavenumber
표 Schematic of relationship between stretching and bending mode in fundamental vibration
표 Procedure of analyzing the data from NIR spectra with functional group absorption bands ranging NIR from MIR region
표 Relationship of wavenumbers among the fundamental, combination and overtone vibration. A: Correlation between fundamental vibration in mid-infrared (MIR) and overtone vibration B: Synthesis of combination vibration from two fundamental vibration
표 The NIR spectra from landrace germplasm using NIRS in condition of the milled brown rice
표 The raw NIR absorbance spectra of three milled brown rice (A) and processed derivative spectra (B)
표 Frequency distribution table for probability density function on protein contents of rice germplasm
표 The Probability density function of protein content in rice variety germplasm
표 Frequency distribution table for mean and variance calculation on amylose contents of rice germplasm
표 The Probability density and value of normal distribution
표 Analysis of variance(ANOVA) table
표 F-distribution table
표 Distribution table of amylose contents (%) in rice variety germplasm by countries
표 Statistic data table for ANOVA test on amylose contents by countries
표 ANOVA table of amylose content in rice variety germplasm by countries
표 Studentized range for multiple test
표 Mean amylose contents by countries and LSR value table for DMRT
표 Amylose (A) and protein (B) content in the milled brown rice for NIRS prediction model
표 Amylose and protein content in the milled brown rice betweem stored germplasm and regenerated germplasm. (A and C: Amylose and protein content of stored germplasm, B and D: Amylose and protein content of regenerated germplasm)
표 Correlation plots between NIRS measurements and milled brown rice amylose content (A: Stored germplasm, B: Regenerated germplasm) and protein content (C: Stored germplasm, D: Regenerated germplasm). Calculation was based on 511 stored germplasm and 190 regenerated germplasm
표 Calibration equation and cross validation results for the amylose and protein content of brown rice and milled brown rice
표 Correlation plots between NIRS data and amylose content (A: brown rice, B: milled brown rice) and protein (C: brown rice, D: milled brown rice).
표 Calibration and cross validation results for the amylose and protein content of modified NIRS prediction model and NIRS draft prediction model
표 Correlation plots between NIRS data and amylose content (A: Modified NIRS prediction model, B: NIRS draft model) and protein (C: Modified NIRS prediction model, D: NIRS draft model) in the milled brown rice germplasm
표 External validation results of NIRS equation model for the amylose and protein content in the milled brown rice
표 Comparison of amylose content (%) in standard brown rice varieties by different methods
표 Comparison of protein content (%) in standard brown rice varieties by different methods
표 The peaks separation derived from NIR spectrum shown by a rice landrace using WINISI Ⅲ project manager program
표 Amylose (A) and protein (B) content in the rice landrace germplasm using NIRS
표 Selection of fifty resources with low amylose contents in landrace germplasm
표 Selection of fifty resources with high amylose contents in landrace germplasm
표 Selection of fifty resources with low protein contents in landrace germplasm
표 Selection of fifty resources with high protein contents in landrace germplasm
표 Distribution of amylose (A) and protein (B) content in the rice landrace germplasm using NIRS
표 Coefficient of determination (R2=0.0012) between amylose and protein contents in the rice landrace germplasm by NIRS
표 Classification of rice landrace germplasm in amylose content by NIRS
표 Amylose (A) and protein (B) content in the rice landrace germplasm of four countries using NIRS
