초록 ▼

연구 목적
급성골수성백혈병(Acute myeloid leukemia, AML) 환자에서 전향적 코호트 구축 및 재발이나 불응성을 보이는 경우 표적 바이오마커를 발굴하고 예후 예측인자를 표출

연구방법
1. 급성골수성백혈병 환자 620명의 시료 및 임상자료 확보하여 코호트 구축
2. 확보한 시료에 대한 targeted DNA sequencing을 수행하여 염기서열 분석하고 질환과 연관이 있는 바이오마커 발굴
3. 재발 및 불응 시료에 대한 whole genome sequencing과 mRNA seque

연구 목적
급성골수성백혈병(Acute myeloid leukemia, AML) 환자에서 전향적 코호트 구축 및 재발이나 불응성을 보이는 경우 표적 바이오마커를 발굴하고 예후 예측인자를 표출

연구방법
1. 급성골수성백혈병 환자 620명의 시료 및 임상자료 확보하여 코호트 구축
2. 확보한 시료에 대한 targeted DNA sequencing을 수행하여 염기서열 분석하고 질환과 연관이 있는 바이오마커 발굴
3. 재발 및 불응 시료에 대한 whole genome sequencing과 mRNA sequencing을 수행하여 연구결과를 통합한 멀티오믹스 분석을 시도하고 치료의 적정성을 평가
4. 치료 반응에 따른 유전자 이상을 분석하고 데이터베이스화하여 맞춤형 진단 및 치료에 활용을 위한 통합형 유전체 데이터베이스 구축

결과
1. 급성골수성백혈병 환자에서 표적 바이오마커를 발굴하고 예후 예측인자를 표출하고자 5년간 시료 확보 및 임상정보를 수집하여 코호트를 구성하였음
2. 정상핵형 급성골수성백혈병 환자 시료를 대상으로 genomic classification의 유용성을 평가하였음
3. 이식을 포함한 치료 전 과정의 serial sample을 통한 somatic mutation 프로파일을 활용하여 clonal dynamics을 확인함
4. 9년 동안 재발과 관해를 반복한 환자 시료에서 remission clone의 존재를 확인하고 특히 chemotherapy 후 증가된 growth advantage를 보인다는 결과를 얻음
5. Core-binding factor AML 환자의 진단 및 관해 시료를 대상으로 MRD 측정 기술로서 RNA sequencing의 가능성을 확인함
6. 정상핵형 급성골수성백혈병 환자 시료를 대상으로 NGS 기반 Minimal Residual Disease(MRD)의 유무와 Consolidation therapy의 type에 따른 치료 결과를 평가함
7. 급성골수성백혈병 환자 시료 중 DNMT3A mutation을 가진 환자 시료를 대상으로 Single cell RNA sequencing을 하여 clonal hematopoiesis of intermediate potential(CHIP)을 연구함
8. 멀티오믹스 분석을 위해 whole genome sequencing과 whole transcriptome sequencing을 수행하였고 이를 치료 적정성을 평가하고자 활용하였음
9. 동종조혈모세포이식 613명의 HLA 유전체 유관 특정 감염병의 발생 분석 연구를 통해 한국인 고유의 유전체 특성을 파악함
10. t(8:21)을 가진 급성골수성백혈병 환자에서 치료 성적에 중요한 영향을 미치는 D816V KIT 유전자 변이형의 임상성적을 비교 분석함
11. 성인 급성골수성백혈병 환자에서의 동종조혈모세포이식 치료법을 모델로 장기간 추적하여 성과를 보인 모범적 전향적 비교 대조 연구의 수행 연구와 그 성과를 제시하였음
12. inv(16)를 가진 급성골수성백혈병를 대상으로 치료 성적에 중요한 영향을 미치는 D816V KIT 유전자 변이형 및 타 유형들을 임상성적 비교 분석함

(출처 : 요약문 4p)

Abstract ▼

Research Objective
Establishment of prospective cohort and identification of biomarkers specific for relapse in Acute myeloid leukemia

Research topics and scope
1. Establishment of cohort by longitudinal samples and clinical data of 620 patients with acute myeloid leukemia
2. Perform

Research Objective
Establishment of prospective cohort and identification of biomarkers specific for relapse in Acute myeloid leukemia

