초록 ▼

4. 당해년도 연구결과 요약
○ 제1세부과제명: 소의 원인미상 질병내 세균성 원인체 검색관련 대표 시료 선발 및 진단매널 평가(중점)
- 이 과제에서의 소의 원인미상 질병은 유산과 기립불능(신경계) 질병으로 각종 검사결과 질병 원인이 구명되지 않은 것을 의미함
- 유산관련 개체는 병리검사, 원인체검사 등의 실험실검사를 종합 분석한 결과 유산 원인이 구명되지 않은 그룹과 정상을 포함하여 7개 그룹으로 분류하여 총 34 개체를 선발하여 제2세부과제(용역기관)로 제공하였음(제공 시료: 태아 장기 조직, 위액, 흉수, 모축

4. 당해년도 연구결과 요약
○ 제1세부과제명: 소의 원인미상 질병내 세균성 원인체 검색관련 대표 시료 선발 및 진단매널 평가(중점)
- 이 과제에서의 소의 원인미상 질병은 유산과 기립불능(신경계) 질병으로 각종 검사결과 질병 원인이 구명되지 않은 것을 의미함
- 유산관련 개체는 병리검사, 원인체검사 등의 실험실검사를 종합 분석한 결과 유산 원인이 구명되지 않은 그룹과 정상을 포함하여 7개 그룹으로 분류하여 총 34 개체를 선발하여 제2세부과제(용역기관)로 제공하였음(제공 시료: 태아 장기 조직, 위액, 흉수, 모축혈청, 태반, 생식기 분비물)
- 기립불능관련 개체는 병리검사, 원인체검사 등의 실험실검사를 종합 분석한 결과 신경계질병 원인이 구명되지 않은 그룹을 포함하여 5개 그룹으로 분류하여 총 24개체를 선발하여 제2세부과제(용역기관)로 제공하였음(제공 시료: 전뇌, 중뇌, 후뇌, 소뇌, 뇌간, 편도, 림프절)
※ 정상 개체(도축장 출하축)는 2개 그룹 12개체를 선발하여 제2세부과제(용역기관)로 제공하였음(제공 시료: 전뇌, 중뇌, 후뇌, 소뇌, 뇌간, 편도, 림프절)

