초록 ▼

□ 연구의 목적 및 내용
○ 연구 개발 목표
: 유방암, 난소암의 차세대 염기서열 데이터를 이용하여 항암치료 약물 저항성 기전 이해 및 효과적인 약물 발굴
○ 연구 내용
- 백금저항성 난소암 환자의 맞춤별 치료방침을 위한 유전체 데이터 생산
- 약물치료 암환자의 코호트를 구성하고 차세대 염기서열 (WES, RNA-Seq) 데이터 생산 및 멀티오믹스 분석 시도
- 약물반응 관련 유전체 마커 발굴
- 분자유전학적 수준에서 암유전체 특성을 규명하고 이를 이용 항암치료 약물 반응 예측 모델 개발 및 진

□ 연구의 목적 및 내용
○ 연구 개발 목표
: 유방암, 난소암의 차세대 염기서열 데이터를 이용하여 항암치료 약물 저항성 기전 이해 및 효과적인 약물 발굴
○ 연구 내용
- 백금저항성 난소암 환자의 맞춤별 치료방침을 위한 유전체 데이터 생산
- 약물치료 암환자의 코호트를 구성하고 차세대 염기서열 (WES, RNA-Seq) 데이터 생산 및 멀티오믹스 분석 시도
- 약물반응 관련 유전체 마커 발굴
- 분자유전학적 수준에서 암유전체 특성을 규명하고 이를 이용 항암치료 약물 반응 예측 모델 개발 및 진단 유전자 발굴
- 임상시험 프로토콜 수립을 위한 진단 유전자 제시

□ 연구개발성과
< 정성적 성과 >
- 난소암 환자의 치료 성적에 따른 분자적 차이를 확인하기 위한 유전체 데이터 생성 (WES/ RNA seq: 30례 pair 생성, 25례 생성 진행 중)
- 삼중음성유방암 분류 방법 구축 및 약물 반응 관련 시그니처 확보
- Cisplatin 약물 반응 관련 마커 도출, 해당 마커의 Knockout을 처리한 내성 세포주 자원확보

□ 연구개발성과의 활용계획 (기대효과)
○ NGS 데이터 생성 표준 SOP 확립
- 환자 유전체 데이터의 축적 및 암 기초 연구의 활성화
○ 백금저항성 난소암의 유전 데이터축적
- 새로운 신약 항암치료 타겟발굴 연구
○ 알고리즘 개발 및 고도화
- 전체 난소암 환자에서 실현 가능한 알고리듬 제안
○ 조직화된 임상시험의 활성화 기본 마련 및 정밀의학 실천의 선제적 대응을 위한 기반 마련
○ 백금저항성의 메커니즘의 규명을 통한 신약임상시험 프로토콜 배경 제시
○ 국립암센터의 유전체 서비스에 도입하여 사업화 및 국가표준 정책을 확보하는데 기여할 수 있음
○ 계산 생물학 기반의 약물 반응 예측을 통한 전임상 연구 효율 증대
- 아류형 및 pathway에 따른 후보 약물의 압축
- 삼중음성 유방암의 약물 반응 구체화
○ 유전체 소인 관련 마커 발굴을 통한 새로운 진단 제시
- Cisplatin 약물 내성 기전을 통한 새로운 표적 발굴 가능
- 약물 내성 재현을 위한 세포주 활용 가능

(출처 : 국문 요약문 2p)

Abstract ▼

□ Purpose&Contents
○ Purpose
- Understanding the mechanism of resistance to chemotherapy drugs and discovering the effective drugs using next-generation sequencing data of breast and ovarian cancer
○ Contents
- Genomic data generation to identify molecular differences according to treatm

□ Purpose&Contents
○ Purpose
- Understanding the mechanism of resistance to chemotherapy drugs and discovering the effective drugs using next-generation sequencing data of breast and ovarian cancer
○ Contents
- Genomic data generation to identify molecular differences according to treatment outcomes of ovarian cancer patients (WES/RNA seq.)
- Next-generation sequencing dataset generation and multi-omics data analysis for neo-adjuvant therapy patients
- Marker identification associated with drug-response
- Anti-cancer drug response prediction model and associated gene development from cancer genomic data and molecular characteristics analysis
- Marker gene identification for diagnosis and clinical trial development