Research topics and scope
1. Establishment of cohort by longitudinal samples and clinical data of 620 patients with acute myeloid leukemia
2. Performing the targeted DNA sequencing to analyze sequence and identification of biomarkers specific for Acute myeloid leukemia
3. Evaluation of the treatment and multi-omics analysis by performing whole genome sequencing and mRNA sequencing
4. Development of integrated informatics system for diagnosis and treatment by analyzing genetic abnormalities

Research outcome
1. 1800 samples from 620 patients are collected and integrated database system combing clinical data are established
2. This study was performed to assess the recently recommended genomic classification system in acute myeloid leukemia with a normal karyotype
3. NGS-based posttransplant monitoring in AML patient was feasible and can distinguish high risk patients for relapse
4. To identify the distribution on cell lineages and dynamics of the remission clone, We performed amplicon sequencing of each cell fraction by sorting bulk cells and observed the growth potential of mutations after chemotherapeutic cycles
5. The clinical utility of RNA sequencing as a potential tool for MRD monitoring in fusion gene-driven AML with RUNX1-RUNX1T1 gene was demonstrated
6. We evaluated treatment outcomes according to the NGS based MRD status and type of consolidation therapy in NK-AML. Allogeneic HCT is supported in NK-AML patients with detectable MRD by NGS in CR1
7. Single cell RNA sequencing to explore Clonal hematopoiesis of intermediate potential(CHIP) in AML patients with DNMT3A mutation was performed
8. We performed whole genome sequencing and whole transcriptome sequencing for multi-omics analysis
9. This study showed that the seropositive donor HLA-DR*0901 allele in a haploidentical allo-HSCT setting, had a high correlation with the incidence of CMV-related disease and may be considered as risk markers for the selection of suitable donors
10. The differentiated prognostic impact of D816V KIT mutation among various KIT mutations and clarified optimal time points and thresholds for RUNX1–RUNX1T1 MRD monitoring in the setting of HSCT was demonstrated
11. This prospective study has demonstrated the equivalence of Haplo-HSCT using a unique RTC regimen with T-cell-replete PBSC compared with MUD-HSCT for AML in remission and validated pretransplant WT1 quantification as an MRD marker
12. The differentiated prognostic value of the D816V KIT mutation in AML with CBFB-MYH11 and clarified optimal time points and thresholds for CBFB-MYH11 MRD monitoring in the setting of HSCT was demonstrated

(source : Project Summary 6p)

목차 Contents

• 표지 ... 1
• 제 출 문 ... 2
• 목차 ... 3
• 요약문 ... 4
• Project Summary ... 6
• 총괄연구과제 연구결과 ... 8
• 1. 총괄연구과제의 최종 연구개발 목표 ... 8
• 2. 총괄연구과제의 최종 연구개발 내용 및 결과 ... 14
• 3. 총괄연구과제의 연구결과 고찰 및 결론 ... 23
• 4. 총괄연구과제의 연구성과 및 목표달성도 ... 26
• 5. 총괄연구과제의 활용계획 ... 40
• 6. 첨부서류 ... 42
• 제1세부연구과제 연구결과 ... 58
• 1. 제1세부연구과제의 최종 연구개발 목표 ... 59
• 2. 제1세부연구과제의 연구대상 및 방법 ... 63
• 3. 제1세부연구과제의 최종 연구개발결과 ... 65
• 4. 제1세부연구과제의 연구결과 고찰 및 결론 ... 79
• 5. 제1세부연구과제의 연구성과 및 목표달성도 ... 81
• 6. 제1세부연구과제의 활용계획 ... 82
• 7. 참고문헌 ... 82
• 제2세부연구과제 연구결과 ... 85
• 1. 제2세부연구과제의 최종 연구개발 목표 ... 86
• 2. 제2세부연구과제의 연구대상 및 방법 ... 90
• 3. 제2세부연구과제의 최종 연구개발결과 ... 92
• 4. 제2세부연구과제의 연구결과 고찰 및 결론 ... 97
• 5. 제2세부연구과제의 연구성과 및 목표달성도 ... 99
• 6. 제2세부연구과제의 활용계획 ... 100
• 7. 참고문헌 ... 100
• 끝페이지 ... 103