초록 ▼

1. 감귤 웅성 불임 형질 관련: ① 감귤 교배집단에 대한 웅성불임 표현형 분석. ② 제주재래귤 진귤의 미토콘드리아 유전체 완전 해독. ③ 고밀도 SNP 연관지도 작성. ④ 감귤의 웅성기관 발달 관여 유전자 발굴. ⑤ 웅성불임의 분자기작 이해를 위한 전사체 분석.
2. 감귤 부피 및 과일 크기 형질 관련: ① 감귤 교배집단에 대한 부피 형질 표현형 분석. ② 감귤 부피 현상의 분자기작 이해를 위한 전사체 분석.
3. 감귤 홍피 형질 관련: ① 감귤 교배집단의 과실 표현형 및 유전력 분석. ② 카로티노이드/플라보노이드 생합

1. 감귤 웅성 불임 형질 관련: ① 감귤 교배집단에 대한 웅성불임 표현형 분석. ② 제주재래귤 진귤의 미토콘드리아 유전체 완전 해독. ③ 고밀도 SNP 연관지도 작성. ④ 감귤의 웅성기관 발달 관여 유전자 발굴. ⑤ 웅성불임의 분자기작 이해를 위한 전사체 분석.
2. 감귤 부피 및 과일 크기 형질 관련: ① 감귤 교배집단에 대한 부피 형질 표현형 분석. ② 감귤 부피 현상의 분자기작 이해를 위한 전사체 분석.
3. 감귤 홍피 형질 관련: ① 감귤 교배집단의 과실 표현형 및 유전력 분석. ② 카로티노이드/플라보노이드 생합성 유전자 발굴과 qPCR 프라이머 확보.
4. 제주재래귤의 유전 다양성 분석 관련: ① 제주재래귤의 유전다양성 평가 및 엽록체 기반 In/Del, SSR 마커 발굴. ② 제주재래귤 11종의 엽록체 유전체 완전 해독.

(출처 : 요약서 3p)

Abstract ▼

Purpose&Contents
Establishment of MAS program in citrus based on the phenotypic and genetic analysis of F₁ population and the development of trait-related DNA markers

Results
1. Trait related to male sterility in citrus
∙ Phenotypic analysis of male sterility trait using

Purpose&Contents
Establishment of MAS program in citrus based on the phenotypic and genetic analysis of F₁ population and the development of trait-related DNA markers

Results
1. Trait related to male sterility in citrus
∙ Phenotypic analysis of male sterility trait using a citrus F₁ population(Citrus hybrid 'Kiyomi'xC. sunki) revealed that the trait is likely controlled by either multiple loci or cytoplasmic male sterility system.
∙ In order to reveal the cytoplasmic male sterility system in citrus, we determined the complete mitochondrial (mt) genome sequence of C. sunki that is a male sterile landrace. The mt genome was consisted of 2 chromosomes.
∙ In order to construct high resolution of linkage map, we performed genotyping-by-sequencing on the aforementioned F₁ population and constructed a high resolution of linkage map consisted of 2,182 SNP markers.
∙ Mining of Arabidopsis functional homologs related to the development of male organ from citrus genomes. To better understand the underlying molecular mechanism of the male sterility in citrus, we performed comparative transcriptome analysis of flower samples at before and after anthesis stages of Citrus hybrid 'Kiyomi' (male sterile) and C. sunki (male fertile) and found the changed gene expression of negative/positive regulators involved in anther development.

2. Traits related to fruit peel creasing/cracking or fruit size in citrus
∙ Phenotypic analysis of fruit peel creasing/cracking trait using the aforementioned F₁ population revealed that the trait is controlled by quantitative trait loci.
∙ Development of putative SCAR markers related to fruit peel creasing/cracking trait using the aforementioned F₁ population.
∙ Mining of fruit peel creasing/cracking-like genes from citrus genomes (ex, starch-branching enzyme) and sequence variation analysis.
∙ To better understand the underlying molecular mechanism of fruit peel creasing/cracking phenomenon in citrus, we performed comparative transcriptome analysis of fruit and fruit peel samples at ripening stage of Citrus hybrid 'Kiyomi' (non-puffy) and C. sunki (puffy) and found the changed expression of cell wall, sugar/water transport, photosynthesis, phytohormone response/biosynthesis-related genes.
∙ Mining of fruit size regulator-like genes from citrus genomes (ex, fasciated) and sequence variation analysis.

Results
3. Trait related to fruit peel color in citrus
∙ Phenotype and heritability analysis of six F₁ populations related to fruit peel color.
∙ Minining of carotenoid/flavonoid biosynthetic and regulatory genes from citrus genomes and establishment of primer sets for qRT-PCR analysis. Analysis of sequence variation in carotenoid biosynthesis genes among citrus resources.
∙ qRT-PCR analysis of carotenoid biosynthesis genes using parents and F₁ progenies derived from F₁ populations related to fruit peel color.
4. Analysis on the genetic diversity of citrus landraces in Jeju
∙ Development of plastid genome-based InDel and nuclear/chloroplast SSR markers for the analysis of genetic diversity of citrus landraces.
Evaluation of the genetic diversity of two citrus landraces, C. grandis and C. sunki.
∙ Determination of the complete chloroplast genome sequences of 11 citrus landraces in Jeju.

Expected Contribution
∙ Development of major trait-related molecular markers based on the genetic analysis of F₁ segregating population and construction of high resolution of genetic map, and application to establishment of molecular breeding system for the early selection of elite lines using molecular markers.
∙ The early selection of elite lines using major trait-related molecular markers and establishment of MAS breeding system in citrus.

(출처 : Summary 5p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제출문 ... 2
• 보고서 요약서 ... 3
• 국 문 요 약 문 ... 4
• Summary ... 5
• 목차 ... 7
• 제 1 장 연구 개발 과제의 개요 ... 8
• 제1.1절 연구 개발 목적 ... 8
• 제1.2절 연구 개발의 필요성 ... 8
• 제1.3절 연구 개발 범위 ... 12
• 제 2 장 연구 수행 내용 및 결과 ... 13
• 2-1. 연구 수행 내용 ... 13
• 2-2. 연구 수행 결과 ... 13
• 1. 웅성불임 형질 관련 ... 13
• 2. 부피 및 과일 크기 형질 관련 ... 26
• 3. 홍피 형질 관련 ... 34
• 4. 제주재래귤의 유전 다양성 분석 관련 ... 47
• 제 3 장 목표달성도 및 관련분야 기여도 ... 54
• 제3.1절 목표대비 달성도 ... 54
• 제3.2절 정량적 성과(논문게재, 특허출원, 기타) ... 55
• 제 4 장 연구 결과의 활용 계획 ... 56
• 제 5 장 연구 개발 결과의 보안 등급 ... 58
• 제 6 장 연구시설·장비종합정보시스템에 등록한 연구시설·장비 현황 ... 59
• 제 7 장 연구개발과제의 대표적 연구실적 ... 60
• 제 8 장 기타사항 ... 61
• 제 9 장 참고문헌 ... 62
• 끝페이지 ... 64