초록 ▼

발달 및 휴면 연계 애기장대 종자의 통합유전체 지도를 작성하고 그 역동성을 분석하기 위하여 다음의 연구를 수행함
- 애기장대 두 생태종(Col-0: low dormancy, Cvi: high dormancy) 및 세 종자 발달단계(성숙, 건조, 발아)에 따른 6 종류 종자 샘플을 대상으로 3 종류의 히스톤 변형 지표 (H3K4me3, H3K9me3, H3K27me3), 3 종류의 DNA methylome (CG, CHG, CHH), small RNAome, lncRNAome 및 transcriptome 데이터 확보
- 종

발달 및 휴면 연계 애기장대 종자의 통합유전체 지도를 작성하고 그 역동성을 분석하기 위하여 다음의 연구를 수행함
- 애기장대 두 생태종(Col-0: low dormancy, Cvi: high dormancy) 및 세 종자 발달단계(성숙, 건조, 발아)에 따른 6 종류 종자 샘플을 대상으로 3 종류의 히스톤 변형 지표 (H3K4me3, H3K9me3, H3K27me3), 3 종류의 DNA methylome (CG, CHG, CHH), small RNAome, lncRNAome 및 transcriptome 데이터 확보
- 종자 샘플(6 종류) 별 및 후성유전체 지표(9 종류) 별 총 54개의 후성유전체 지도 작성
- 9 종류 후성유전체 지표에 대한 DOG1, FUS3, ABI3, CYP707A2, GA3ox1, GA20ox2 loci에서의 종자 발달 및 휴면 연계 역동성 분석


(출처 : 보고서 요약서 3P)

Abstract ▼

Purpose & Contents
- Construction of the development-associated integrated epigenome map of Arabidopsis seeds
- Construction of the dormancy-associated integrated epigenome map of Arabidopsis seeds
- Analysis of transcriptome, small RNAome, lncRNAome, DNA methylome, epigenome-level histone

Purpose & Contents
- Construction of the development-associated integrated epigenome map of Arabidopsis seeds
- Construction of the dormancy-associated integrated epigenome map of Arabidopsis seeds
- Analysis of transcriptome, small RNAome, lncRNAome, DNA methylome, epigenome-level histone modifications (H3K4me3, H3K9me3, H3K27me3), and the relationship between them
- Analysis of the development-associated dynamics of seed epigenome
- Analysis of the dormancy-related characteristics of Arabidopsis seed epigenome

Results
We performed the following researches to construct a development- and dormancy-associated integrated epigenome map of Arabidopsis seeds and to analyze its dynamics.
- We obtained data for 3 histone modifications (H3K4me3, H3K9me3, H3K27me3), 3 DNA methylomes (CG, CHG, CHH), small RNAomes, lncRNAomes, and transcriptomes using Arabidopsis seeds of two ecotypes (Col-0: low dormancy, Cvi: high dormancy) each at 3 developmental stages (freshly harvested, after ripened, germination stimulated).
- We constructed total 54 epigenome maps for the 6 kinds of seeds and the 9 kinds of epigenetic marks.
- We analyzed development- and dormancy-associated dynamics of the 9 epigenetic marks at the DOG1, FUS3, ABI3, CYP707A2, GA3ox1, and GA20ox2 loci.

Expected Contribution
- Contribution to researches for the epigenetic understanding of seed development and its biotechnological application
- Contribution to researches for the epigenetic understanding of seed dormancy and its biotechnological application
- Contribution to crop biotechnology to improve seed size, productivity, metabolism, and storage
- Contribution to the discovery and development of epigenetic resources and ideas for next-generation molecular breeding of seeds
- Contribution to the discovery of histone modifiers, DNA methyltransferases/demethylases, and regulatory non-coding RNAs etc. for the regulation of epigenome
- Contribution to future epigenome studies using other plant species and tissues


(출처 : Summary 5P)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 국 문 요 약 문 ... 4
• Summary ... 5
• 목차 ... 6
• 제 1 장 연구 개발 과제의 개요 ... 7
• 제1절 연구 개발 목적 ... 7
• 제2절 연구 개발의 필요성 ... 7
• 제3절 연구 개발 범위 ... 10
• 제 2 장 국내외 기술개발 현황 ... 11
• 제1절 국내 기술개발 현황 ... 11
• 제2절 국외 기술개발 현황 ... 12
• 제3절 연구결과가 차지하는 위치 ... 16
• 제 3 장 연구 수행 내용 및 결과 ... 17
• 제 4 장 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 84
• 제1절 : 목표대비 달성도 ... 84
• 제2절 : 정량적 성과(논문게재, 특허출원, 기타)를 기술 ... 85
• 제 5 장 연구 결과의 활용 계획 ... 86
• 제 6 장 연구 과정에서 수집한 해외 과학 기술 정보 ... 87
• 제 7 장 연구 개발 결과의 보안 등급 ... 88
• 제 8 장 국가과학기술지식정보서비스에등록한연구시설·장비현황 ... 89
• 제 9 장 연구개발과제수행에따른연구실등의안전조치이행실적 ... 90
• 제 10 장 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 92
• 제 11 장 기타사항 ... 93
• 제 12 장 참고문헌 ... 94
• 끝페이지 ... 98