초록 ▼

연구의 목적 및 내용
연구의 목적은 성인 연부조직육종, 나아가 육종환자 전체의 정보를 표준화하고 DB를 통합한 임상데이터를 구축하여, 정보 검색 및 활용을 원활하게 하고자 하는 것이며, 성인 연부조직육종의 임상샘플을 활용하여 세부아형별 분자적 특징을 도출하고, 환자유래세포주를 포함한 세포주 패널을 확립하여 관련 유전자들의 임상적 의미를 검증하고, 역할, 작용기전을 규명하여 진단 및 치료전략수립의 근거를 제안할 수 있는 연구기반을 확립하고자 구성되었음.
이를 위해 다학제적 연구팀을 구성하여 성인연부조직육종의 표준화 데이터베

연구의 목적 및 내용
연구의 목적은 성인 연부조직육종, 나아가 육종환자 전체의 정보를 표준화하고 DB를 통합한 임상데이터를 구축하여, 정보 검색 및 활용을 원활하게 하고자 하는 것이며, 성인 연부조직육종의 임상샘플을 활용하여 세부아형별 분자적 특징을 도출하고, 환자유래세포주를 포함한 세포주 패널을 확립하여 관련 유전자들의 임상적 의미를 검증하고, 역할, 작용기전을 규명하여 진단 및 치료전략수립의 근거를 제안할 수 있는 연구기반을 확립하고자 구성되었음.
이를 위해 다학제적 연구팀을 구성하여 성인연부조직육종의 표준화 데이터베이스를 구축하고, 연구기간중 확보된 임상샘플을 대상으로 유전체 분석을 토대로 관심유전자 도출, 임상적 검증 기반 마련, 항암표적.항암물질 및 보조 약물의 스크리능과 방사선 민감성 관련 유전자들을 발굴하고 치료효과를 예측할 수 있는 연부조직 육종세포주 패널 확립하고, 활용기반을 마련하고자 하였음.

연구개발성과
< 정량적 성과1) >
< 정성적 성과 >
· 성인연부조직육종의 표준화 DB를 구축하였으며, 후향적 환자의 데이터수집이 거의 마무리됨.(1350명/1506명, 일부 항암화학요법 등 데이터 제외)
· 국립암센터의 임상연구검색포털과 연동하여 표준화된 육종 레지스트리를 구현하기 위해, 빅데이터센터와 용어정의, 데이터추출방식을 정하였으며, 후향적 환자의 데이터 중 의학적 판단이 요구되는 항목을 직접입력방식으로 구현하므로써 레지스트리의 질적향상을 도모하였음.
· 외부데이터를 이용한 여러 머신러닝 알고리즘에 대한 기법을 시범운영하였음.
· 국립암센터 내 성인연부조직육종 검체 수집기반 마련
· 연구회의 정례화를 통한 정보수집/교류기반 마련
· 검체유래 세포분리 성공
· 검체유래 세포주 1주 확보
· 한국인 특이적 복잡성 육종아형 5종에 대한 유전체 분석시도(유전체/전사체분석), 아형포괄하는 분자적 단위 집합기준 도출

연구개발성과의 활용계획(기대효과)
· 데이터수집 및 임상시험을 위한 eCRF 사용 등에 있어 연구 간호사 및 연구원을 교육한 바 있음.
이를 토대로 향후 전향적 데이터 수집 및 임상시험설계시 큰 밑거름이 될것으로 판단됨.최대한 많은 변수를 대상으로 한 후향적 임상데이터 수집이 마무리됨에 따라, 향후 전향적 데이터수집이 가능할 것으로 판단되며, 이를 토대로 다양한 임상연구 및 임상시험이 가능할 것으로 판단됨.
· 머신러닝을 이용한 환자예후예측 알고리즘을 계속적으로 적용하여, 새로운 임상적 예후인자를 찾으므로써, 새로운 진료지침 작성에 이바지 할 것으로 판단됨.
· 종양은행 검체를 분양받아 DNA/RNA 추출 및 염기서열을 분석하였고, 이를 토대로 자료분석, CDK4, RB1의 증폭/획득을 중심으로 세 집합을 제안함.
· 이들의 예후예측인자로서의 가능성을 육종에서 제시하기 위한 기준 근거 토대 마련
· 항암전략수립을 위한 항암제 반응성의 표적유전자 후보들을 도출하였음,
· 후속 연구 수행을 통해서, 검체 유래 세포주들과 조직분석을 수행하여, 연부조직육종 항암전략수립을 위한 기반 구축
· 추가 후속연구를 통해 연구결과의 검증이 충분히 이루어진다면, 향후 육종 악성화 기전 이해와 악성화 조절 기전 제안에 기여할 것으로 기대됨.

