초록 ▼

□ 연구의 목적 및 내용
배 고유종 GBS 분석 방법을 확립하고, 유전지도 작성을 통해 배 과실형 QTL 분석 결과 활용 및 분자마커 개발 지원함과, 다부처 유전체사업 배 슈퍼스캐폴드 조립을 지원함

□ 연구개발성과
○ 배 제놈 소기관 제놈 조립과 개체별 시퀀스 특성을 분석하기 위하여 원황배, 신고 등 주재배품종 포함 15종에 대한 단거리 서열 분석 및 엽록체 제놈 조립
- SCI 논문게재: Complete chloroplast genome sequences of Wonwhang (Pyrus pyrifol

□ 연구의 목적 및 내용
배 고유종 GBS 분석 방법을 확립하고, 유전지도 작성을 통해 배 과실형 QTL 분석 결과 활용 및 분자마커 개발 지원함과, 다부처 유전체사업 배 슈퍼스캐폴드 조립을 지원함

□ 연구개발성과
○ 배 제놈 소기관 제놈 조립과 개체별 시퀀스 특성을 분석하기 위하여 원황배, 신고 등 주재배품종 포함 15종에 대한 단거리 서열 분석 및 엽록체 제놈 조립
- SCI 논문게재: Complete chloroplast genome sequences of Wonwhang (Pyrus pyrifolia) and its phylogenetic analysis, 성과기여율 50%
- SCI 논문게재: The complete mitochondrial genome of Wonwhang (Pyrus pyrifolia), 성과기여율 50%
- NCBI 유전자 배 엽록체 조립 등록: KX450876(원황) 등 12종 등록
○ 신고배와 원황배 엽록체에 있는 ndhA 유전자의 In/del을 찾고, 배 우수품종 29종 및 사과 1종에 대한 시퀀스를 분석하여 모계 품종 구분 마커를 개발
- 특허출원: 배 품종 식별용 조성물(ndhA 유전자) 10-2917-0152286
○ 원황배 X 바틀렛 교배주 F1 94개체에 대한 유전지도 작성
- 배 엽록체 수와 같은 17개 염색체에, 970개 유전자좌, 총 6,085.2cM을 가진 유전지도 작성
∙ 위치된 마커 970개 중 GBS 분석에 의한 SNP 마커가 892종이었고, 원황배 시퀀스 유래 SSR 마커 78개가 위치되었다.
○ 다부처유전체사업 배 해독연구에서 작성한 2,221개 스캐폴드에 대하여 435개 스캐폴드, 총 길이 319.2Mb에 대한 위치정보를 연계하였다.
- 배 제놈 어셈블 총 길이 516.6Mb에 대한 62% anchoring 정보를 부여하였다.
○ 배 과실특성에 대한 QTL 분석을 수행하여 이 중, 당도, 산도, 배 식감 등에 대한 QTL 위치를 탐색하였다.
- 당도는 Chr4번에서 2개 위치와 5와 17번 염색체에서 관찰되었고, 식감 QTL은 염색체 7번, 12번, 15번에서 관찰되었다. 산도는 염색체 2번, 8번, 9번 및 13번에서 관찰되었다. 이 영역에 위치한 SSR 마커 및 유전자 특성을 분석 예정이다.

□ 연구개발성과의 활용계획(기대효과)
○ 배 제놈 해독 논문 작성을 위한 Pseudomolecule 완성 지원
○ 엽록체 유래 마커 ndhA, clpP 유전자 활용 우리나라 배 품종에 대한 시퀀스를 분석하여 모계유전을 확인함
○ 배 QTL 분석 결과 확보한 단맛, 신맛, 배 식감 등이 위치한 SSR 마커 육종기관에 지원 및 QTL 위치 유전자 분석하여 후보유전자 탐색 및 전수

(출처 : 국 문 요 약 문 4p)

Abstract ▼

□ Purpose& Contents
∙ Establish GBS genetic mapping of pear(Pyrus pyrifolia) and Utilize QTLs analysis markers
∙ Support to scaffolds assembly for pear psuedomolecules

□ Results
∙ (SCI) Complete chloroplast genome sequences of Wonwhang (Pyrus pyrifolia) and its phylogenetic analysis

□ Purpose& Contents
∙ Establish GBS genetic mapping of pear(Pyrus pyrifolia) and Utilize QTLs analysis markers
∙ Support to scaffolds assembly for pear psuedomolecules

□ Results
∙ (SCI) Complete chloroplast genome sequences of Wonwhang (Pyrus pyrifolia) and its phylogenetic analysis (Mithochondrial DNA part B:resources 2017, vol2 No1, 325-326)
∙ (SCI) The complete mitochondrial genome of Wonwhang (Pyrus pyrifolia) (Mithochondrial DNA part B:resources 2017, vol2 No2, 902~903
∙ (Patent) Distinguish for cultivar based on maternal line using ndhA genes in chloroplast genome 10-2917-0152286
∙ (GeneBank Registration) KX450876(Wonwhang), KX825882(Imamuraaki), KX450885(Osa-Nijisseiki), KX825883(Manwhang), KX450881(Yali), KX904342(Niitaka), KX450880(Dangshansuli), KX450882(Xioxiangshui), KX450883(Cheongshilli), KX450884(Greensis), KX450879(Bartlett), KX450877(Whangkeumbae), 12 cultivars

□ Expected Contribution
∙ Supports completion for Pseudomolecule of Wonwhang(Pyrus pyrifolia)
∙ Chloroplast-derived markers ndhA, clpP gene utilization to pear cultivars
∙ Support for SSR markers and related genes to breeding institute with sweetness, acid, and texture QTLs

(출처 : Summary 5p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 국 문 요 약 문 ... 4
• Summary ... 5
• 목차 ... 6
• 제 1 장 연구 개발 과제의 개요 ... 7
• 제1절 연구 개발 목적 ... 7
• 제2절 연구 개발의 필요성 ... 7
• 제3절 연구 개발 범위 ... 7
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 8
• 제 3 장 연구 수행 내용 및 결과 ... 9
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 52
• 제1절 : 목표대비 달성도 ... 52
• 제2절 : 정량적 성과(논문게재, 특허출원, 기타)를 기술 ... 53
• 제 5 장 연구 결과의 활용 계획 ... 54
• 제 6 장 연구 과정에서 수집한 해외 과학 기술 정보 ... 55
• 제 7 장 연구 개발 결과의 보안 등급 ... 56
• 제 8 장 국가과학기술지식정보서비스에 등록한 연구시설·장비 현황 ... 57
• 제 9 장 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전조치 이행실적 ... 58
• 제 10 장 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 59
• 제 11 장 기타사항 ... 60
• 제 12 장 참고문헌 ... 61
• 끝페이지 ... 62