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NTIS 바로가기주관연구기관 | 국립원예특작과학원 National Institute of Horticultural and Herbal Science |
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연구책임자 | 김진희 |
참여연구자 | 이은수 , 이혜은 , 김도선 , 홍종필 , 문지혜 , Abinaya Manivannan , 최승국 |
보고서유형 | 최종보고서 |
발행국가 | 대한민국 |
언어 | 한국어 |
발행년월 | 2019-03 |
과제시작연도 | 2018 |
주관부처 | 농촌진흥청 Rural Development Administration(RDA) |
등록번호 | TRKO201900015910 |
과제고유번호 | 1395056877 |
사업명 | 원예특작시험연구(R&D,책임운영) |
DB 구축일자 | 2019-09-21 |
키워드 | 초고속.분자표지.오이.무.high-throughput.marker.cucumber.radish.SNP. |
DOI | https://doi.org/10.23000/TRKO201900015910 |
< 주요 연구성과 >
○ 오이와 무의 육종소재 핵심계통 선발 및 전사체 염기서열 분석
- 핵심계통 선발(오이 38, 무 35), RNA를 활용한 cDNA 제작
○ 오이와 무의 전사체 분석을 통한 계통 사이의 SNP 및 생물정보 분석
- 각각의 cDNA에 대한 NGS 시퀀싱, read 정보 확보
○ 마커로서의 효용성 있는 유용 SNP 선발
- 각 계통 간 다형성 있는 SNP를 선발하였으며, 신뢰도,다형성 지수, 동형접합성, 분리비 등 조건을 고려하여 유용 SNP를 선발 및 Fluidigm MAB용 마커
□ Purpose & Contents
○ Development of high-throughput marker using sequence in cucumber and radish
- Selection of useful SNPs and development of molecular markers in core lines of cucumber and radish
- Application and validation of developed SNP marker set from core lines and F1 cultivars i
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