표 The NIR spectra from rice variety germplasm using NIRS in condition of the milled brown rice
표 Amylose (A) and protein (B) content in the rice variety germplasm and amylose (C) and protein (D) content in the rice landrace germplasm by NIRS
표 Selection of fifty resources with low amylose contents in rice variety germplasm
표 Selection of fifty resources with high amylose contents in rice variety germplasm
표 Selection of fifty resources with low protein contents in rice variety germplasm
표 Selection of fifty resources with high protein contents in rice variety germplasm
표 The Normal distribution and probability of protein content in rice variety germplasm
표 Diagram for standardization of mormal distribution
표 List of representative resources classified with protein contents in rice variety germplasm
표 The Normal distribution and probability of amylose content in rice variety germplasm (n=6,157)
표 The Normal distribution and probability of low amylose content in rice variety germplasm
표 List of representative resources classified with low amylose contents in rice variety germplasm
표 The Normal distribution and probability of high amylose content in rice variety germplasm (n=5,548)
표 List of representative resources classified with high amylose contents in rice variety germplasm
표 List of representative resources classified with high amylose contents in rice variety germplasm
표 Classification of rice variety germplasm in amylose content by NIRS
표 Coefficient of determination (R2=0.000) between amylose and protein contents in rice variety germplasm by NIRS
표 Amylose (A) and protein (B) content in the rice variety germplasm of four countries by NIRS
표 ANOVA table of amylose contents in rice variety germplasm by countries
표 ANOVA table of protein contents in rice variety germplasm by countries
표 DMRT table of amylose contents in rice variety germplasm by countries
표 DMRT table of protein contents in rice variety germplasm by countries
표 Amylose and protein contents in rice variety germplasm by countries
표 28. The Normal distribution and probability of protein content in rice weed type germplasm
표 List of representative resources classified with protein contents in weed type germplasm
표 The Normal distribution and probability of amylose content in rice weed type germplasm (N=6,206)
표 The Normal distribution and probability of low amylose content in weed type germplasm
표 39. List of representative resources classified with low amylose contents in rice weed type germplasm
표 The Normal distribution and probability of high amylose content in rice weed type germplasm
표 List of representative resources classified with high amylose contents in weed type germplasm
표 List of representative resources classified with high amylose contents in weed type germplasm
표 Amylose (A) and protein (B) content in the rice weed type germplasm using NIRS
표 Classification of rice weed type germplasm in amylose content by NIRS
표 Coefficient of determination (R2=0.006) between amylose and protein contents in rice weed type germplasm by NIRS
표 The Normal distribution and probability of protein content in rice breeding line germplasm
표 List of representative resources classified with protein contents in rice breeding line germplasm
표 The Normal distribution and probability of amylose content in rice breeding line germplasm(N=3,000)
표 The Normal distribution and probability of low amylose content in rice breeding line germplasm
표 List of representative resources classified with low amylose contents in rice breeding line germplasm
표 The Normal distribution and probability of high amylose content in rice breeding line germplasm
표 List of representative resources classified with high amylose contents in rice breeding line germplasm