○ 제2세부과제명: 소의 원인미상 질병내 세균성 원인체 검색을 위한 차세대염기서열 분석 및 진단 마커 부위 조사(용역)
- 기존에 알려진 소의 유산 및 뇌염을 일으키는 세균과 인수공통 기회감염성 세균들을 목록화하였음
※ 정기적으로 업데이트할 예정이며 연구설계에는 포함되어 있지 않지만 곰팡이와 독소도 추가하여 연구를 진행하고자 함
. 소 유산 유발 세균 및 곰팡이 병원체: 각각 10종, 2종
. 소 유산 유발 세균 및 곰팡이 독소: 각각 7종의 11개 독소, 4종의 5개 독소
. 소 기립불능 유발 세균 및 곰팡이 병원체: 각각 7종, 4종
. 소 기립불능 유발 세균 및 곰팡이 독소: 각각 5종의 6개 독소, 5종의 9개 독소
- NGS 분석을 위한 시료 전처리법을 1차적으로 확립하였고 시료 상태에 따라 계속 개선할 예정임
. 시료 소독, 핵산추출, 라이브러리 제작 및 sequence data quality 등 단계별로 기존의 방법을 개선하였음
- 현재까지 유산 및 기립불능 도축장 정상시료 총 54개체를 분석함
. 조직소견상 세균 감염성 질병이 의심되는 소 유사산 시료 9건(조직별 23건)
. 조직소견상 세균 감염성 질병이 의심되는 소 기립불능 시료 8건(조직별 52건)
. 조직소견상 정상인 소 유사산 시료 22건(조직별 76건)
. 조직소견상 정상인 소 기립불능 시료 13건(조직별 40건)
. 도축장 정상 시료 2건(조직별 10건)
- 송치 정상 소와 유산태아 정상 및 비정상 소의 뇌를 대상으로 미생물 군집을 분석한 결과 유산태아 비정상 소의 미생물 다양도와 풍부도가 높은 것을 확인할 수 있었고 pathogenic bacteria의 비율이 높은 것으로 확인
- 송치 정상과 유산태아 정상 구분 지을 가능성을 가진 미생물로는 Carnobacterium, Unclassified. Moraxellaceae가 확인되었으며 송치 정상과 유산태아 비정상을 구분 지을 가능성을 가진 미생물로는 Enterococcus가 확인
- 도축장 정상 소와 기립불능우 정상 및 비정상의 뇌를 대상으로 미생물 군집을 분석한 결과도축장 정상소의 미생물 다양도와 풍부도가 높은 것을 확인할 수 있었으며 pathogenic bacteria의 비율이 낮은 것으로 확인
- 도축장 정상과 기립불능우 정상을 구분 지을 가능성을 가진 미생물로는 Carnobacterium, Unclassified. Moraxellaceae가 확인되었고 도축장 정상과 기립불능우 비정상을 구분 지을 가능성을 가진 미생물로는 Fusobacterium, Porphyromonas가 확인
- 송치 정상 소와 유산태아 정상 및 비정상 소의 위액, 태반, 흉수, 간 조직을 대상으로 미생물 군집을 분석한 결과 유산태아 비정상의 태반 조직에서 미생물 다양성이 감소하였지만 유산태아 비정상의 다른 모든 조직에서는 미생물 다양도 및 풍부도가 높은 것을 확인하였으며 송치 정상, 유산태아 정상, 유산태아 비정상의 각 조직의 pathogenic bacteria 비율을 확인하였을 때 태반과 간에서 유산태아 비정상 소의 pathogenic bacteria의 비율이 높은 것을 확인
- 송치 정상, 유산태아 정상을 구분 지을 가능성을 가진 genus는 위액에서 Propionibacterium, 흉수에서 Leuconostoc, 간에서 Propionibacterium, Streptococcus, Pseudomonas, Unclassified. Enterobacteriaceae, Unclassified.Moraxellaceae, Unclassified Pseudomonadaceae 이었으며 송치 정상과 유산태아 비정상을 구분지을 가능성을 가진 genus는 위액에서 Arthrobacter, 흉수에서 Unclassified.Rumincoccaceae, 간에서 Propionibacterium, Enterococcus인 것으로 확인
- Botulinum균 독소 검출결과 독소를 분비하는 대상균주에 대해 모두 음성임을 확인
- 유사산 및 기립불능 소 시료에 대해 곰팡이 배양 실험 결과 모두 음성임을 확인
- 향후 더 많은 개체 시료와 메타지노믹스와 바이오인포막틱스 기법을 추가 적용하여 후보 병원성 세균 검색을 실시할 예정임

(출처 : 4. 당해년도 연구결과 요약 2p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• I. 연구배경 및 목표 ... 4
• 1. 연구배경 ... 4
• 2. 연구최종목표 ... 5
• 3. 연차별 연구개발 목표 및 내용 ... 5
• II. 연구방법 및 수행전략 ... 6
• 1. 재 료 ... 6
• 2. 연구전략 및 방법 ... 6
• III. 연구결과 ... 7
• 1. 제1세부과제명: 소의 원인미상 질병내 세균성 원인체 검색관련 대표 시료 선발 및 진단패널 평가 ... 7
• 2. 제2세부과제명: 소의 원인미상 질병내 세균성 원인체 검색을 위한 차세대염기서열 분석 및 진단 마커 부위 조사 ... 12
• IV. 연구결과요약 ... 26
• 1. 제1부과제명: 소의 원인미상 질병내 세균성 원인체 검색관련 대표 시료 선발 및 진단패널 평가(중점) ... 26
• 2. 제2세부과제명: 소의 원인미상 질병내 세균성 원인체 검색을 위한 차세대염기서열 분석 및 진단 마커 부위 조사(용역) ... 26
• V. 금후 추진계획 ... 28
• VI. 참고자료 ... 28
• 끝페이지 ... 30