(출처 : 요약문 2p)

Abstract ▼

Purpose&Contents
Soft tissue sarcomas(STS) are a group of histologically heterogeneous and relatively uncommon tumors. For better understanding of these lesion, we should standardize the clinical database and study for molecular classification and target gene list for therapeutics. To establish t

Purpose&Contents
Soft tissue sarcomas(STS) are a group of histologically heterogeneous and relatively uncommon tumors. For better understanding of these lesion, we should standardize the clinical database and study for molecular classification and target gene list for therapeutics. To establish these goals, we have composed multi-disciplinary research team and defined data variables first. And then, we set up experimental environment for this study by preparing IRB proposal, getting cells originated from soft tissue tumors, and protocols for various analysis. From NCC tumor tissue biobank, we got deposit more than 40 tumor tissues and about 20 normal matched tissues for genomic and transcriptomic analysis. After QC, 14 paired samples were analysed fully and accessed for the research.
A few experimental procotols were established such as RNA FISH, multiple PCR for Copy number variation with genomic DNAs, IHC etc. Finally, we have started to collect tissue samples from tumor and matched normal respectively for the confident research.

Results
We have built up standardized database and SOP for sarcoma patients after repetitive discussion in sarcoma research group. And then we have retrospectively collected every possible clinical information about most subsets of sarcoma patients such as treatment factors and oncologic outcome, etc.
With the samples we first checked that the tumor moiety within tissues and extracted DNAs and RNAs for sequencing analysis. Now we have WES and RNA Seqeunceing results from about 15-20 samples and conducted analysis for listing important genes for the diseases. Similar to TCGA data (2017.11 released), our data (called Korean complex karyotype STS) were grouped with copy number variations, especially CDK4 and RB1.
And, based on transcriptomic analyses, we could suggest a gene, PDGFR, for a therapeutic option in certain group of patients with CDK4 stable group. Although the hypothesis should be further validated, it is meaningful to suggest a therapeutic option for STS at NCC, Korea.
Then, we have got 10 cell lines originated from soft tissue sarcoma for the further confirmation of candidate genes from ATCC for STS panel screening with new chemical candidates and 1 cell line has been established from tumor which obtained through prospective study

Expected Contribution
we could improve the prognosis of adult STS patient by establishing standardized and organised clinical data. And We have first-round molecular characteristics for complex karyotype soft tissue sarcoma with tissues from 14 patients. Three groups were suggested and might be related to prognostics for STS malignancy. Continuous research with samples from prospective study will promise precise suggestion for malignant STS therapeutics in the future

(출처 : SUMMARY 3p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 국문요약문 ... 2
• SUMMARY ... 3
• 목차 ... 4
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 5
• 가. 연구개발의 목적 ... 5
• 나. 연구개발의 필요성 ... 5
• 2. 연구수행 내용 및 결과 ... 5
• 가. 1세부과제 ... 5
• 나. 2세부과제 ... 7
• 3. 연구결과의 중요성 및 활용 방안 ... 9
• 가. 연구결과의 의미 ... 9
• 나. 연구결과의 중요성 ... 10
• 다. 추가연구의 필요성 ... 10
• 4. 연구수행 달성도 ... 11
• 5. 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 11
• 6. 참여연구원 현황 ... 12
• 7. 기타사항 ... 13
• 8. 참고문헌 ... 13
• II. 제1세부과제 ... 14
• 제1세부 최종 보고서 ... 15
• 국문 요약문 ... 16
• SUMMARY ... 17
• 목차 ... 18
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 19
• 2. 연구수행 내용 및 결과 ... 21
• 3. 연구결과의 중요성 및 활용 방안 ... 24
• 4. 연구수행 달성도 ... 25
• 5. 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 26
• 6. 참여연구원 현황 ... 26
• 7. 기타사항 ... 27
• 8. 참고문헌 ... 27
• II. 제2세부과제 ... 28
• 제2세부 최종 보고서 ... 30
• 국문 요약문 ... 31
• SUMMARY ... 32
• 목차 ... 33
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 34
• 2. 연구수행 내용 및 결과 ... 35
• 3. 연구결과의 중요성 및 활용 방안 ... 40
• 4. 연구수행 달성도 ... 41
• 5. 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 41
• 6. 참여연구원 현황 ... 42
• 7. 기타사항 ... 43
• 8. 참고문헌 ... 43
• 끝페이지 ... 43