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드노보 유전체 어셈블리를 위한 참조 유전체 기반 하이브리드 시스템 개발 원문보기

보고서 정보
주관연구기관 건국대학교
KonKuk University
연구책임자 김재범
보고서유형1단계보고서
발행국가대한민국
언어 한국어
발행년월2018-03
과제시작연도 2017
주관부처 과학기술정보통신부
Ministry of Science and ICT
등록번호 TRKO202000006868
과제고유번호 1711058651
사업명 포스트게놈신산업육성을위한다부처유전체사업(미래부)
DB 구축일자 2020-09-12
키워드 드노보 유전체 어셈블리.참조 유전체.차세대 시퀀싱.De novo genome assembly.Reference genome.Next generation sequencing.

초록

원본 유전체가 없는 생물종으로부터 생성된 NGS 리드의 신뢰도 높은 어셈블리를 위해 참조유전체 기반 드노보 어셈블리 하이브리드 시스템을 개발. 이를 위해 기존 참조 유전체와의 근접성 계산 방법론인 SITRI, de Bruijn 그래프와 SITRI 결과물을 결합하여 컨티그를 생성하는 hCOG, 다양한 인자를 활용하여 다양한 블록 사이즈의 정렬 결과를 유추하는 mMARS, 염색체 혹은 수퍼 스캐폴드를 유추하는 ASSESS 방법론을 개발.

(출처 : 보고서 요약서 3p)

목차 Contents

  • 표지 ... 1
  • 제 출 문 ... 2
  • 보고서 요약서 ... 3
  • 요약문 ... 4
  • 목차 ... 5
  • 1. 연구개발과제의 개요 ... 6
  • 2. 연구수행내용 및 성과 ... 7
  • 2-1. 연구수행 내용 ... 7
  • 2-2. 연구 성과 ... 20
  • 3. 목표 달성도 및 관련 분야 기여도 ... 23
  • 3-1. 목표 ... 23
  • 3-2. 목표 달성도 ... 23
  • 3-3. 관련 분야 기여도 ... 24
  • 3-3. 목표 미달성 시 원인(사유) 및 차후대책(후속연구의 필요성 등) ... 25
  • 4. 연구개발성과의 활용 계획 등 ... 26
  • 5. 연구 과정에서 수집한 해외 과학기술 정보 ... 27
  • 6. 연구개발성과의 보안등급 ... 29
  • 7. 국가과학기술종합정보시스템에 등록한 연구시설·장비 현황 ... 30
  • 8. 연구개발과제 수행에 따른 연구실 등의 안전 조치 이행 실적 ... 31
  • 9. 연구개발과제의 대표적 연구 실적 ... 32
  • 10. 기타 사항 ... 34
  • 붙임. 참고문헌 ... 35
  • 끝페이지 ... 37

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참고문헌 (25)

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