□ Results
O Publication
- 2 SCI journal publication (IF 4.8, Molecular Cancer Research 2020 & IF 1.914, Yonsei Medical Journal 2020)
- 1 program development for TNBC molecular subtype (Bioconductor 2019)
O Others
- Genomic data generation to identify molecular differences according to treatment outcomes of ovarian cancer patients (WES/RNA seq: 30 pairs are generated, 25 cases are in progress)
- BRCA1/2 gene test was performed in 41 of 55 patients, BRCA1 pathogenic variant (PV) was found in 17.1% (7/41) and BRCA2 PV in 7.3% (3/41).
- Cell lines to induce cisplatin-resistant (Knock-out)
- Novel cisplatin-resistant marker identification for TNBC patients
- Cisplatin-resistant gene signature for diagnosis

□ Expected Contribution
○ Establishment of standard operating procedure (SOP) for next generation sequencing (NGS) data generation
- Accumulation of genome data for patient and activation of basic cancer research
○ Accumulation of genetic data for platinum-resistant ovarian cancer
- Discovery of new drug anticancer treatment target
○ Algorithm development and advancement
- Algorithm proposal that can be realized in all ovarian cancer patients
○ Establish the basis for revitalization of organized clinical trials and the foundation for preemptive response to the practice of precision medicine
○ Present the background of the new drug clinical trial protocol through the identification of the mechanism of platinum resistance
○ Contribute to commercialization and securing national standard policy by introducing it into the genomic analysis service of the National Cancer Center.
○ Preclinical research improvement by computational method-based drug response prediction
- Candidate drug extraction from cancer subtype and related pathway analysis
- Drug response and associated marker identification from triple-negative breast cancer patients
○ New diagnostic marker identification
- Novel target development for cisplatin-resistant patient
- Novel cell line resource to support drug-resistant

(출처 : SUMMARY 4p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 국문 요약문 ... 2
• SUMMARY ... 4
• 목차 ... 6
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 7
• 2. 연구수행 내용 및 결과 ... 9
• (1) 삼중음성유방암의 유전체 연구 ... 10
• (2) 전사체 정보를 활용한 약물 반응 예측 모델 ... 10
• (3) TNBC 암센터 코호트 데이터 분석 ... 11
• (4) 약물 내성 마커 실험 ... 12
• (5) 난소암 암센터 코호트_1세부 ... 13
• (6) 난소암 암센터 코호트 데이터 분석_2세부 ... 14
• 3. 연구결과의 중요성 및 활용 방안 ... 15
• 4. 연구수행 달성도 ... 15
• 5. 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 16
• 6. 참여연구원 현황 ... 16
• 7. 기타사항 ... 17
• 8. 참고문헌 ... 18
• II. 제1세부과제 ... 19
• 제1세부 최종 보고서 ... 20
• 국문 요약문 ... 21
• SUMMARY ... 23
• 목차 ... 25
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 26
• 2. 연구수행 내용 및 결과 ... 28
• 3. 연구결과의 중요성 및 활용 방안 ... 30
• 4. 연구수행 달성도 ... 30
• 5. 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 30
• 6. 참여연구원 현황 ... 31
• 7. 기타사항 ... 31
• 8. 참고문헌 ... 31
• II. 제2세부과제 ... 33
• 제2세부 최종 보고서 ... 34
• 국문 요약문 ... 35
• SUMMARY ... 36
• 목차 ... 37
• 1. 연구개발과제의 개요 ... 38
• 2. 연구수행 내용 및 결과 ... 39
• 3. 연구결과의 중요성 및 활용 방안 ... 45
• 4. 연구수행 달성도 ... 46
• 5. 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 46
• 6. 참여연구원 현황 ... 46
• 7. 기타사항 ... 47
• 끝페이지 ... 47