표 List of representative resources classified with high amylose contents in rice breeding line germplasm
표 Amylose (A) and protein (B) content in the rice breeding line germplasm using NIRS
표 Classification of rice breeding line germplasm in amylose content by NIRS
표 Coefficient of determination (R2=0.009) between amylose and protein contents in rice breeding line germplasm by NIRS
표 Amylose (A) and protein (B) content in the rice breeding line germplasm of four countries by NIRS
표 벼 흰잎마름병 접종 후 이병성 정도 측정
표 중국 원산 벼 유전자원의 균주별 저항성 분포도
표 대만 원산자원의 흰잎마름병 저항성 분포도
표 균주별 저항성 선발자원
표 우리나라 앵미 유전자원의 흰잎마름병 균주별 저항성 자원분포도
표 균주별 저항성 선발자원
표 GWAS 분석을 위한 벼 흰잎마름병 레이스별 저항성 자원 분포
표 선발자원의 library PCR 증폭산물
표 SNP 필터 단계별 통계치
표 염색체별 66,391 SNP마커 분포도
표 GWAS분석에 사용된 192개 자원의 근연관계도
표 AAF값에 따른 –log10 (P-value) 비교 분석(K1 레이스)
표 K1의 Manhattan plots (MLM)과 Quantile-Quantile plots (Q-Q) 연관분석결과
표 벼 흰잎마름병 K1 레이스 저항성 후보 유전자군
표 K2의 Manhattan plots (MLM)과 Quantile-Quantile plots (Q-Q) 연관분석결과
표 벼 흰잎마름병 K2 레이스 저항성 후보 유전자군
표 K3의 Manhattan plots (MLM)과 Quantile-Quantile plots (Q-Q) 연관분석결과
표 벼 흰잎마름병 K3 레이스 저항성 후보 유전자군
표 K3a의 Manhattan plots (MLM)과 Quantile-Quantile plots (Q-Q) 연관분석결과
표 벼 흰잎마름병 K3a 레이스 저항성 후보 유전자군
표 시험연구 연도별 공시자원
표 2015년 저온발아 검정대상 자원 생태형 ※ IRRI, ARS, Garris et al(2005) 분류 참고
표 2016년 저온발아 검정대상 자원
표 2017년 저온발아 검정대상 자원
표 벼 생태형 별 저온발아율 분포
표 벼 생태형 별 평균 저온발아율 및 초엽길이
표 벼 생태형 별 초엽길이 분포
표 북한, 중국 원산 자원 저온발아율 분포
표 북한, 중국 원산 자원 초엽길이 분포
표 저온발아성 우수자원
표 북한, 운남, 흑룡강 자원의 혐기발아율(좌) 및 초엽길이(우)
표 혐기발아성 우수자원
표 특성평가 완료 자원 평균 저온발아율
표 이화학적 특성 평가자원 저온발아율 분포
표 흰잎마름병 저항성 자원 저온발아율 분포
표 도열병 유전자 집적 자원 저온발아율 분포
표 저온발아 표현형과 qLTG3-1 allele 연관분석
표 후보 SNP 마커의 통계값
표 저온발아 CAPS/dCAPS 마커 정보
표 저온발아 강/약 자원의 CAPS/dCAPS 마커 밴드 패턴. A : LTG_8-A/T, B :qLTG4b-1-G/A, C : qLTG2-6-A/G, M : 100bp Ladder
표 평가대상 자원의 SNP 마커를 이용한 genotyping 및 allele 별 phenotype
표 저온발아성 마커 조합별 자원 발아율 및 초엽길이
표 마커 조합 별 생태형 저온발아율 및 초엽길이
표 벼 생태형의 마커 allele 별 저온발아율(좌) 및 초엽길이(우)
표 벼 저온발아성 표현현과 마커 allele 간 χ2-test 결과
표 GWAS 분석 후 탐색된 저온발아성 신규 후보 QTL 영역
표 저온발아율 관련 Manhattan plot(상) 및 후보 QTL 지역 유전자 분포
표 저온발아성과 혐기발아성 QTL 통합 지도(좌) 및 SNP 마커 선발 지역(우)
표 전체 192자원 genotyping 결과(좌) 및 SNP 마커 별 allele 판별(우)
표 저온/혐기 공통적용 마커 개발을 위한 다형성 마커 선발
표 ANOVA 분석에 의한 저온발아율, 초엽길이 관련 신규 마커 탐색
표 벼 도열병 저항성 유전 선발을 위한 DNA 마커 및 특성
표 분자표지를 이용한 대조구의저항성 12유전자원의 저항성 유무 검정 A: 저항성 마커, B: 감수성마커, C: SSR 마커의 모세관 전기영동 결과
표 일본원산 벼 유전자원의 도열병 저항성 유전자 분포도
표 일본원산 벼 유전자원의 도열병 저항성 유전자 집적자원 분포도
표 6개 이상 저항성 유전자를 갖는 일본원산 자원
표 일본원산 벼 유전자원의 벼 도열병 저항성 유전자 PCA 분석
표 일본 원산 벼 유전자원의 벼 도열병 저항성 유전자 PCA 분석
표 중국원산 벼 유전자원의 도열병 저항성 유전자 분포도
표 중국원산 벼 유전자원의 도열병 저항성 유전자 집적자원 분포
표 중국원산 벼 유전자원의 벼 도열병 저항성 유전자 PCA 분석
표 중국 원산 벼 유전자원의 벼 도열병 저항성 유전자 PCA 분석
표 도열병 저항성 유전자 고집적 자원의 밭못자리 검정
표 아시아원산 자원 현황
표 조숙성 분석 자원 현황
표 사용마커 정보
표 PCR 조건
표 각 allele별 DNA마커 분석 PCR밴드 패턴 A: Glu-A1x allele, B: Glu-B1x allele, C: Glu-B1y allele, D: Glu-D1xy allele 1:Mexico 120, 2:Joonmo2003, 3:yv01-37, 4:Ducula, 5:Hongfu-1, 6:Sirohosha 7:Guoji-13, 8:Grumil
표 SDS-PAGE를 통한 standard line의 HMW-GS 밴드패턴 A: Glu-A1x allele, B: Glu-B1xy allele, D: Glu-D1xy allele 1:Mexico 120, 2:Joonmo2003, 3:yv01-37, 4:Ducula, 5:Hongfu-1, 6:Sirohosha 7:Guoji-13, 8:Grumil
표 Glu-1 점수체계(Payne et al., 1987)
표 아시아원산 밀 자원의 원산지별 Glu-1 유전자 분포
표 조숙성 밀 자원의 대륙별 Glu-1 유전자 분포
표 아시아 원산 자원의 원산지별 Glu-1 loci의 allele 조합의 PIC
표 아시아 자원대상 원산지별 Glu-1 loci의 각 allele조합을 바탕으로 한 군집분석
표 아시아 원산 자원의 원산지별 Glu-1점수 분포
표 조숙성 자원의 대륙별 Glu-1점수 분포
표 우수자원의 성숙기 및 출수기 분포
표 글루테닌 조성과 숙기 고려해 선발한 유용 유전자원

과제명(ProjectTitle) :	-
연구책임자(Manager) :	-
과제기간(DetailSeriesProject) :	-
총연구비 (DetailSeriesProject) :	-
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과제수행기간(LeadAgency) :	-
연구목표(Goal) :	-
연구내용(Abstract) :	-
기대효과(Effect) :	-

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[국가R&D연구보고서] 벼, 맥류 유전자원 농업적 유용형질 특성평가 연구
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